RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533571.1

MTCH2-204, Transcript of mitochondrial carrier 2, human

TSL 2

Gene MTCH2, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTCH2-204	ENST00000533571	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.78	■■■■□ 3.8
MTCH2-204	ENST00000533571	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.51	■■■■□ 3.11
MTCH2-204	ENST00000533571	ABCC9	O60706	1549 aa		33.8	■■■■□ 3
MTCH2-204	ENST00000533571	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MTCH2-204	ENST00000533571	NACAD	O15069	1562 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MTCH2-204	ENST00000533571	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MTCH2-204	ENST00000533571	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MTCH2-204	ENST00000533571	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
MTCH2-204	ENST00000533571	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MTCH2-204	ENST00000533571	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MTCH2-204	ENST00000533571	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MTCH2-204	ENST00000533571	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.5	■■■□□ 2.63
MTCH2-204	ENST00000533571	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.43	■■■□□ 2.62
MTCH2-204	ENST00000533571	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.36	■■■□□ 2.61
MTCH2-204	ENST00000533571	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.25	■■■□□ 2.59
MTCH2-204	ENST00000533571	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30.64	■■■□□ 2.5
MTCH2-204	ENST00000533571	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.5	■■■□□ 2.47
MTCH2-204	ENST00000533571	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		30.5	■■■□□ 2.47
MTCH2-204	ENST00000533571	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.22	■■■□□ 2.43
MTCH2-204	ENST00000533571	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.07	■■■□□ 2.4
MTCH2-204	ENST00000533571	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.05	■■■□□ 2.4
MTCH2-204	ENST00000533571	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.97	■■■□□ 2.39
MTCH2-204	ENST00000533571	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		29.93	■■■□□ 2.38
MTCH2-204	ENST00000533571	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.9	■■■□□ 2.38
MTCH2-204	ENST00000533571	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.86	■■■□□ 2.37
MTCH2-204	ENST00000533571	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.85	■■■□□ 2.37
MTCH2-204	ENST00000533571	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.81	■■■□□ 2.36
MTCH2-204	ENST00000533571	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
MTCH2-204	ENST00000533571	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.53	■■■□□ 2.32
MTCH2-204	ENST00000533571	WIZ	O95785	1651 aa		29.49	■■■□□ 2.31
MTCH2-204	ENST00000533571	CUX2	O14529	1486 aa		29.36	■■■□□ 2.29
MTCH2-204	ENST00000533571	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
MTCH2-204	ENST00000533571	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.15	■■■□□ 2.26
MTCH2-204	ENST00000533571	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.14	■■■□□ 2.26
MTCH2-204	ENST00000533571	NES	P48681	1621 aa		29.14	■■■□□ 2.26
MTCH2-204	ENST00000533571	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MTCH2-204	ENST00000533571	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		28.93	■■■□□ 2.22
MTCH2-204	ENST00000533571	CFTR	P13569	1480 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MTCH2-204	ENST00000533571	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MTCH2-204	ENST00000533571	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MTCH2-204	ENST00000533571	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
MTCH2-204	ENST00000533571	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.68	■■■□□ 2.18
MTCH2-204	ENST00000533571	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MTCH2-204	ENST00000533571	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MTCH2-204	ENST00000533571	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MTCH2-204	ENST00000533571	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
MTCH2-204	ENST00000533571	WDR62	O43379	1518 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MTCH2-204	ENST00000533571	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MTCH2-204	ENST00000533571	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
MTCH2-204	ENST00000533571	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.28	■■■□□ 2.12
MTCH2-204	ENST00000533571	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.23	■■■□□ 2.11
MTCH2-204	ENST00000533571	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.2	■■■□□ 2.11
MTCH2-204	ENST00000533571	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.08	■■■□□ 2.09
MTCH2-204	ENST00000533571	CUX1	P39880	1505 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MTCH2-204	ENST00000533571	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
MTCH2-204	ENST00000533571	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MTCH2-204	ENST00000533571	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		27.95	■■■□□ 2.06
MTCH2-204	ENST00000533571	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MTCH2-204	ENST00000533571	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MTCH2-204	ENST00000533571	SOGA1	O94964	1423 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTCH2-204	ENST00000533571	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.83	■■■□□ 2.04
MTCH2-204	ENST00000533571	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
MTCH2-204	ENST00000533571	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
MTCH2-204	ENST00000533571	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MTCH2-204	ENST00000533571	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MTCH2-204	ENST00000533571	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MTCH2-204	ENST00000533571	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03	2e-7	■■■■■ 30
MTCH2-204	ENST00000533571	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MTCH2-204	ENST00000533571	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTCH2-204	ENST00000533571	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
MTCH2-204	ENST00000533571	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MTCH2-204	ENST00000533571	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MTCH2-204	ENST00000533571	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MTCH2-204	ENST00000533571	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.56	■■■□□ 2
MTCH2-204	ENST00000533571	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.56	■■■□□ 2
MTCH2-204	ENST00000533571	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.55	■■■□□ 2
MTCH2-204	ENST00000533571	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.51	■■■□□ 2
MTCH2-204	ENST00000533571	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MTCH2-204	ENST00000533571	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MTCH2-204	ENST00000533571	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.46	■■□□□ 1.99
MTCH2-204	ENST00000533571	CHD1	O14646	1710 aa		27.42	■■□□□ 1.98
MTCH2-204	ENST00000533571	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.39	■■□□□ 1.98
MTCH2-204	ENST00000533571	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.36	■■□□□ 1.97
MTCH2-204	ENST00000533571	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.35	■■□□□ 1.97
MTCH2-204	ENST00000533571	FBLN2	P98095	1184 aa		27.32	■■□□□ 1.96
MTCH2-204	ENST00000533571	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.31	■■□□□ 1.96
MTCH2-204	ENST00000533571	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.27	■■□□□ 1.96
MTCH2-204	ENST00000533571	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.24	■■□□□ 1.95
MTCH2-204	ENST00000533571	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.24	■■□□□ 1.95
MTCH2-204	ENST00000533571	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	27.21	■■□□□ 1.95
MTCH2-204	ENST00000533571	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.21	■■□□□ 1.95
MTCH2-204	ENST00000533571	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.2	■■□□□ 1.95
MTCH2-204	ENST00000533571	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.2	■■□□□ 1.95
MTCH2-204	ENST00000533571	IGF1R	P08069	1367 aa		27.15	■■□□□ 1.94
MTCH2-204	ENST00000533571	NUP160	Q12769	1436 aa		27.12	■■□□□ 1.93
MTCH2-204	ENST00000533571	CUL7	Q14999	1698 aa		27.07	■■□□□ 1.92
MTCH2-204	ENST00000533571	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.05	■■□□□ 1.92
MTCH2-204	ENST00000533571	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		26.97	■■□□□ 1.91
MTCH2-204	ENST00000533571	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		26.94	■■□□□ 1.9
MTCH2-204	ENST00000533571	SHROOM2	Q13796	1616 aa		26.91	■■□□□ 1.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.4 ms