RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532538.1

BRPF3-210, Transcript of bromodomain and PHD finger containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene BRPF3, Length 567 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3-210ENST00000532538 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.86■■■■□ 3.65
BRPF3-210ENST00000532538 ABCC9O60706 1549 aa34.15■■■■□ 3.06
BRPF3-210ENST00000532538 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.06■■■■□ 3.04
BRPF3-210ENST00000532538 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.47■■■□□ 2.79
BRPF3-210ENST00000532538 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.25■■■□□ 2.75
BRPF3-210ENST00000532538 NACADO15069 1562 aa32.18■■■□□ 2.74
BRPF3-210ENST00000532538 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.96■■■□□ 2.71
BRPF3-210ENST00000532538 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.8■■■□□ 2.68
BRPF3-210ENST00000532538 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.79■■■□□ 2.68
BRPF3-210ENST00000532538 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.59■■■□□ 2.65
BRPF3-210ENST00000532538 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.42■■■□□ 2.62
BRPF3-210ENST00000532538 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
BRPF3-210ENST00000532538 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.19■■■□□ 2.58
BRPF3-210ENST00000532538 SCRIBQ14160 1630 aa31.11■■■□□ 2.57
BRPF3-210ENST00000532538 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.95■■■□□ 2.55
BRPF3-210ENST00000532538 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.84■■■□□ 2.53
BRPF3-210ENST00000532538 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.74■■■□□ 2.51
BRPF3-210ENST00000532538 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
BRPF3-210ENST00000532538 NCAPD3P42695 1498 aa29.64■■■□□ 2.34
BRPF3-210ENST00000532538 SMARCA4P51532 1647 aa29.6■■■□□ 2.33
BRPF3-210ENST00000532538 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.58■■■□□ 2.33
BRPF3-210ENST00000532538 SMARCA2P51531 1590 aa29.56■■■□□ 2.32
BRPF3-210ENST00000532538 ERCC6Q03468 1493 aa29.55■■■□□ 2.32
BRPF3-210ENST00000532538 HMGXB3Q12766 1538 aa29.45■■■□□ 2.31
BRPF3-210ENST00000532538 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
BRPF3-210ENST00000532538 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.42■■■□□ 2.3
BRPF3-210ENST00000532538 CUX2O14529 1486 aa29.39■■■□□ 2.3
BRPF3-210ENST00000532538 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
BRPF3-210ENST00000532538 NESP48681 1621 aa29.28■■■□□ 2.28
BRPF3-210ENST00000532538 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.2■■■□□ 2.26
BRPF3-210ENST00000532538 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.18■■■□□ 2.26
BRPF3-210ENST00000532538 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.07■■■□□ 2.24
BRPF3-210ENST00000532538 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.99■■■□□ 2.23
BRPF3-210ENST00000532538 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
BRPF3-210ENST00000532538 WIZO95785 1651 aa28.93■■■□□ 2.22
BRPF3-210ENST00000532538 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.92■■■□□ 2.22
BRPF3-210ENST00000532538 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.78■■■□□ 2.2
BRPF3-210ENST00000532538 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.66■■■□□ 2.18
BRPF3-210ENST00000532538 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.57■■■□□ 2.16
BRPF3-210ENST00000532538 WDR62O43379 1518 aa28.54■■■□□ 2.16
BRPF3-210ENST00000532538 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
BRPF3-210ENST00000532538 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.5■■■□□ 2.15
BRPF3-210ENST00000532538 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
BRPF3-210ENST00000532538 CFTRP13569 1480 aa28.41■■■□□ 2.14
BRPF3-210ENST00000532538 PRDM2Q13029 1718 aa28.32■■■□□ 2.12
BRPF3-210ENST00000532538 TRIM41Q8WV44 630 aa28.31■■■□□ 2.12
BRPF3-210ENST00000532538 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
