RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532096.1

IRF7-212, Transcript of interferon regulatory factor 7, humanhuman

TSL 2

Gene IRF7, Length 1,049 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7-212ENST00000532096 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.5■■■■■ 8.4
IRF7-212ENST00000532096 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.93■■■■■ 7.18
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IRF7-212ENST00000532096 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.29■■■■■ 6.6
IRF7-212ENST00000532096 NACADO15069 1562 aa56.25■■■■■ 6.6
IRF7-212ENST00000532096 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.25■■■■■ 6.6
IRF7-212ENST00000532096 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.21■■■■■ 6.59
IRF7-212ENST00000532096 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.98■■■■■ 6.55
IRF7-212ENST00000532096 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.84■■■■■ 6.53
IRF7-212ENST00000532096 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.13■■■■■ 6.42
IRF7-212ENST00000532096 SCRIBQ14160 1630 aa54.71■■■■■ 6.35
IRF7-212ENST00000532096 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.64■■■■■ 6.34
IRF7-212ENST00000532096 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.6■■■■■ 6.33
IRF7-212ENST00000532096 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.96■■■■■ 6.23
IRF7-212ENST00000532096 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.45■■■■■ 6.15
IRF7-212ENST00000532096 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.14■■■■■ 6.1
IRF7-212ENST00000532096 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.88■■■■■ 6.05
IRF7-212ENST00000532096 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.6■■■■■ 6.01
IRF7-212ENST00000532096 SMARCA4P51532 1647 aa52.36■■■■■ 5.97
IRF7-212ENST00000532096 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.28■■■■■ 5.96
IRF7-212ENST00000532096 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.05■■■■■ 5.92
IRF7-212ENST00000532096 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.99■■■■■ 5.91
IRF7-212ENST00000532096 NCAPD3P42695 1498 aa51.91■■■■■ 5.9
IRF7-212ENST00000532096 SMARCA2P51531 1590 aa51.9■■■■■ 5.9
IRF7-212ENST00000532096 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.83■■■■■ 5.89
IRF7-212ENST00000532096 HMGXB3Q12766 1538 aa51.69■■■■■ 5.86
IRF7-212ENST00000532096 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.54■■■■■ 5.84
IRF7-212ENST00000532096 WIZO95785 1651 aa51.53■■■■■ 5.84
IRF7-212ENST00000532096 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.51■■■■■ 5.84
IRF7-212ENST00000532096 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.95■■■■■ 5.75
IRF7-212ENST00000532096 NESP48681 1621 aa50.65■■■■■ 5.7
IRF7-212ENST00000532096 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.5■■■■■ 5.67
IRF7-212ENST00000532096 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.39■■■■■ 5.66
IRF7-212ENST00000532096 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.34■■■■■ 5.65
IRF7-212ENST00000532096 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.3■■■■■ 5.64
IRF7-212ENST00000532096 ERCC6Q03468 1493 aa50.27■■■■■ 5.64
IRF7-212ENST00000532096 CFTRP13569 1480 aa50.16■■■■■ 5.62
IRF7-212ENST00000532096 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.11■■■■■ 5.61
IRF7-212ENST00000532096 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.09■■■■■ 5.61
IRF7-212ENST00000532096 PRDM2Q13029 1718 aa49.87■■■■■ 5.57
IRF7-212ENST00000532096 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.85■■■■■ 5.57
IRF7-212ENST00000532096 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.82■■■■■ 5.57
IRF7-212ENST00000532096 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.73■■■■■ 5.55
IRF7-212ENST00000532096 CUX2O14529 1486 aa49.68■■■■■ 5.54
IRF7-212ENST00000532096 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.63■■■■■ 5.53
IRF7-212ENST00000532096 WDR62O43379 1518 aa49.5■■■■■ 5.51
IRF7-212ENST00000532096 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
IRF7-212ENST00000532096 TOPBP1Q92547 1522 aa49.08■■■■■ 5.45
IRF7-212ENST00000532096 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.04■■■■■ 5.44
IRF7-212ENST00000532096 ABCC8Q09428 1581 aa49.01■■■■■ 5.44
IRF7-212ENST00000532096 CUX1P39880 1505 aa48.82■■■■■ 5.41
IRF7-212ENST00000532096 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.67■■■■■ 5.38
IRF7-212ENST00000532096 IFT140Q96RY7 1462 aa48.67■■■■■ 5.38
IRF7-212ENST00000532096 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.6■■■■■ 5.37
IRF7-212ENST00000532096 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
IRF7-212ENST00000532096 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.52■■■■■ 5.36
IRF7-212ENST00000532096 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.5■■■■■ 5.35
IRF7-212ENST00000532096 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.48■■■■■ 5.35
IRF7-212ENST00000532096 SYNJ1O43426 1573 aa48.47■■■■■ 5.35
IRF7-212ENST00000532096 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.46■■■■■ 5.35
IRF7-212ENST00000532096 TOP2BQ02880 1626 aa48.44■■■■■ 5.35
IRF7-212ENST00000532096 SOGA1O94964 1423 aa48.43■■■■■ 5.34
IRF7-212ENST00000532096 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
IRF7-212ENST00000532096 WDR97A6NE52 1622 aa48.25■■■■■ 5.31
IRF7-212ENST00000532096 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.23■■■■■ 5.313e-7■■■□□ 14.8
IRF7-212ENST00000532096 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
IRF7-212ENST00000532096 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.12■■■■■ 5.29
IRF7-212ENST00000532096 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.96■■■■■ 5.27
IRF7-212ENST00000532096 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.9■■■■■ 5.26
IRF7-212ENST00000532096 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.89■■■■■ 5.26
IRF7-212ENST00000532096 PBRM1Q86U86 1689 aa47.86■■■■■ 5.25
IRF7-212ENST00000532096 GRIN2BQ13224 1484 aa47.85■■■■■ 5.25
IRF7-212ENST00000532096 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.79■■■■■ 5.24
IRF7-212ENST00000532096 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.71■■■■■ 5.23
IRF7-212ENST00000532096 CHD1O14646 1710 aa47.7■■■■■ 5.23
IRF7-212ENST00000532096 OSCARQ8IYS5 282 aa47.62■■■■■ 5.21
IRF7-212ENST00000532096 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.54■■■■■ 5.2
IRF7-212ENST00000532096 FBLN2P98095 1184 aa47.52■■■■■ 5.2
IRF7-212ENST00000532096 SYNJ2O15056 1496 aa47.52■■■■■ 5.2
IRF7-212ENST00000532096 TRIM41Q8WV44 630 aa47.48■■■■■ 5.19
IRF7-212ENST00000532096 ADAMTS12P58397 1594 aa47.48■■■■■ 5.19
IRF7-212ENST00000532096 KIF27Q86VH2 1401 aa47.47■■■■■ 5.19
IRF7-212ENST00000532096 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
IRF7-212ENST00000532096 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.34■■■■■ 5.17
IRF7-212ENST00000532096 IGF1RP08069 1367 aa47.28■■■■■ 5.16
IRF7-212ENST00000532096 GRIN2AQ12879 1464 aa47.27■■■■■ 5.16
IRF7-212ENST00000532096 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.21■■■■■ 5.15
IRF7-212ENST00000532096 CUL7Q14999 1698 aa47.16■■■■■ 5.14
IRF7-212ENST00000532096 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.16■■■■■ 5.14
IRF7-212ENST00000532096 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.11■■■■■ 5.13
IRF7-212ENST00000532096 CEP170Q5SW79 1584 aa47.07■■■■■ 5.12
IRF7-212ENST00000532096 NUP160Q12769 1436 aa47.05■■■■■ 5.12
IRF7-212ENST00000532096 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.99■■■■■ 5.11
IRF7-212ENST00000532096 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.94■■■■■ 5.11
IRF7-212ENST00000532096 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.94■■■■■ 5.11
IRF7-212ENST00000532096 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.94■■■■■ 5.11
IRF7-212ENST00000532096 ARHGEF11O15085 1522 aa46.93■■■■■ 5.1
IRF7-212ENST00000532096 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.75■■■■■ 5.07
IRF7-212ENST00000532096 SHROOM2Q13796 1616 aa46.71■■■■■ 5.07
IRF7-212ENST00000532096 EEA1Q15075 1411 aa46.69■■■■■ 5.06
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