RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533665.1

PARP10-222, Transcript of poly(ADP-ribose) polymerase family member 10, human

TSL 1 (best)

Gene PARP10, Length 935 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARP10-222	ENST00000533665	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PARP10-222	ENST00000533665	ABCC9	O60706	1549 aa		36.47	■■■■□ 3.43
PARP10-222	ENST00000533665	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.14	■■■■□ 3.38
PARP10-222	ENST00000533665	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.5	■■■■□ 3.11
PARP10-222	ENST00000533665	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.44	■■■■□ 3.1
PARP10-222	ENST00000533665	NACAD	O15069	1562 aa		34.17	■■■■□ 3.06
PARP10-222	ENST00000533665	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.95	■■■■□ 3.03
PARP10-222	ENST00000533665	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PARP10-222	ENST00000533665	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.87	■■■■□ 3.01
PARP10-222	ENST00000533665	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PARP10-222	ENST00000533665	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PARP10-222	ENST00000533665	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PARP10-222	ENST00000533665	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PARP10-222	ENST00000533665	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PARP10-222	ENST00000533665	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PARP10-222	ENST00000533665	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PARP10-222	ENST00000533665	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PARP10-222	ENST00000533665	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.84
PARP10-222	ENST00000533665	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PARP10-222	ENST00000533665	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PARP10-222	ENST00000533665	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PARP10-222	ENST00000533665	CUX2	O14529	1486 aa		31.45	■■■□□ 2.62
PARP10-222	ENST00000533665	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.45	■■■□□ 2.62
PARP10-222	ENST00000533665	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PARP10-222	ENST00000533665	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PARP10-222	ENST00000533665	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PARP10-222	ENST00000533665	NES	P48681	1621 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PARP10-222	ENST00000533665	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.57
PARP10-222	ENST00000533665	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PARP10-222	ENST00000533665	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PARP10-222	ENST00000533665	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
PARP10-222	ENST00000533665	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.96	■■■□□ 2.55
PARP10-222	ENST00000533665	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.9	■■■□□ 2.54
PARP10-222	ENST00000533665	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.9	■■■□□ 2.54
PARP10-222	ENST00000533665	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.67	■■■□□ 2.5
PARP10-222	ENST00000533665	WIZ	O95785	1651 aa		30.62	■■■□□ 2.49
PARP10-222	ENST00000533665	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.55	■■■□□ 2.48
PARP10-222	ENST00000533665	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.51	■■■□□ 2.48
PARP10-222	ENST00000533665	WDR62	O43379	1518 aa		30.46	■■■□□ 2.47
PARP10-222	ENST00000533665	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.33	■■■□□ 2.45
PARP10-222	ENST00000533665	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.32	■■■□□ 2.44
PARP10-222	ENST00000533665	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.27	■■■□□ 2.44
PARP10-222	ENST00000533665	CFTR	P13569	1480 aa		30.17	■■■□□ 2.42
PARP10-222	ENST00000533665	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
PARP10-222	ENST00000533665	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.14	■■■□□ 2.42
PARP10-222	ENST00000533665	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	30.09	■■■□□ 2.41
PARP10-222	ENST00000533665	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PARP10-222	ENST00000533665	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PARP10-222	ENST00000533665	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PARP10-222	ENST00000533665	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
PARP10-222	ENST00000533665	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PARP10-222	ENST00000533665	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PARP10-222	ENST00000533665	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PARP10-222	ENST00000533665	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PARP10-222	ENST00000533665	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PARP10-222	ENST00000533665	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
PARP10-222	ENST00000533665	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.55	■■■□□ 2.32
PARP10-222	ENST00000533665	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.55	■■■□□ 2.32
PARP10-222	ENST00000533665	CHD1	O14646	1710 aa		29.51	■■■□□ 2.31
PARP10-222	ENST00000533665	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
PARP10-222	ENST00000533665	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PARP10-222	ENST00000533665	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.43	■■■□□ 2.3
PARP10-222	ENST00000533665	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.36	■■■□□ 2.29
PARP10-222	ENST00000533665	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PARP10-222	ENST00000533665	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PARP10-222	ENST00000533665	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PARP10-222	ENST00000533665	FBLN2	P98095	1184 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PARP10-222	ENST00000533665	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PARP10-222	ENST00000533665	SOGA1	O94964	1423 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PARP10-222	ENST00000533665	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PARP10-222	ENST00000533665	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PARP10-222	ENST00000533665	CUX1	P39880	1505 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PARP10-222	ENST00000533665	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PARP10-222	ENST00000533665	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PARP10-222	ENST00000533665	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PARP10-222	ENST00000533665	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PARP10-222	ENST00000533665	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PARP10-222	ENST00000533665	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PARP10-222	ENST00000533665	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PARP10-222	ENST00000533665	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PARP10-222	ENST00000533665	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PARP10-222	ENST00000533665	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PARP10-222	ENST00000533665	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PARP10-222	ENST00000533665	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PARP10-222	ENST00000533665	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PARP10-222	ENST00000533665	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PARP10-222	ENST00000533665	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PARP10-222	ENST00000533665	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PARP10-222	ENST00000533665	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PARP10-222	ENST00000533665	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PARP10-222	ENST00000533665	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.54	■■■□□ 2.16
PARP10-222	ENST00000533665	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PARP10-222	ENST00000533665	NUP160	Q12769	1436 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PARP10-222	ENST00000533665	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PARP10-222	ENST00000533665	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PARP10-222	ENST00000533665	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PARP10-222	ENST00000533665	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PARP10-222	ENST00000533665	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PARP10-222	ENST00000533665	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.12
PARP10-222	ENST00000533665	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.23	■■■□□ 2.11

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