RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531494.1

TMEM25-222, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 4

Gene TMEM25, Length 1,280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-222	ENST00000531494	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.65	■■■■□ 3.78
TMEM25-222	ENST00000531494	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.71	■■■■□ 3.15
TMEM25-222	ENST00000531494	ABCC9	O60706	1549 aa		34.26	■■■■□ 3.08
TMEM25-222	ENST00000531494	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.95	■■■□□ 2.86
TMEM25-222	ENST00000531494	NACAD	O15069	1562 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TMEM25-222	ENST00000531494	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TMEM25-222	ENST00000531494	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TMEM25-222	ENST00000531494	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
TMEM25-222	ENST00000531494	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TMEM25-222	ENST00000531494	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TMEM25-222	ENST00000531494	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.88	■■■□□ 2.69
TMEM25-222	ENST00000531494	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TMEM25-222	ENST00000531494	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TMEM25-222	ENST00000531494	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.64	■■■□□ 2.66
TMEM25-222	ENST00000531494	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TMEM25-222	ENST00000531494	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
TMEM25-222	ENST00000531494	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31	■■■□□ 2.55
TMEM25-222	ENST00000531494	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.93	■■■□□ 2.54
TMEM25-222	ENST00000531494	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.15	■■■□□ 2.42
TMEM25-222	ENST00000531494	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.15	■■■□□ 2.42
TMEM25-222	ENST00000531494	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.11	■■■□□ 2.41
TMEM25-222	ENST00000531494	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.11	■■■□□ 2.41
TMEM25-222	ENST00000531494	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.05	■■■□□ 2.4
TMEM25-222	ENST00000531494	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.01	■■■□□ 2.4
TMEM25-222	ENST00000531494	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
TMEM25-222	ENST00000531494	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.84	■■■□□ 2.37
TMEM25-222	ENST00000531494	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.79	■■■□□ 2.36
TMEM25-222	ENST00000531494	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.67	■■■□□ 2.34
TMEM25-222	ENST00000531494	CUX2	O14529	1486 aa		29.62	■■■□□ 2.33
TMEM25-222	ENST00000531494	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.52	■■■□□ 2.32
TMEM25-222	ENST00000531494	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TMEM25-222	ENST00000531494	NES	P48681	1621 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TMEM25-222	ENST00000531494	WIZ	O95785	1651 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TMEM25-222	ENST00000531494	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.26	■■■□□ 2.28
TMEM25-222	ENST00000531494	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
TMEM25-222	ENST00000531494	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TMEM25-222	ENST00000531494	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
TMEM25-222	ENST00000531494	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TMEM25-222	ENST00000531494	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TMEM25-222	ENST00000531494	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TMEM25-222	ENST00000531494	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TMEM25-222	ENST00000531494	CFTR	P13569	1480 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TMEM25-222	ENST00000531494	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TMEM25-222	ENST00000531494	WDR62	O43379	1518 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TMEM25-222	ENST00000531494	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TMEM25-222	ENST00000531494	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TMEM25-222	ENST00000531494	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TMEM25-222	ENST00000531494	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
TMEM25-222	ENST00000531494	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TMEM25-222	ENST00000531494	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TMEM25-222	ENST00000531494	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TMEM25-222	ENST00000531494	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TMEM25-222	ENST00000531494	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TMEM25-222	ENST00000531494	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
TMEM25-222	ENST00000531494	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
TMEM25-222	ENST00000531494	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
TMEM25-222	ENST00000531494	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TMEM25-222	ENST00000531494	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
TMEM25-222	ENST00000531494	SOGA1	O94964	1423 aa		28.02	■■■□□ 2.08
TMEM25-222	ENST00000531494	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TMEM25-222	ENST00000531494	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.95	■■■□□ 2.06
TMEM25-222	ENST00000531494	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TMEM25-222	ENST00000531494	CUX1	P39880	1505 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TMEM25-222	ENST00000531494	FBLN2	P98095	1184 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TMEM25-222	ENST00000531494	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TMEM25-222	ENST00000531494	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TMEM25-222	ENST00000531494	CHD1	O14646	1710 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM25-222	ENST00000531494	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TMEM25-222	ENST00000531494	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TMEM25-222	ENST00000531494	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TMEM25-222	ENST00000531494	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM25-222	ENST00000531494	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM25-222	ENST00000531494	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM25-222	ENST00000531494	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM25-222	ENST00000531494	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03
TMEM25-222	ENST00000531494	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TMEM25-222	ENST00000531494	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM25-222	ENST00000531494	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TMEM25-222	ENST00000531494	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TMEM25-222	ENST00000531494	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM25-222	ENST00000531494	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TMEM25-222	ENST00000531494	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TMEM25-222	ENST00000531494	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TMEM25-222	ENST00000531494	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TMEM25-222	ENST00000531494	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.53	■■■□□ 2
TMEM25-222	ENST00000531494	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM25-222	ENST00000531494	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.43	■■□□□ 1.98
TMEM25-222	ENST00000531494	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.4	■■□□□ 1.98
TMEM25-222	ENST00000531494	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.4	■■□□□ 1.98
TMEM25-222	ENST00000531494	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.39	■■□□□ 1.98
TMEM25-222	ENST00000531494	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.38	■■□□□ 1.97
TMEM25-222	ENST00000531494	NUP160	Q12769	1436 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TMEM25-222	ENST00000531494	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	27.25	■■□□□ 1.95
TMEM25-222	ENST00000531494	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.22	■■□□□ 1.95
TMEM25-222	ENST00000531494	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.17	■■□□□ 1.94
TMEM25-222	ENST00000531494	CUL7	Q14999	1698 aa		27.12	■■□□□ 1.93
TMEM25-222	ENST00000531494	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.09	■■□□□ 1.93
TMEM25-222	ENST00000531494	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.02	■■□□□ 1.92
TMEM25-222	ENST00000531494	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27	■■□□□ 1.91
TMEM25-222	ENST00000531494	IGF1R	P08069	1367 aa		26.99	■■□□□ 1.91

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