RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532545.1

EPS8L2-222, Transcript of EPS8 like 2, human

TSL 3

Gene EPS8L2, Length 419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPS8L2-222	ENST00000532545	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		55.72	■■■■■ 6.51
EPS8L2-222	ENST00000532545	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		49.77	■■■■■ 5.56
EPS8L2-222	ENST00000532545	ABCC9	O60706	1549 aa		49.42	■■■■■ 5.5
EPS8L2-222	ENST00000532545	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.23	■■■■■ 5.15
EPS8L2-222	ENST00000532545	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47	■■■■■ 5.11
EPS8L2-222	ENST00000532545	NACAD	O15069	1562 aa		46.99	■■■■■ 5.11
EPS8L2-222	ENST00000532545	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.47	■■■■■ 5.03
EPS8L2-222	ENST00000532545	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.25	■■■■■ 4.99
EPS8L2-222	ENST00000532545	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.12	■■■■■ 4.97	4e-8	■□□□□ 10.2
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EPS8L2-222	ENST00000532545	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.03	■■■■■ 4.96
EPS8L2-222	ENST00000532545	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.94	■■■■■ 4.94
EPS8L2-222	ENST00000532545	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		45.76	■■■■■ 4.92
EPS8L2-222	ENST00000532545	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.41	■■■■■ 4.86
EPS8L2-222	ENST00000532545	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.24	■■■■■ 4.83
EPS8L2-222	ENST00000532545	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.65	■■■■■ 4.74
EPS8L2-222	ENST00000532545	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.63	■■■■■ 4.73
EPS8L2-222	ENST00000532545	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.47	■■■■■ 4.71
EPS8L2-222	ENST00000532545	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.38	■■■■■ 4.53
EPS8L2-222	ENST00000532545	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.36	■■■■■ 4.53
EPS8L2-222	ENST00000532545	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.31	■■■■■ 4.52
EPS8L2-222	ENST00000532545	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.24	■■■■■ 4.51
EPS8L2-222	ENST00000532545	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.23	■■■■■ 4.51
EPS8L2-222	ENST00000532545	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.08	■■■■■ 4.49
EPS8L2-222	ENST00000532545	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.47
EPS8L2-222	ENST00000532545	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		42.93	■■■■■ 4.46
EPS8L2-222	ENST00000532545	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		42.9	■■■■■ 4.46
EPS8L2-222	ENST00000532545	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.68	■■■■■ 4.42
EPS8L2-222	ENST00000532545	NES	P48681	1621 aa		42.55	■■■■■ 4.4
EPS8L2-222	ENST00000532545	WIZ	O95785	1651 aa		42.42	■■■■■ 4.38
EPS8L2-222	ENST00000532545	CUX2	O14529	1486 aa		42.41	■■■■■ 4.38
EPS8L2-222	ENST00000532545	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.33	■■■■■ 4.37
EPS8L2-222	ENST00000532545	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
EPS8L2-222	ENST00000532545	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.13	■■■■■ 4.34
EPS8L2-222	ENST00000532545	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.12	■■■■■ 4.33
EPS8L2-222	ENST00000532545	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
EPS8L2-222	ENST00000532545	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		41.99	■■■■■ 4.31
EPS8L2-222	ENST00000532545	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
EPS8L2-222	ENST00000532545	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.92	■■■■■ 4.3
EPS8L2-222	ENST00000532545	CFTR	P13569	1480 aa		41.7	■■■■■ 4.27
EPS8L2-222	ENST00000532545	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.7	■■■■■ 4.27
EPS8L2-222	ENST00000532545	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.64	■■■■■ 4.26
EPS8L2-222	ENST00000532545	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.63	■■■■■ 4.25
EPS8L2-222	ENST00000532545	WDR62	O43379	1518 aa		41.54	■■■■■ 4.24
EPS8L2-222	ENST00000532545	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.47	■■■■■ 4.23
EPS8L2-222	ENST00000532545	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.25	■■■■■ 4.19
EPS8L2-222	ENST00000532545	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.23	■■■■■ 4.19
EPS8L2-222	ENST00000532545	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.87	■■■■■ 4.13
