RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533520.5

ARNTL-219, Transcript of aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like, humanhuman

TSL 4

Gene ARNTL, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTL-219ENST00000533520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.24■■■■■ 7.55
ARNTL-219ENST00000533520 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.5■■■■■ 6.47
ARNTL-219ENST00000533520 ABCC9O60706 1549 aa54.55■■■■■ 6.32
ARNTL-219ENST00000533520 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.41■■■■■ 5.98
ARNTL-219ENST00000533520 NACADO15069 1562 aa52.28■■■■■ 5.96
ARNTL-219ENST00000533520 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.14■■■■■ 5.94
ARNTL-219ENST00000533520 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.88■■■■■ 5.9
ARNTL-219ENST00000533520 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.76■■■■■ 5.88
ARNTL-219ENST00000533520 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.52■■■■■ 5.84
ARNTL-219ENST00000533520 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.11■■■■■ 5.77
ARNTL-219ENST00000533520 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.91■■■■■ 5.74
ARNTL-219ENST00000533520 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.74■■■■■ 5.71
ARNTL-219ENST00000533520 SCRIBQ14160 1630 aa50.54■■■■■ 5.68
ARNTL-219ENST00000533520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.32■■■■■ 5.65
ARNTL-219ENST00000533520 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.3■■■■■ 5.64
ARNTL-219ENST00000533520 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.47■■■■■ 5.51
ARNTL-219ENST00000533520 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.34■■■■■ 5.49
ARNTL-219ENST00000533520 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.09■■■■■ 5.45
ARNTL-219ENST00000533520 SMARCA4P51532 1647 aa48.35■■■■■ 5.33
ARNTL-219ENST00000533520 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.29■■■■■ 5.32
ARNTL-219ENST00000533520 NCAPD3P42695 1498 aa48.23■■■■■ 5.31
ARNTL-219ENST00000533520 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.18■■■■■ 5.3
ARNTL-219ENST00000533520 SMARCA2P51531 1590 aa48.15■■■■■ 5.3
ARNTL-219ENST00000533520 HMGXB3Q12766 1538 aa47.96■■■■■ 5.27
ARNTL-219ENST00000533520 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.92■■■■■ 5.26
ARNTL-219ENST00000533520 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.9■■■■■ 5.26
ARNTL-219ENST00000533520 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
ARNTL-219ENST00000533520 WIZO95785 1651 aa47.38■■■■■ 5.17
ARNTL-219ENST00000533520 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.28■■■■■ 5.16
ARNTL-219ENST00000533520 ERCC6Q03468 1493 aa47.1■■■■■ 5.13
ARNTL-219ENST00000533520 NESP48681 1621 aa47.08■■■■■ 5.13
ARNTL-219ENST00000533520 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.01■■■■■ 5.12
ARNTL-219ENST00000533520 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
ARNTL-219ENST00000533520 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.81■■■■■ 5.08
ARNTL-219ENST00000533520 CUX2O14529 1486 aa46.74■■■■■ 5.07
ARNTL-219ENST00000533520 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.73■■■■■ 5.07
ARNTL-219ENST00000533520 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.53■■■■■ 5.04
ARNTL-219ENST00000533520 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
ARNTL-219ENST00000533520 CFTRP13569 1480 aa46.44■■■■■ 5.03
ARNTL-219ENST00000533520 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.34■■■■■ 5.01
ARNTL-219ENST00000533520 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.25■■■■■ 5
ARNTL-219ENST00000533520 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.24■■■■■ 4.99
ARNTL-219ENST00000533520 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.23■■■■■ 4.99
ARNTL-219ENST00000533520 WDR62O43379 1518 aa46.08■■■■■ 4.97
ARNTL-219ENST00000533520 PRDM2Q13029 1718 aa46.06■■■■■ 4.96
ARNTL-219ENST00000533520 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
ARNTL-219ENST00000533520 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
ARNTL-219ENST00000533520 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.65■■■■■ 4.9
ARNTL-219ENST00000533520 ABCC8Q09428 1581 aa45.54■■■■■ 4.88
ARNTL-219ENST00000533520 TOPBP1Q92547 1522 aa45.47■■■■■ 4.87
ARNTL-219ENST00000533520 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.4■■■■■ 4.86
ARNTL-219ENST00000533520 IFT140Q96RY7 1462 aa45.3■■■■■ 4.84
ARNTL-219ENST00000533520 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.05■■■■■ 4.8
ARNTL-219ENST00000533520 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
ARNTL-219ENST00000533520 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
ARNTL-219ENST00000533520 CUX1P39880 1505 aa44.97■■■■■ 4.79
ARNTL-219ENST00000533520 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.9■■■■■ 4.78
ARNTL-219ENST00000533520 SOGA1O94964 1423 aa44.89■■■■■ 4.78
ARNTL-219ENST00000533520 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
ARNTL-219ENST00000533520 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.84■■■■■ 4.77
ARNTL-219ENST00000533520 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.77■■■■■ 4.76
ARNTL-219ENST00000533520 OSCARQ8IYS5 282 aa44.76■■■■■ 4.76
ARNTL-219ENST00000533520 WDR97A6NE52 1622 aa44.69■■■■■ 4.74
ARNTL-219ENST00000533520 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
ARNTL-219ENST00000533520 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.62■■■■■ 4.73
ARNTL-219ENST00000533520 TOP2BQ02880 1626 aa44.53■■■■■ 4.72
ARNTL-219ENST00000533520 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.53■■■■■ 4.72
ARNTL-219ENST00000533520 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.47■■■■■ 4.71
ARNTL-219ENST00000533520 SYNJ1O43426 1573 aa44.46■■■■■ 4.71
ARNTL-219ENST00000533520 GRIN2BQ13224 1484 aa44.41■■■■■ 4.7
ARNTL-219ENST00000533520 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.37■■■■■ 4.69
ARNTL-219ENST00000533520 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.35■■■■■ 4.69
ARNTL-219ENST00000533520 CHD1O14646 1710 aa44.35■■■■■ 4.69
ARNTL-219ENST00000533520 FBLN2P98095 1184 aa44.34■■■■■ 4.69
ARNTL-219ENST00000533520 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
ARNTL-219ENST00000533520 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.29■■■■■ 4.68
ARNTL-219ENST00000533520 PBRM1Q86U86 1689 aa44.26■■■■■ 4.68
ARNTL-219ENST00000533520 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
ARNTL-219ENST00000533520 SYNJ2O15056 1496 aa44.16■■■■■ 4.66
ARNTL-219ENST00000533520 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.99■■■■■ 4.63
ARNTL-219ENST00000533520 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.99■■■■■ 4.63
ARNTL-219ENST00000533520 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.99■■■■■ 4.63
ARNTL-219ENST00000533520 TRIM41Q8WV44 630 aa43.99■■■■■ 4.63
ARNTL-219ENST00000533520 ARHGEF11O15085 1522 aa43.98■■■■■ 4.63
ARNTL-219ENST00000533520 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.95■■■■■ 4.63
ARNTL-219ENST00000533520 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.89■■■■■ 4.62
ARNTL-219ENST00000533520 ADAMTS12P58397 1594 aa43.89■■■■■ 4.62
ARNTL-219ENST00000533520 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.86■■■■■ 4.61
ARNTL-219ENST00000533520 GRIN2AQ12879 1464 aa43.82■■■■■ 4.6
ARNTL-219ENST00000533520 KIF27Q86VH2 1401 aa43.74■■■■■ 4.59
ARNTL-219ENST00000533520 NUP160Q12769 1436 aa43.65■■■■■ 4.58
ARNTL-219ENST00000533520 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.6■■■■■ 4.57
ARNTL-219ENST00000533520 CEP170Q5SW79 1584 aa43.58■■■■■ 4.57
ARNTL-219ENST00000533520 ARAP1Q96P48 1450 aa43.57■■■■■ 4.57
ARNTL-219ENST00000533520 IGF1RP08069 1367 aa43.56■■■■■ 4.56
ARNTL-219ENST00000533520 CUL7Q14999 1698 aa43.49■■■■■ 4.55
ARNTL-219ENST00000533520 SHROOM2Q13796 1616 aa43.33■■■■■ 4.53
ARNTL-219ENST00000533520 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.32■■■■■ 4.53
ARNTL-219ENST00000533520 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.25■■■■■ 4.51
ARNTL-219ENST00000533520 JPH4Q96JJ6 628 aa43.22■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms