RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532471.1

ME3-210, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 2

Gene ME3, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-210ENST00000532471 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.02■■■■■ 6.56
ME3-210ENST00000532471 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.84■■■■■ 5.57
ME3-210ENST00000532471 ABCC9O60706 1549 aa49.13■■■■■ 5.45
ME3-210ENST00000532471 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.21■■■■■ 5.15
ME3-210ENST00000532471 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.14■■■■■ 5.14
ME3-210ENST00000532471 NACADO15069 1562 aa47.02■■■■■ 5.12
ME3-210ENST00000532471 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.63■■■■■ 5.05
ME3-210ENST00000532471 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
ME3-210ENST00000532471 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.33■■■■■ 5.01
ME3-210ENST00000532471 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.96■■■■■ 4.95
ME3-210ENST00000532471 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.88■■■■■ 4.93
ME3-210ENST00000532471 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.6■■■■■ 4.89
ME3-210ENST00000532471 SCRIBQ14160 1630 aa45.48■■■■■ 4.87
ME3-210ENST00000532471 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.35■■■■■ 4.85
ME3-210ENST00000532471 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.19■■■■■ 4.82
ME3-210ENST00000532471 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
ME3-210ENST00000532471 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.37■■■■■ 4.69
ME3-210ENST00000532471 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.19■■■■■ 4.66
ME3-210ENST00000532471 SMARCA4P51532 1647 aa43.47■■■■■ 4.55
ME3-210ENST00000532471 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
ME3-210ENST00000532471 NCAPD3P42695 1498 aa43.42■■■■■ 4.54
ME3-210ENST00000532471 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.37■■■■■ 4.53
ME3-210ENST00000532471 SMARCA2P51531 1590 aa43.33■■■■■ 4.53
ME3-210ENST00000532471 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.14■■■■■ 4.5
ME3-210ENST00000532471 HMGXB3Q12766 1538 aa43.09■■■■■ 4.49
ME3-210ENST00000532471 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.03■■■■■ 4.48
ME3-210ENST00000532471 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
ME3-210ENST00000532471 WIZO95785 1651 aa42.63■■■■■ 4.42
ME3-210ENST00000532471 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
ME3-210ENST00000532471 ERCC6Q03468 1493 aa42.44■■■■■ 4.38
ME3-210ENST00000532471 NESP48681 1621 aa42.38■■■■■ 4.38
ME3-210ENST00000532471 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.27■■■■■ 4.36
ME3-210ENST00000532471 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
ME3-210ENST00000532471 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.18■■■■■ 4.34
ME3-210ENST00000532471 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.12■■■■■ 4.33
ME3-210ENST00000532471 CUX2O14529 1486 aa42.03■■■■■ 4.32
ME3-210ENST00000532471 CFTRP13569 1480 aa41.8■■■■■ 4.28
ME3-210ENST00000532471 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.8■■■■■ 4.28
ME3-210ENST00000532471 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.76■■■■■ 4.28
ME3-210ENST00000532471 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
ME3-210ENST00000532471 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.65■■■■■ 4.26
ME3-210ENST00000532471 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.62■■■■■ 4.25
ME3-210ENST00000532471 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.6■■■■■ 4.25
ME3-210ENST00000532471 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
ME3-210ENST00000532471 WDR62O43379 1518 aa41.4■■■■■ 4.22
ME3-210ENST00000532471 PRDM2Q13029 1718 aa41.32■■■■■ 4.2
ME3-210ENST00000532471 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
