RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.86■■■■□ 3.97
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.57■■■■□ 3.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.69■■■■□ 3.14
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCC9O60706 1549 aa34.37■■■■□ 3.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NACADO15069 1562 aa33.33■■■□□ 2.93
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.31■■■□□ 2.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.24■■■□□ 2.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.12■■■□□ 2.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.92■■■□□ 2.86
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.57■■■□□ 2.81
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SCRIBQ14160 1630 aa32.26■■■□□ 2.76
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.24■■■□□ 2.75
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.11■■■□□ 2.73
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.01■■■□□ 2.71
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.28■■■□□ 2.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.21■■■□□ 2.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMARCA4P51532 1647 aa30.95■■■□□ 2.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.94■■■□□ 2.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMARCA2P51531 1590 aa30.75■■■□□ 2.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.72■■■□□ 2.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.68■■■□□ 2.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NCAPD3P42695 1498 aa30.67■■■□□ 2.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.66■■■□□ 2.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HMGXB3Q12766 1538 aa30.63■■■□□ 2.49
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WIZO95785 1651 aa30.36■■■□□ 2.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.92■■■□□ 2.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NESP48681 1621 aa29.78■■■□□ 2.36
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.73■■■□□ 2.35
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ERCC6Q03468 1493 aa29.68■■■□□ 2.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.66■■■□□ 2.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CFTRP13569 1480 aa29.64■■■□□ 2.34
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.62■■■□□ 2.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRDM2Q13029 1718 aa29.62■■■□□ 2.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.58■■■□□ 2.33
GMDS-AS1-211ENST00000533653 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CUX2O14529 1486 aa29.42■■■□□ 2.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.41■■■□□ 2.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.4■■■□□ 2.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.33■■■□□ 2.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WDR62O43379 1518 aa29.29■■■□□ 2.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCC8Q09428 1581 aa29.06■■■□□ 2.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.01■■■□□ 2.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TOPBP1Q92547 1522 aa28.97■■■□□ 2.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CUX1P39880 1505 aa28.79■■■□□ 2.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IFT140Q96RY7 1462 aa28.78■■■□□ 2.2
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXD1Q16676 465 aa28.74■■■□□ 2.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.68■■■□□ 2.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.66■■■□□ 2.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TOP2BQ02880 1626 aa28.65■■■□□ 2.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WDR97A6NE52 1622 aa28.62■■■□□ 2.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYNJ1O43426 1573 aa28.58■■■□□ 2.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SOGA1O94964 1423 aa28.54■■■□□ 2.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.5■■■□□ 2.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.45■■■□□ 2.15
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.37■■■□□ 2.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PBRM1Q86U86 1689 aa28.32■■■□□ 2.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRIN2BQ13224 1484 aa28.27■■■□□ 2.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.27■■■□□ 2.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.19■■■□□ 2.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.18■■■□□ 2.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHD1O14646 1710 aa28.18■■■□□ 2.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.15■■■□□ 2.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYNJ2O15056 1496 aa28.1■■■□□ 2.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAMTS12P58397 1594 aa28.08■■■□□ 2.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF27Q86VH2 1401 aa28.05■■■□□ 2.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OSCARQ8IYS5 282 aa28.04■■■□□ 2.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.97■■■□□ 2.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CUL7Q14999 1698 aa27.97■■■□□ 2.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRIN2AQ12879 1464 aa27.92■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM41Q8WV44 630 aa27.92■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBLN2P98095 1184 aa27.9■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.88■■■□□ 2.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGF1RP08069 1367 aa27.84■■■□□ 2.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.81■■■□□ 2.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUP160Q12769 1436 aa27.8■■■□□ 2.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEP170Q5SW79 1584 aa27.77■■■□□ 2.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGEF11O15085 1522 aa27.71■■■□□ 2.03
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.7■■■□□ 2.03
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.7■■■□□ 2.03
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.7■■■□□ 2.03
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