BRPF3-210ENST00000532538 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.16■■■□□ 2.1
BRPF3-210ENST00000532538 OSCARQ8IYS5 282 aa28.11■■■□□ 2.09
BRPF3-210ENST00000532538 IFT140Q96RY7 1462 aa27.95■■■□□ 2.07
BRPF3-210ENST00000532538 TOPBP1Q92547 1522 aa27.95■■■□□ 2.06
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
BRPF3-210ENST00000532538 ABCC8Q09428 1581 aa27.9■■■□□ 2.06
BRPF3-210ENST00000532538 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.86■■■□□ 2.05
BRPF3-210ENST00000532538 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
BRPF3-210ENST00000532538 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.75■■■□□ 2.03
BRPF3-210ENST00000532538 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.75■■■□□ 2.03
BRPF3-210ENST00000532538 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.75■■■□□ 2.03
BRPF3-210ENST00000532538 CHD1O14646 1710 aa27.7■■■□□ 2.02
BRPF3-210ENST00000532538 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.024e-7■■■■■ 28.5
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BRPF3-210ENST00000532538 FBLN2P98095 1184 aa27.67■■■□□ 2.02
BRPF3-210ENST00000532538 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
BRPF3-210ENST00000532538 ARHGEF11O15085 1522 aa27.61■■■□□ 2.01
BRPF3-210ENST00000532538 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.57■■■□□ 2
BRPF3-210ENST00000532538 SOGA1O94964 1423 aa27.57■■■□□ 2
BRPF3-210ENST00000532538 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
BRPF3-210ENST00000532538 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.5■■□□□ 1.99
BRPF3-210ENST00000532538 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.5■■□□□ 1.99
BRPF3-210ENST00000532538 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
BRPF3-210ENST00000532538 CUX1P39880 1505 aa27.43■■□□□ 1.98
BRPF3-210ENST00000532538 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.41■■□□□ 1.98
BRPF3-210ENST00000532538 WDR97A6NE52 1622 aa27.4■■□□□ 1.98
BRPF3-210ENST00000532538 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
BRPF3-210ENST00000532538 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
BRPF3-210ENST00000532538 PBRM1Q86U86 1689 aa27.31■■□□□ 1.96
BRPF3-210ENST00000532538 GRIN2BQ13224 1484 aa27.31■■□□□ 1.96
BRPF3-210ENST00000532538 ARAP1Q96P48 1450 aa27.31■■□□□ 1.96
BRPF3-210ENST00000532538 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
BRPF3-210ENST00000532538 SYNJ1O43426 1573 aa27.31■■□□□ 1.96
BRPF3-210ENST00000532538 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.22■■□□□ 1.95
BRPF3-210ENST00000532538 SYNJ2O15056 1496 aa27.21■■□□□ 1.95
BRPF3-210ENST00000532538 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.21■■□□□ 1.95
BRPF3-210ENST00000532538 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.13■■□□□ 1.93
BRPF3-210ENST00000532538 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.12■■□□□ 1.93
BRPF3-210ENST00000532538 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
BRPF3-210ENST00000532538 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.01■■□□□ 1.92
BRPF3-210ENST00000532538 TOP2BQ02880 1626 aa27■■□□□ 1.91
BRPF3-210ENST00000532538 GRIN2AQ12879 1464 aa26.95■■□□□ 1.91
BRPF3-210ENST00000532538 ADAMTS12P58397 1594 aa26.94■■□□□ 1.9
BRPF3-210ENST00000532538 CEP170Q5SW79 1584 aa26.86■■□□□ 1.89
BRPF3-210ENST00000532538 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.85■■□□□ 1.89
BRPF3-210ENST00000532538 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.83■■□□□ 1.89
BRPF3-210ENST00000532538 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.81■■□□□ 1.88
BRPF3-210ENST00000532538 NUP160Q12769 1436 aa26.8■■□□□ 1.88
BRPF3-210ENST00000532538 SHROOM2Q13796 1616 aa26.72■■□□□ 1.87
BRPF3-210ENST00000532538 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
BRPF3-210ENST00000532538 JPH4Q96JJ6 628 aa26.62■■□□□ 1.85
BRPF3-210ENST00000532538 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
BRPF3-210ENST00000532538 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.55■■□□□ 1.84
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