ME3-210ENST00000532471 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.15■■■■■ 4.18
ME3-210ENST00000532471 ABCC8Q09428 1581 aa41.01■■■■■ 4.16
ME3-210ENST00000532471 TOPBP1Q92547 1522 aa40.92■■■■■ 4.14
ME3-210ENST00000532471 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.82■■■■■ 4.13
ME3-210ENST00000532471 IFT140Q96RY7 1462 aa40.78■■■■■ 4.12
ME3-210ENST00000532471 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
ME3-210ENST00000532471 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
ME3-210ENST00000532471 SOGA1O94964 1423 aa40.5■■■■■ 4.07
ME3-210ENST00000532471 CUX1P39880 1505 aa40.47■■■■■ 4.07
ME3-210ENST00000532471 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
ME3-210ENST00000532471 OSCARQ8IYS5 282 aa40.42■■■■■ 4.06
ME3-210ENST00000532471 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.42■■■■■ 4.06
ME3-210ENST00000532471 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.39■■■■■ 4.06
ME3-210ENST00000532471 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.05
ME3-210ENST00000532471 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
ME3-210ENST00000532471 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
ME3-210ENST00000532471 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.22■■■■■ 4.03
ME3-210ENST00000532471 WDR97A6NE52 1622 aa40.14■■■■■ 4.02
ME3-210ENST00000532471 FBLN2P98095 1184 aa40.09■■■■■ 4.01
ME3-210ENST00000532471 TOP2BQ02880 1626 aa40.07■■■■■ 4.01
ME3-210ENST00000532471 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.02■■■■■ 4
ME3-210ENST00000532471 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.02■■■■■ 4
ME3-210ENST00000532471 GRIN2BQ13224 1484 aa40■■■■□ 3.99
ME3-210ENST00000532471 SYNJ1O43426 1573 aa40■■■■□ 3.99
ME3-210ENST00000532471 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.98■■■■□ 3.99
ME3-210ENST00000532471 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
ME3-210ENST00000532471 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.93■■■■□ 3.98
ME3-210ENST00000532471 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
ME3-210ENST00000532471 CHD1O14646 1710 aa39.85■■■■□ 3.97
ME3-210ENST00000532471 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.8■■■■□ 3.96
ME3-210ENST00000532471 PBRM1Q86U86 1689 aa39.76■■■■□ 3.96
ME3-210ENST00000532471 SYNJ2O15056 1496 aa39.75■■■■□ 3.95
ME3-210ENST00000532471 TRIM41Q8WV44 630 aa39.73■■■■□ 3.95
ME3-210ENST00000532471 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.55■■■■□ 3.92
ME3-210ENST00000532471 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.54■■■■□ 3.92
ME3-210ENST00000532471 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.54■■■■□ 3.92
ME3-210ENST00000532471 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.54■■■■□ 3.92
ME3-210ENST00000532471 ARHGEF11O15085 1522 aa39.54■■■■□ 3.92
ME3-210ENST00000532471 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.52■■■■□ 3.92
ME3-210ENST00000532471 KIF27Q86VH2 1401 aa39.45■■■■□ 3.91
ME3-210ENST00000532471 ADAMTS12P58397 1594 aa39.45■■■■□ 3.91
ME3-210ENST00000532471 GRIN2AQ12879 1464 aa39.44■■■■□ 3.9
ME3-210ENST00000532471 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.43■■■■□ 3.9
ME3-210ENST00000532471 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.39■■■■□ 3.9
ME3-210ENST00000532471 IGF1RP08069 1367 aa39.31■■■■□ 3.88
ME3-210ENST00000532471 NUP160Q12769 1436 aa39.27■■■■□ 3.88
ME3-210ENST00000532471 CEP170Q5SW79 1584 aa39.19■■■■□ 3.86
ME3-210ENST00000532471 ARAP1Q96P48 1450 aa39.18■■■■□ 3.86
ME3-210ENST00000532471 CUL7Q14999 1698 aa39.1■■■■□ 3.85
ME3-210ENST00000532471 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.09■■■■□ 3.85
ME3-210ENST00000532471 JPH4Q96JJ6 628 aa39.05■■■■□ 3.84
ME3-210ENST00000532471 SHROOM2Q13796 1616 aa38.92■■■■□ 3.82
ME3-210ENST00000532471 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
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