RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532827.1

C8orf82-204, Transcript of chromosome 8 open reading frame 82, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene C8orf82, Length 802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf82-204ENST00000532827 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.18■■■■■ 6.74
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C8orf82-204ENST00000532827 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.99■■■■■ 5.43
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C8orf82-204ENST00000532827 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.93■■■■■ 5.1
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C8orf82-204ENST00000532827 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.54■■■■■ 4.72
C8orf82-204ENST00000532827 ERCC6Q03468 1493 aa44.5■■■■■ 4.71
C8orf82-204ENST00000532827 CUX2O14529 1486 aa44.48■■■■■ 4.71
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C8orf82-204ENST00000532827 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.59■■■■■ 4.57
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C8orf82-204ENST00000532827 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.27■■■■■ 4.52
C8orf82-204ENST00000532827 WDR62O43379 1518 aa43.2■■■■■ 4.51
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C8orf82-204ENST00000532827 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.06■■■■■ 4.48
C8orf82-204ENST00000532827 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
C8orf82-204ENST00000532827 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.99■■■■■ 4.47
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C8orf82-204ENST00000532827 OSCARQ8IYS5 282 aa42.32■■■■■ 4.37
C8orf82-204ENST00000532827 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
C8orf82-204ENST00000532827 IFT140Q96RY7 1462 aa42.2■■■■■ 4.35
C8orf82-204ENST00000532827 TOPBP1Q92547 1522 aa42.17■■■■■ 4.34
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C8orf82-204ENST00000532827 SOGA1O94964 1423 aa41.48■■■■■ 4.23
C8orf82-204ENST00000532827 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
C8orf82-204ENST00000532827 FBLN2P98095 1184 aa41.43■■■■■ 4.22
C8orf82-204ENST00000532827 WDR97A6NE52 1622 aa41.43■■■■■ 4.22
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C8orf82-204ENST00000532827 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.34■■■■■ 4.21
C8orf82-204ENST00000532827 ARAP1Q96P48 1450 aa41.32■■■■■ 4.2
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C8orf82-204ENST00000532827 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
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C8orf82-204ENST00000532827 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.04■■■■■ 4.16
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C8orf82-204ENST00000532827 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.01■■■■■ 4.16
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C8orf82-204ENST00000532827 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.73■■■■■ 4.11
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C8orf82-204ENST00000532827 CEP170Q5SW79 1584 aa40.65■■■■■ 4.1
C8orf82-204ENST00000532827 NUP160Q12769 1436 aa40.52■■■■■ 4.08
C8orf82-204ENST00000532827 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.47■■■■■ 4.07
C8orf82-204ENST00000532827 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.46■■■■■ 4.07
C8orf82-204ENST00000532827 SHROOM2Q13796 1616 aa40.43■■■■■ 4.06
C8orf82-204ENST00000532827 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.17■■■■■ 4.02
C8orf82-204ENST00000532827 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
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C8orf82-204ENST00000532827 JPH4Q96JJ6 628 aa40.02■■■■■ 4
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