RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533013.1

TENM4-208, Transcript of teneurin transmembrane protein 4, human

TSL 3

Gene TENM4, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TENM4-208	ENST00000533013	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.07	■■■■■ 4.16
TENM4-208	ENST00000533013	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.84	■■■■□ 3.49
TENM4-208	ENST00000533013	ABCC9	O60706	1549 aa		36.66	■■■■□ 3.46
TENM4-208	ENST00000533013	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.97	■■■■□ 3.19
TENM4-208	ENST00000533013	NACAD	O15069	1562 aa		34.78	■■■■□ 3.16
TENM4-208	ENST00000533013	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.4	■■■■□ 3.1
TENM4-208	ENST00000533013	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.4	■■■■□ 3.1
TENM4-208	ENST00000533013	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.32	■■■■□ 3.08
TENM4-208	ENST00000533013	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		34.22	■■■■□ 3.07
TENM4-208	ENST00000533013	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.1	■■■■□ 3.05
TENM4-208	ENST00000533013	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.09	■■■■□ 3.05
TENM4-208	ENST00000533013	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.02	■■■■□ 3.04
TENM4-208	ENST00000533013	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.98	■■■■□ 3.03
TENM4-208	ENST00000533013	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TENM4-208	ENST00000533013	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TENM4-208	ENST00000533013	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TENM4-208	ENST00000533013	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
TENM4-208	ENST00000533013	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TENM4-208	ENST00000533013	NCAPD3	P42695	1498 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TENM4-208	ENST00000533013	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TENM4-208	ENST00000533013	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TENM4-208	ENST00000533013	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TENM4-208	ENST00000533013	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TENM4-208	ENST00000533013	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
TENM4-208	ENST00000533013	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TENM4-208	ENST00000533013	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
TENM4-208	ENST00000533013	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.64	■■■□□ 2.65
TENM4-208	ENST00000533013	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.62	■■■□□ 2.65
TENM4-208	ENST00000533013	CUX2	O14529	1486 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TENM4-208	ENST00000533013	NES	P48681	1621 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TENM4-208	ENST00000533013	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TENM4-208	ENST00000533013	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TENM4-208	ENST00000533013	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
TENM4-208	ENST00000533013	WIZ	O95785	1651 aa		31.25	■■■□□ 2.59
TENM4-208	ENST00000533013	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TENM4-208	ENST00000533013	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TENM4-208	ENST00000533013	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		31.1	■■■□□ 2.57
TENM4-208	ENST00000533013	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
TENM4-208	ENST00000533013	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.89	■■■□□ 2.54
TENM4-208	ENST00000533013	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.88	■■■□□ 2.53
TENM4-208	ENST00000533013	WDR62	O43379	1518 aa		30.86	■■■□□ 2.53
TENM4-208	ENST00000533013	CFTR	P13569	1480 aa		30.81	■■■□□ 2.52
TENM4-208	ENST00000533013	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.77	■■■□□ 2.52
TENM4-208	ENST00000533013	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.76	■■■□□ 2.51
TENM4-208	ENST00000533013	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	30.52	■■■□□ 2.48
TENM4-208	ENST00000533013	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.51	■■■□□ 2.47
TENM4-208	ENST00000533013	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.5	■■■□□ 2.47
TENM4-208	ENST00000533013	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.2	■■■□□ 2.42
TENM4-208	ENST00000533013	IFT140	Q96RY7	1462 aa		30.16	■■■□□ 2.42
TENM4-208	ENST00000533013	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.12	■■■□□ 2.41
TENM4-208	ENST00000533013	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.11	■■■□□ 2.41
TENM4-208	ENST00000533013	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.11	■■■□□ 2.41
TENM4-208	ENST00000533013	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		30.07	■■■□□ 2.4
TENM4-208	ENST00000533013	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TENM4-208	ENST00000533013	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.98	■■■□□ 2.39
TENM4-208	ENST00000533013	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
TENM4-208	ENST00000533013	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
TENM4-208	ENST00000533013	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.82	■■■□□ 2.36
TENM4-208	ENST00000533013	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TENM4-208	ENST00000533013	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TENM4-208	ENST00000533013	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TENM4-208	ENST00000533013	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.76	■■■□□ 2.35
TENM4-208	ENST00000533013	CUX1	P39880	1505 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TENM4-208	ENST00000533013	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.72	■■■□□ 2.35
TENM4-208	ENST00000533013	SOGA1	O94964	1423 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TENM4-208	ENST00000533013	CHD1	O14646	1710 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TENM4-208	ENST00000533013	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.69	■■■□□ 2.34
TENM4-208	ENST00000533013	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.67	■■■□□ 2.34
TENM4-208	ENST00000533013	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.64	■■■□□ 2.33
TENM4-208	ENST00000533013	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.55	■■■□□ 2.32
TENM4-208	ENST00000533013	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.55	■■■□□ 2.32
TENM4-208	ENST00000533013	FBLN2	P98095	1184 aa		29.49	■■■□□ 2.31
TENM4-208	ENST00000533013	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
TENM4-208	ENST00000533013	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.47	■■■□□ 2.31
TENM4-208	ENST00000533013	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.43	■■■□□ 2.3
TENM4-208	ENST00000533013	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.42	■■■□□ 2.3
TENM4-208	ENST00000533013	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TENM4-208	ENST00000533013	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.39	■■■□□ 2.3
TENM4-208	ENST00000533013	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TENM4-208	ENST00000533013	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TENM4-208	ENST00000533013	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TENM4-208	ENST00000533013	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TENM4-208	ENST00000533013	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TENM4-208	ENST00000533013	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
TENM4-208	ENST00000533013	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TENM4-208	ENST00000533013	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TENM4-208	ENST00000533013	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.26	■■■□□ 2.27
TENM4-208	ENST00000533013	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TENM4-208	ENST00000533013	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TENM4-208	ENST00000533013	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TENM4-208	ENST00000533013	NUP160	Q12769	1436 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TENM4-208	ENST00000533013	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TENM4-208	ENST00000533013	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TENM4-208	ENST00000533013	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TENM4-208	ENST00000533013	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TENM4-208	ENST00000533013	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TENM4-208	ENST00000533013	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TENM4-208	ENST00000533013	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
TENM4-208	ENST00000533013	IGF1R	P08069	1367 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TENM4-208	ENST00000533013	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.65	■■■□□ 2.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms