RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532278.1

SLC43A3-220, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SLC43A3, Length 506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-220ENST00000532278 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.05■■■■■ 6.88
SLC43A3-220ENST00000532278 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.81■■■■■ 5.88
SLC43A3-220ENST00000532278 ABCC9O60706 1549 aa50.87■■■■■ 5.73
SLC43A3-220ENST00000532278 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.89■■■■■ 5.42
SLC43A3-220ENST00000532278 NACADO15069 1562 aa48.78■■■■■ 5.4
SLC43A3-220ENST00000532278 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.46■■■■■ 5.35
SLC43A3-220ENST00000532278 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.45■■■■■ 5.35
SLC43A3-220ENST00000532278 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.29■■■■■ 5.32
SLC43A3-220ENST00000532278 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.1■■■■■ 5.29
SLC43A3-220ENST00000532278 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.77■■■■■ 5.24
SLC43A3-220ENST00000532278 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.45■■■■■ 5.19
SLC43A3-220ENST00000532278 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.41■■■■■ 5.18
SLC43A3-220ENST00000532278 SCRIBQ14160 1630 aa47.12■■■■■ 5.13
SLC43A3-220ENST00000532278 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47■■■■■ 5.11
SLC43A3-220ENST00000532278 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47■■■■■ 5.11
SLC43A3-220ENST00000532278 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
SLC43A3-220ENST00000532278 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.06■■■■■ 4.96
SLC43A3-220ENST00000532278 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.8■■■■■ 4.92
SLC43A3-220ENST00000532278 SMARCA4P51532 1647 aa45.11■■■■■ 4.81
SLC43A3-220ENST00000532278 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
SLC43A3-220ENST00000532278 NCAPD3P42695 1498 aa45.02■■■■■ 4.8
SLC43A3-220ENST00000532278 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.96■■■■■ 4.79
SLC43A3-220ENST00000532278 SMARCA2P51531 1590 aa44.9■■■■■ 4.78
SLC43A3-220ENST00000532278 HMGXB3Q12766 1538 aa44.77■■■■■ 4.76
SLC43A3-220ENST00000532278 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.74■■■■■ 4.75
SLC43A3-220ENST00000532278 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.69■■■■■ 4.74
SLC43A3-220ENST00000532278 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
SLC43A3-220ENST00000532278 WIZO95785 1651 aa44.17■■■■■ 4.66
SLC43A3-220ENST00000532278 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
SLC43A3-220ENST00000532278 NESP48681 1621 aa43.93■■■■■ 4.62
SLC43A3-220ENST00000532278 ERCC6Q03468 1493 aa43.89■■■■■ 4.62
SLC43A3-220ENST00000532278 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.87■■■■■ 4.61
SLC43A3-220ENST00000532278 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
SLC43A3-220ENST00000532278 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.66■■■■■ 4.58
SLC43A3-220ENST00000532278 CUX2O14529 1486 aa43.64■■■■■ 4.58
SLC43A3-220ENST00000532278 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.57■■■■■ 4.57
SLC43A3-220ENST00000532278 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.43■■■■■ 4.54
SLC43A3-220ENST00000532278 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
SLC43A3-220ENST00000532278 CFTRP13569 1480 aa43.34■■■■■ 4.53
SLC43A3-220ENST00000532278 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.19■■■■■ 4.51
SLC43A3-220ENST00000532278 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.13■■■■■ 4.49
SLC43A3-220ENST00000532278 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.13■■■■■ 4.49
SLC43A3-220ENST00000532278 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.11■■■■■ 4.49
SLC43A3-220ENST00000532278 WDR62O43379 1518 aa43.02■■■■■ 4.48
SLC43A3-220ENST00000532278 PRDM2Q13029 1718 aa43.01■■■■■ 4.48
SLC43A3-220ENST00000532278 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
SLC43A3-220ENST00000532278 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.66■■■■■ 4.42
