RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533007.1

SLC6A9-211, Transcript of solute carrier family 6 member 9, humanhuman

TSL 4

Gene SLC6A9, Length 508 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9-211ENST00000533007 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.56■■■■■ 6.49
SLC6A9-211ENST00000533007 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.59■■■■■ 5.53
SLC6A9-211ENST00000533007 ABCC9O60706 1549 aa48.72■■■■■ 5.39
SLC6A9-211ENST00000533007 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.79■■■■■ 5.08
SLC6A9-211ENST00000533007 NACADO15069 1562 aa46.68■■■■■ 5.06
SLC6A9-211ENST00000533007 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.46■■■■■ 5.03
SLC6A9-211ENST00000533007 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.32■■■■■ 5.01
SLC6A9-211ENST00000533007 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
SLC6A9-211ENST00000533007 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46■■■■■ 4.95
SLC6A9-211ENST00000533007 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.74■■■■■ 4.91
SLC6A9-211ENST00000533007 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.44■■■■■ 4.86
SLC6A9-211ENST00000533007 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.37■■■■■ 4.85
SLC6A9-211ENST00000533007 SCRIBQ14160 1630 aa45.15■■■■■ 4.82
SLC6A9-211ENST00000533007 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.95■■■■■ 4.79
SLC6A9-211ENST00000533007 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.92■■■■■ 4.78
SLC6A9-211ENST00000533007 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
SLC6A9-211ENST00000533007 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.09■■■■■ 4.65
SLC6A9-211ENST00000533007 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.83■■■■■ 4.61
SLC6A9-211ENST00000533007 SMARCA4P51532 1647 aa43.19■■■■■ 4.51
SLC6A9-211ENST00000533007 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
SLC6A9-211ENST00000533007 NCAPD3P42695 1498 aa43.06■■■■■ 4.48
SLC6A9-211ENST00000533007 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.02■■■■■ 4.48
SLC6A9-211ENST00000533007 SMARCA2P51531 1590 aa42.98■■■■■ 4.47
SLC6A9-211ENST00000533007 HMGXB3Q12766 1538 aa42.83■■■■■ 4.45
SLC6A9-211ENST00000533007 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.8■■■■■ 4.44
SLC6A9-211ENST00000533007 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.8■■■■■ 4.44
SLC6A9-211ENST00000533007 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
SLC6A9-211ENST00000533007 WIZO95785 1651 aa42.33■■■■■ 4.37
SLC6A9-211ENST00000533007 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
SLC6A9-211ENST00000533007 NESP48681 1621 aa42.06■■■■■ 4.32
SLC6A9-211ENST00000533007 ERCC6Q03468 1493 aa42.03■■■■■ 4.32
SLC6A9-211ENST00000533007 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.98■■■■■ 4.31
SLC6A9-211ENST00000533007 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
SLC6A9-211ENST00000533007 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.76■■■■■ 4.28
SLC6A9-211ENST00000533007 CUX2O14529 1486 aa41.73■■■■■ 4.27
SLC6A9-211ENST00000533007 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.69■■■■■ 4.26
SLC6A9-211ENST00000533007 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.61■■■■■ 4.25
SLC6A9-211ENST00000533007 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
SLC6A9-211ENST00000533007 CFTRP13569 1480 aa41.47■■■■■ 4.23
SLC6A9-211ENST00000533007 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.36■■■■■ 4.21
SLC6A9-211ENST00000533007 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.28■■■■■ 4.2
SLC6A9-211ENST00000533007 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.28■■■■■ 4.2
SLC6A9-211ENST00000533007 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.28■■■■■ 4.2
SLC6A9-211ENST00000533007 PRDM2Q13029 1718 aa41.19■■■■■ 4.18
SLC6A9-211ENST00000533007 WDR62O43379 1518 aa41.17■■■■■ 4.18
SLC6A9-211ENST00000533007 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
SLC6A9-211ENST00000533007 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
SLC6A9-211ENST00000533007 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.76■■■■■ 4.12
