RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531545.5

ROBO3-216, Transcript of roundabout guidance receptor 3, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO3, Length 473 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3-216ENST00000531545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.73■■■■□ 3.79
ROBO3-216ENST00000531545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.64■■■■□ 3.14
ROBO3-216ENST00000531545 ABCC9O60706 1549 aa34.5■■■■□ 3.11
ROBO3-216ENST00000531545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.91■■■□□ 2.86
ROBO3-216ENST00000531545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.76■■■□□ 2.83
ROBO3-216ENST00000531545 NACADO15069 1562 aa32.71■■■□□ 2.83
ROBO3-216ENST00000531545 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.28■■■□□ 2.76
ROBO3-216ENST00000531545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.17■■■□□ 2.74
ROBO3-216ENST00000531545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
ROBO3-216ENST00000531545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.08■■■□□ 2.73
ROBO3-216ENST00000531545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.07■■■□□ 2.72
ROBO3-216ENST00000531545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.96■■■□□ 2.71
ROBO3-216ENST00000531545 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.87■■■□□ 2.69
ROBO3-216ENST00000531545 SCRIBQ14160 1630 aa31.67■■■□□ 2.66
ROBO3-216ENST00000531545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.48■■■□□ 2.63
ROBO3-216ENST00000531545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.13■■■□□ 2.57
ROBO3-216ENST00000531545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
ROBO3-216ENST00000531545 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.03■■■□□ 2.56
ROBO3-216ENST00000531545 NCAPD3P42695 1498 aa30.18■■■□□ 2.42
ROBO3-216ENST00000531545 SMARCA4P51532 1647 aa30.18■■■□□ 2.42
ROBO3-216ENST00000531545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.14■■■□□ 2.42
ROBO3-216ENST00000531545 SMARCA2P51531 1590 aa30.1■■■□□ 2.41
ROBO3-216ENST00000531545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ROBO3-216ENST00000531545 HMGXB3Q12766 1538 aa29.99■■■□□ 2.39
ROBO3-216ENST00000531545 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ROBO3-216ENST00000531545 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.86■■■□□ 2.37
ROBO3-216ENST00000531545 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.83■■■□□ 2.37
ROBO3-216ENST00000531545 ERCC6Q03468 1493 aa29.82■■■□□ 2.36
ROBO3-216ENST00000531545 NESP48681 1621 aa29.67■■■□□ 2.34
ROBO3-216ENST00000531545 CUX2O14529 1486 aa29.6■■■□□ 2.33
ROBO3-216ENST00000531545 WIZO95785 1651 aa29.53■■■□□ 2.32
ROBO3-216ENST00000531545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.49■■■□□ 2.31
ROBO3-216ENST00000531545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.35■■■□□ 2.29
ROBO3-216ENST00000531545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
ROBO3-216ENST00000531545 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.31■■■□□ 2.28
ROBO3-216ENST00000531545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ROBO3-216ENST00000531545 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.29■■■□□ 2.28
ROBO3-216ENST00000531545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.28■■■□□ 2.28
ROBO3-216ENST00000531545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ROBO3-216ENST00000531545 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.07■■■□□ 2.24
ROBO3-216ENST00000531545 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.03■■■□□ 2.24
ROBO3-216ENST00000531545 CFTRP13569 1480 aa29■■■□□ 2.23
ROBO3-216ENST00000531545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29■■■□□ 2.23
ROBO3-216ENST00000531545 WDR62O43379 1518 aa28.96■■■□□ 2.23
ROBO3-216ENST00000531545 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.84■■■□□ 2.21
ROBO3-216ENST00000531545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
ROBO3-216ENST00000531545 PRDM2Q13029 1718 aa28.7■■■□□ 2.19