SLC43A3-220ENST00000532278 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
SLC43A3-220ENST00000532278 ABCC8Q09428 1581 aa42.44■■■■■ 4.39
SLC43A3-220ENST00000532278 TOPBP1Q92547 1522 aa42.41■■■■■ 4.38
SLC43A3-220ENST00000532278 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.35■■■■■ 4.37
SLC43A3-220ENST00000532278 IFT140Q96RY7 1462 aa42.24■■■■■ 4.35
SLC43A3-220ENST00000532278 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
SLC43A3-220ENST00000532278 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
SLC43A3-220ENST00000532278 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
SLC43A3-220ENST00000532278 CUX1P39880 1505 aa41.95■■■■■ 4.31
SLC43A3-220ENST00000532278 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
SLC43A3-220ENST00000532278 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.85■■■■■ 4.29
SLC43A3-220ENST00000532278 SOGA1O94964 1423 aa41.83■■■■■ 4.29
SLC43A3-220ENST00000532278 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.8■■■■■ 4.28
SLC43A3-220ENST00000532278 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.74■■■■■ 4.274e-19■■■■■ 37.7
SLC43A3-220ENST00000532278 WDR97A6NE52 1622 aa41.73■■■■■ 4.27
SLC43A3-220ENST00000532278 OSCARQ8IYS5 282 aa41.72■■■■■ 4.27
SLC43A3-220ENST00000532278 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
SLC43A3-220ENST00000532278 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.56■■■■■ 4.24
SLC43A3-220ENST00000532278 TOP2BQ02880 1626 aa41.54■■■■■ 4.24
SLC43A3-220ENST00000532278 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.54■■■■■ 4.24
SLC43A3-220ENST00000532278 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.49■■■■■ 4.23
SLC43A3-220ENST00000532278 SYNJ1O43426 1573 aa41.46■■■■■ 4.23
SLC43A3-220ENST00000532278 GRIN2BQ13224 1484 aa41.41■■■■■ 4.22
SLC43A3-220ENST00000532278 CHD1O14646 1710 aa41.4■■■■■ 4.22
SLC43A3-220ENST00000532278 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.36■■■■■ 4.21
SLC43A3-220ENST00000532278 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
SLC43A3-220ENST00000532278 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.35■■■■■ 4.21
SLC43A3-220ENST00000532278 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.34■■■■■ 4.21
SLC43A3-220ENST00000532278 PBRM1Q86U86 1689 aa41.29■■■■■ 4.2
SLC43A3-220ENST00000532278 FBLN2P98095 1184 aa41.23■■■■■ 4.19
SLC43A3-220ENST00000532278 SYNJ2O15056 1496 aa41.19■■■■■ 4.18
SLC43A3-220ENST00000532278 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
SLC43A3-220ENST00000532278 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
SLC43A3-220ENST00000532278 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
SLC43A3-220ENST00000532278 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
SLC43A3-220ENST00000532278 ARHGEF11O15085 1522 aa41.05■■■■■ 4.16
SLC43A3-220ENST00000532278 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.99■■■■■ 4.15
SLC43A3-220ENST00000532278 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.99■■■■■ 4.15
SLC43A3-220ENST00000532278 TRIM41Q8WV44 630 aa40.97■■■■■ 4.15
SLC43A3-220ENST00000532278 ADAMTS12P58397 1594 aa40.95■■■■■ 4.15
SLC43A3-220ENST00000532278 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.88■■■■■ 4.13
SLC43A3-220ENST00000532278 GRIN2AQ12879 1464 aa40.87■■■■■ 4.13
SLC43A3-220ENST00000532278 NUP160Q12769 1436 aa40.74■■■■■ 4.11
SLC43A3-220ENST00000532278 KIF27Q86VH2 1401 aa40.73■■■■■ 4.11
SLC43A3-220ENST00000532278 ARAP1Q96P48 1450 aa40.7■■■■■ 4.11
SLC43A3-220ENST00000532278 CEP170Q5SW79 1584 aa40.66■■■■■ 4.1
SLC43A3-220ENST00000532278 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.62■■■■■ 4.09
SLC43A3-220ENST00000532278 IGF1RP08069 1367 aa40.61■■■■■ 4.09
SLC43A3-220ENST00000532278 CUL7Q14999 1698 aa40.55■■■■■ 4.08
SLC43A3-220ENST00000532278 SHROOM2Q13796 1616 aa40.48■■■■■ 4.07
SLC43A3-220ENST00000532278 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.36■■■■■ 4.05
SLC43A3-220ENST00000532278 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.35■■■■■ 4.05
SLC43A3-220ENST00000532278 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.33■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms