RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
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UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.66■■□□□ 1.54
UBASH3B-208ENST00000533451 ABCC9O60706 1549 aa24.21■■□□□ 1.47
UBASH3B-208ENST00000533451 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.32■■□□□ 1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.24■■□□□ 1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 NACADO15069 1562 aa23.16■■□□□ 1.3
UBASH3B-208ENST00000533451 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UBASH3B-208ENST00000533451 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.92■■□□□ 1.26
UBASH3B-208ENST00000533451 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.84■■□□□ 1.25
UBASH3B-208ENST00000533451 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.74■■□□□ 1.23
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UBASH3B-208ENST00000533451 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.47■■□□□ 1.19
UBASH3B-208ENST00000533451 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.22■■□□□ 1.15
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.13■■□□□ 1.13
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UBASH3B-208ENST00000533451 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.87■■□□□ 1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.72■■□□□ 1.07
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UBASH3B-208ENST00000533451 SMARCA4P51532 1647 aa21.54■■□□□ 1.04
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UBASH3B-208ENST00000533451 SMARCA2P51531 1590 aa21.39■■□□□ 1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.36■■□□□ 1.01
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UBASH3B-208ENST00000533451 HMGXB3Q12766 1538 aa21.27■■□□□ 1
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UBASH3B-208ENST00000533451 NESP48681 1621 aa20.92■□□□□ 0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 ERCC6Q03468 1493 aa20.91■□□□□ 0.94
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UBASH3B-208ENST00000533451 ADRA2BP18089 450 aa20.87■□□□□ 0.93
UBASH3B-208ENST00000533451 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.83■□□□□ 0.92
UBASH3B-208ENST00000533451 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.73■□□□□ 0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.72■□□□□ 0.91
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UBASH3B-208ENST00000533451 CUX2O14529 1486 aa20.58■□□□□ 0.89
UBASH3B-208ENST00000533451 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.56■□□□□ 0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.56■□□□□ 0.88
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UBASH3B-208ENST00000533451 WDR62O43379 1518 aa20.41■□□□□ 0.86
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UBASH3B-208ENST00000533451 ABCC8Q09428 1581 aa20.18■□□□□ 0.82
UBASH3B-208ENST00000533451 IFT140Q96RY7 1462 aa20.08■□□□□ 0.81
UBASH3B-208ENST00000533451 CUX1P39880 1505 aa20.06■□□□□ 0.8
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UBASH3B-208ENST00000533451 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.01■□□□□ 0.79
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UBASH3B-208ENST00000533451 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.98■□□□□ 0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
UBASH3B-208ENST00000533451 SOGA1O94964 1423 aa19.95■□□□□ 0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.95■□□□□ 0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 SYNJ1O43426 1573 aa19.9■□□□□ 0.78
UBASH3B-208ENST00000533451 TOP2BQ02880 1626 aa19.87■□□□□ 0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.87■□□□□ 0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 WDR97A6NE52 1622 aa19.83■□□□□ 0.76
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UBASH3B-208ENST00000533451 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.76■□□□□ 0.75
UBASH3B-208ENST00000533451 PBRM1Q86U86 1689 aa19.76■□□□□ 0.75
UBASH3B-208ENST00000533451 CHD1O14646 1710 aa19.76■□□□□ 0.75
UBASH3B-208ENST00000533451 OSCARQ8IYS5 282 aa19.75■□□□□ 0.75
UBASH3B-208ENST00000533451 GRIN2BQ13224 1484 aa19.73■□□□□ 0.75
UBASH3B-208ENST00000533451 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.73■□□□□ 0.75
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UBASH3B-208ENST00000533451 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.72■□□□□ 0.75
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UBASH3B-208ENST00000533451 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
UBASH3B-208ENST00000533451 SYNJ2O15056 1496 aa19.6■□□□□ 0.73
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAMTS12P58397 1594 aa19.56■□□□□ 0.72
UBASH3B-208ENST00000533451 POTEDQ86YR6 584 aa19.55■□□□□ 0.72
UBASH3B-208ENST00000533451 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.54■□□□□ 0.72
UBASH3B-208ENST00000533451 KIF27Q86VH2 1401 aa19.52■□□□□ 0.72
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM41Q8WV44 630 aa19.5■□□□□ 0.71
UBASH3B-208ENST00000533451 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.49■□□□□ 0.71
UBASH3B-208ENST00000533451 GRIN2AQ12879 1464 aa19.48■□□□□ 0.71
UBASH3B-208ENST00000533451 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.47■□□□□ 0.71
UBASH3B-208ENST00000533451 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.47■□□□□ 0.71
UBASH3B-208ENST00000533451 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.47■□□□□ 0.71
UBASH3B-208ENST00000533451 ARHGEF11O15085 1522 aa19.45■□□□□ 0.7
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