SLC6A9-211ENST00000533007 ABCC8Q09428 1581 aa40.61■■■■■ 4.09
SLC6A9-211ENST00000533007 TOPBP1Q92547 1522 aa40.6■■■■■ 4.09
SLC6A9-211ENST00000533007 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.55■■■■■ 4.08
SLC6A9-211ENST00000533007 IFT140Q96RY7 1462 aa40.43■■■■■ 4.06
SLC6A9-211ENST00000533007 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
SLC6A9-211ENST00000533007 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
SLC6A9-211ENST00000533007 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
SLC6A9-211ENST00000533007 CUX1P39880 1505 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC6A9-211ENST00000533007 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
SLC6A9-211ENST00000533007 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.09■■■■■ 4.01
SLC6A9-211ENST00000533007 SOGA1O94964 1423 aa40.05■■■■■ 4
SLC6A9-211ENST00000533007 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.03■■■■■ 4
SLC6A9-211ENST00000533007 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.96■■■■□ 3.99
SLC6A9-211ENST00000533007 OSCARQ8IYS5 282 aa39.91■■■■□ 3.98
SLC6A9-211ENST00000533007 WDR97A6NE52 1622 aa39.91■■■■□ 3.98
SLC6A9-211ENST00000533007 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
SLC6A9-211ENST00000533007 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.81■■■■□ 3.96
SLC6A9-211ENST00000533007 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.79■■■■□ 3.96
SLC6A9-211ENST00000533007 TOP2BQ02880 1626 aa39.78■■■■□ 3.96
SLC6A9-211ENST00000533007 SYNJ1O43426 1573 aa39.73■■■■□ 3.95
SLC6A9-211ENST00000533007 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.7■■■■□ 3.95
SLC6A9-211ENST00000533007 CHD1O14646 1710 aa39.66■■■■□ 3.94
SLC6A9-211ENST00000533007 GRIN2BQ13224 1484 aa39.64■■■■□ 3.94
SLC6A9-211ENST00000533007 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.62■■■■□ 3.93
SLC6A9-211ENST00000533007 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.59■■■■□ 3.93
SLC6A9-211ENST00000533007 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.58■■■■□ 3.93
SLC6A9-211ENST00000533007 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
SLC6A9-211ENST00000533007 PBRM1Q86U86 1689 aa39.56■■■■□ 3.92
SLC6A9-211ENST00000533007 FBLN2P98095 1184 aa39.52■■■■□ 3.92
SLC6A9-211ENST00000533007 SYNJ2O15056 1496 aa39.43■■■■□ 3.9
SLC6A9-211ENST00000533007 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
SLC6A9-211ENST00000533007 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.32■■■■□ 3.89
SLC6A9-211ENST00000533007 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.32■■■■□ 3.89
SLC6A9-211ENST00000533007 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.32■■■■□ 3.89
SLC6A9-211ENST00000533007 ARHGEF11O15085 1522 aa39.28■■■■□ 3.88
SLC6A9-211ENST00000533007 TRIM41Q8WV44 630 aa39.25■■■■□ 3.87
SLC6A9-211ENST00000533007 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.24■■■■□ 3.87
SLC6A9-211ENST00000533007 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.23■■■■□ 3.87
SLC6A9-211ENST00000533007 ADAMTS12P58397 1594 aa39.22■■■■□ 3.87
SLC6A9-211ENST00000533007 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.14■■■■□ 3.86
SLC6A9-211ENST00000533007 GRIN2AQ12879 1464 aa39.12■■■■□ 3.85
SLC6A9-211ENST00000533007 KIF27Q86VH2 1401 aa39.01■■■■□ 3.84
SLC6A9-211ENST00000533007 NUP160Q12769 1436 aa38.97■■■■□ 3.83
SLC6A9-211ENST00000533007 CEP170Q5SW79 1584 aa38.95■■■■□ 3.83
SLC6A9-211ENST00000533007 ARAP1Q96P48 1450 aa38.94■■■■□ 3.82
SLC6A9-211ENST00000533007 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.89■■■■□ 3.82
SLC6A9-211ENST00000533007 IGF1RP08069 1367 aa38.86■■■■□ 3.81
SLC6A9-211ENST00000533007 CUL7Q14999 1698 aa38.84■■■■□ 3.81
SLC6A9-211ENST00000533007 SHROOM2Q13796 1616 aa38.73■■■■□ 3.79
SLC6A9-211ENST00000533007 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.65■■■■□ 3.78
SLC6A9-211ENST00000533007 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.63■■■■□ 3.77
SLC6A9-211ENST00000533007 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.62■■■■□ 3.77
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