ROBO3-216ENST00000531545 TOPBP1Q92547 1522 aa28.46■■■□□ 2.15
ROBO3-216ENST00000531545 ABCC8Q09428 1581 aa28.41■■■□□ 2.14
ROBO3-216ENST00000531545 IFT140Q96RY7 1462 aa28.41■■■□□ 2.14
ROBO3-216ENST00000531545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.37■■■□□ 2.13
ROBO3-216ENST00000531545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
ROBO3-216ENST00000531545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
ROBO3-216ENST00000531545 OSCARQ8IYS5 282 aa28.32■■■□□ 2.12
ROBO3-216ENST00000531545 TRIM41Q8WV44 630 aa28.25■■■□□ 2.11
ROBO3-216ENST00000531545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
ROBO3-216ENST00000531545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ROBO3-216ENST00000531545 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
ROBO3-216ENST00000531545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
ROBO3-216ENST00000531545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.1■■■□□ 2.09
ROBO3-216ENST00000531545 SOGA1O94964 1423 aa28.09■■■□□ 2.09
ROBO3-216ENST00000531545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.06■■■□□ 2.08
ROBO3-216ENST00000531545 CUX1P39880 1505 aa28.05■■■□□ 2.08
ROBO3-216ENST00000531545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
ROBO3-216ENST00000531545 FBLN2P98095 1184 aa27.99■■■□□ 2.07
ROBO3-216ENST00000531545 CHD1O14646 1710 aa27.92■■■□□ 2.06
ROBO3-216ENST00000531545 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.9■■■□□ 2.06
ROBO3-216ENST00000531545 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.9■■■□□ 2.06
ROBO3-216ENST00000531545 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.9■■■□□ 2.06
ROBO3-216ENST00000531545 WDR97A6NE52 1622 aa27.89■■■□□ 2.05
ROBO3-216ENST00000531545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.87■■■□□ 2.05
ROBO3-216ENST00000531545 ARHGEF11O15085 1522 aa27.84■■■□□ 2.05
ROBO3-216ENST00000531545 GRIN2BQ13224 1484 aa27.81■■■□□ 2.04
ROBO3-216ENST00000531545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
ROBO3-216ENST00000531545 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
ROBO3-216ENST00000531545 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.75■■■□□ 2.03
ROBO3-216ENST00000531545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.72■■■□□ 2.03
ROBO3-216ENST00000531545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.71■■■□□ 2.03
ROBO3-216ENST00000531545 PBRM1Q86U86 1689 aa27.7■■■□□ 2.02
ROBO3-216ENST00000531545 SYNJ2O15056 1496 aa27.68■■■□□ 2.02
ROBO3-216ENST00000531545 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.67■■■□□ 2.02
ROBO3-216ENST00000531545 SYNJ1O43426 1573 aa27.66■■■□□ 2.02
ROBO3-216ENST00000531545 TOP2BQ02880 1626 aa27.66■■■□□ 2.02
ROBO3-216ENST00000531545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.66■■■□□ 2.02
ROBO3-216ENST00000531545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.64■■■□□ 2.02
ROBO3-216ENST00000531545 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.6■■■□□ 2.01
ROBO3-216ENST00000531545 ARAP1Q96P48 1450 aa27.57■■■□□ 2
ROBO3-216ENST00000531545 ADAMTS12P58397 1594 aa27.45■■□□□ 1.99
ROBO3-216ENST00000531545 GRIN2AQ12879 1464 aa27.44■■□□□ 1.98
ROBO3-216ENST00000531545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.4■■□□□ 1.98
ROBO3-216ENST00000531545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.39■■□□□ 1.98
ROBO3-216ENST00000531545 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ROBO3-216ENST00000531545 CEP170Q5SW79 1584 aa27.32■■□□□ 1.96
ROBO3-216ENST00000531545 NUP160Q12769 1436 aa27.31■■□□□ 1.96
ROBO3-216ENST00000531545 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.21■■□□□ 1.95
ROBO3-216ENST00000531545 KIF27Q86VH2 1401 aa27.17■■□□□ 1.94
ROBO3-216ENST00000531545 SHROOM2Q13796 1616 aa27.14■■□□□ 1.94
ROBO3-216ENST00000531545 IGF1RP08069 1367 aa27.09■■□□□ 1.93
ROBO3-216ENST00000531545 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
ROBO3-216ENST00000531545 JPH4Q96JJ6 628 aa27.07■■□□□ 1.92
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