EPS8L2-222	ENST00000532545	ABCC8	Q09428	1581 aa		40.86	■■■■■ 4.13
EPS8L2-222	ENST00000532545	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.79	■■■■■ 4.12
EPS8L2-222	ENST00000532545	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
EPS8L2-222	ENST00000532545	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.75	■■■■■ 4.11
EPS8L2-222	ENST00000532545	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
EPS8L2-222	ENST00000532545	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.63	■■■■■ 4.09
EPS8L2-222	ENST00000532545	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
EPS8L2-222	ENST00000532545	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
EPS8L2-222	ENST00000532545	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
EPS8L2-222	ENST00000532545	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.37	■■■■■ 4.05	1e-15	■■■■■ 27.1
EPS8L2-222	ENST00000532545	SOGA1	O94964	1423 aa		40.35	■■■■■ 4.05
EPS8L2-222	ENST00000532545	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.33	■■■■■ 4.05
EPS8L2-222	ENST00000532545	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.33	■■■■■ 4.05
EPS8L2-222	ENST00000532545	CUX1	P39880	1505 aa		40.31	■■■■■ 4.04
EPS8L2-222	ENST00000532545	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.3	■■■■■ 4.04
EPS8L2-222	ENST00000532545	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
EPS8L2-222	ENST00000532545	FBLN2	P98095	1184 aa		40.12	■■■■■ 4.01
EPS8L2-222	ENST00000532545	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.09	■■■■■ 4.01
EPS8L2-222	ENST00000532545	CHD1	O14646	1710 aa		40.03	■■■■■ 4
EPS8L2-222	ENST00000532545	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		39.96	■■■■□ 3.99
EPS8L2-222	ENST00000532545	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		39.94	■■■■□ 3.99
EPS8L2-222	ENST00000532545	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		39.94	■■■■□ 3.99
EPS8L2-222	ENST00000532545	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		39.94	■■■■□ 3.99
EPS8L2-222	ENST00000532545	GRIN2B	Q13224	1484 aa		39.94	■■■■□ 3.98
EPS8L2-222	ENST00000532545	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.88	■■■■□ 3.97
EPS8L2-222	ENST00000532545	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.88	■■■■□ 3.97
EPS8L2-222	ENST00000532545	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	39.88	■■■■□ 3.97
EPS8L2-222	ENST00000532545	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.86	■■■■□ 3.97
EPS8L2-222	ENST00000532545	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		39.86	■■■■□ 3.97
EPS8L2-222	ENST00000532545	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	39.85	■■■■□ 3.97
EPS8L2-222	ENST00000532545	TOP2B	Q02880	1626 aa		39.78	■■■■□ 3.96
EPS8L2-222	ENST00000532545	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		39.76	■■■■□ 3.96
EPS8L2-222	ENST00000532545	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.75	■■■■□ 3.95
EPS8L2-222	ENST00000532545	PBRM1	Q86U86	1689 aa		39.74	■■■■□ 3.95
EPS8L2-222	ENST00000532545	SYNJ1	O43426	1573 aa		39.73	■■■■□ 3.95
EPS8L2-222	ENST00000532545	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.72	■■■■□ 3.95
EPS8L2-222	ENST00000532545	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.65	■■■■□ 3.94
EPS8L2-222	ENST00000532545	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.59	■■■■□ 3.93
EPS8L2-222	ENST00000532545	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.5	■■■■□ 3.91
EPS8L2-222	ENST00000532545	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.4	■■■■□ 3.9
EPS8L2-222	ENST00000532545	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.4	■■■■□ 3.9
EPS8L2-222	ENST00000532545	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.37	■■■■□ 3.89
EPS8L2-222	ENST00000532545	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.37	■■■■□ 3.89
EPS8L2-222	ENST00000532545	NUP160	Q12769	1436 aa		39.23	■■■■□ 3.87
EPS8L2-222	ENST00000532545	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.21	■■■■□ 3.87
EPS8L2-222	ENST00000532545	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.11	■■■■□ 3.85
EPS8L2-222	ENST00000532545	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.08	■■■■□ 3.85
EPS8L2-222	ENST00000532545	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39	■■■■□ 3.83
EPS8L2-222	ENST00000532545	IGF1R	P08069	1367 aa		38.99	■■■■□ 3.83
EPS8L2-222	ENST00000532545	SHROOM2	Q13796	1616 aa		38.97	■■■■□ 3.83
EPS8L2-222	ENST00000532545	JPH4	Q96JJ6	628 aa		38.91	■■■■□ 3.82
EPS8L2-222	ENST00000532545	CUL7	Q14999	1698 aa		38.88	■■■■□ 3.81

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