RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.96■■■■■ 4.95
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.91■■■■■ 4.14
PTPRU-211ENST00000531385 ABCC9O60706 1549 aa40.32■■■■■ 4.05
PTPRU-211ENST00000531385 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.6■■■■□ 3.77
PTPRU-211ENST00000531385 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.52■■■■□ 3.76
PTPRU-211ENST00000531385 NACADO15069 1562 aa38.48■■■■□ 3.75
PTPRU-211ENST00000531385 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
PTPRU-211ENST00000531385 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.12■■■■□ 3.69
PTPRU-211ENST00000531385 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.92■■■■□ 3.66
PTPRU-211ENST00000531385 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.84■■■■□ 3.65
PTPRU-211ENST00000531385 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.65■■■■□ 3.62
PTPRU-211ENST00000531385 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.51■■■■□ 3.6
PTPRU-211ENST00000531385 SCRIBQ14160 1630 aa37.45■■■■□ 3.59
PTPRU-211ENST00000531385 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.18■■■■□ 3.54
PTPRU-211ENST00000531385 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.92■■■■□ 3.5
PTPRU-211ENST00000531385 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
PTPRU-211ENST00000531385 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.43■■■■□ 3.42
PTPRU-211ENST00000531385 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.19■■■■□ 3.38
PTPRU-211ENST00000531385 SMARCA4P51532 1647 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRU-211ENST00000531385 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
PTPRU-211ENST00000531385 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.56■■■■□ 3.28
PTPRU-211ENST00000531385 NCAPD3P42695 1498 aa35.5■■■■□ 3.27
PTPRU-211ENST00000531385 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.48■■■■□ 3.27
PTPRU-211ENST00000531385 SMARCA2P51531 1590 aa35.47■■■■□ 3.27
PTPRU-211ENST00000531385 HMGXB3Q12766 1538 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPRU-211ENST00000531385 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.31■■■■□ 3.24
PTPRU-211ENST00000531385 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
PTPRU-211ENST00000531385 WIZO95785 1651 aa35.11■■■■□ 3.21
PTPRU-211ENST00000531385 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
PTPRU-211ENST00000531385 NESP48681 1621 aa34.86■■■■□ 3.17
PTPRU-211ENST00000531385 ERCC6Q03468 1493 aa34.71■■■■□ 3.15
PTPRU-211ENST00000531385 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
PTPRU-211ENST00000531385 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.62■■■■□ 3.13
PTPRU-211ENST00000531385 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.48■■■■□ 3.11
PTPRU-211ENST00000531385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.44■■■■□ 3.1
PTPRU-211ENST00000531385 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.36■■■■□ 3.09
PTPRU-211ENST00000531385 CUX2O14529 1486 aa34.34■■■■□ 3.09
PTPRU-211ENST00000531385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.27■■■■□ 3.08
PTPRU-211ENST00000531385 CFTRP13569 1480 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPRU-211ENST00000531385 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.14■■■■□ 3.06
PTPRU-211ENST00000531385 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.1■■■■□ 3.05
PTPRU-211ENST00000531385 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.08■■■■□ 3.05
PTPRU-211ENST00000531385 PRDM2Q13029 1718 aa34.02■■■■□ 3.04
PTPRU-211ENST00000531385 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
PTPRU-211ENST00000531385 WDR62O43379 1518 aa33.99■■■■□ 3.03
PTPRU-211ENST00000531385 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
PTPRU-211ENST00000531385 TOPBP1Q92547 1522 aa33.58■■■□□ 2.97
PTPRU-211ENST00000531385 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.51■■■□□ 2.95
PTPRU-211ENST00000531385 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.5■■■□□ 2.95
PTPRU-211ENST00000531385 ABCC8Q09428 1581 aa33.43■■■□□ 2.94
PTPRU-211ENST00000531385 IFT140Q96RY7 1462 aa33.36■■■□□ 2.93
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
PTPRU-211ENST00000531385 CUX1P39880 1505 aa33.3■■■□□ 2.92
PTPRU-211ENST00000531385 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
PTPRU-211ENST00000531385 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
PTPRU-211ENST00000531385 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.19■■■□□ 2.9
PTPRU-211ENST00000531385 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.19■■■□□ 2.9
PTPRU-211ENST00000531385 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
PTPRU-211ENST00000531385 SOGA1O94964 1423 aa33.11■■■□□ 2.89
PTPRU-211ENST00000531385 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.09■■■□□ 2.89
PTPRU-211ENST00000531385 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
PTPRU-211ENST00000531385 SYNJ1O43426 1573 aa32.96■■■□□ 2.87
PTPRU-211ENST00000531385 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.95■■■□□ 2.87
PTPRU-211ENST00000531385 WDR97A6NE52 1622 aa32.95■■■□□ 2.86
PTPRU-211ENST00000531385 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.92■■■□□ 2.86
PTPRU-211ENST00000531385 TOP2BQ02880 1626 aa32.91■■■□□ 2.86
PTPRU-211ENST00000531385 OSCARQ8IYS5 282 aa32.86■■■□□ 2.85
PTPRU-211ENST00000531385 CHD1O14646 1710 aa32.82■■■□□ 2.84
PTPRU-211ENST00000531385 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.81■■■□□ 2.84
PTPRU-211ENST00000531385 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.8■■■□□ 2.84
PTPRU-211ENST00000531385 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.74■■■□□ 2.83
PTPRU-211ENST00000531385 PBRM1Q86U86 1689 aa32.74■■■□□ 2.83
PTPRU-211ENST00000531385 GRIN2BQ13224 1484 aa32.74■■■□□ 2.83
PTPRU-211ENST00000531385 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.74■■■□□ 2.83
PTPRU-211ENST00000531385 FBLN2P98095 1184 aa32.72■■■□□ 2.83
PTPRU-211ENST00000531385 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
PTPRU-211ENST00000531385 SYNJ2O15056 1496 aa32.54■■■□□ 2.8
PTPRU-211ENST00000531385 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
PTPRU-211ENST00000531385 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.49■■■□□ 2.79
PTPRU-211ENST00000531385 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.49■■■□□ 2.79
PTPRU-211ENST00000531385 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.49■■■□□ 2.79
PTPRU-211ENST00000531385 ADAMTS12P58397 1594 aa32.46■■■□□ 2.79
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM41Q8WV44 630 aa32.46■■■□□ 2.79
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGEF11O15085 1522 aa32.44■■■□□ 2.78
PTPRU-211ENST00000531385 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.41■■■□□ 2.78
PTPRU-211ENST00000531385 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.39■■■□□ 2.78
PTPRU-211ENST00000531385 GRIN2AQ12879 1464 aa32.35■■■□□ 2.77
PTPRU-211ENST00000531385 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.32■■■□□ 2.76
PTPRU-211ENST00000531385 KIF27Q86VH2 1401 aa32.25■■■□□ 2.75
PTPRU-211ENST00000531385 CEP170Q5SW79 1584 aa32.24■■■□□ 2.75
PTPRU-211ENST00000531385 ARAP1Q96P48 1450 aa32.2■■■□□ 2.75
PTPRU-211ENST00000531385 NUP160Q12769 1436 aa32.19■■■□□ 2.74
PTPRU-211ENST00000531385 IGF1RP08069 1367 aa32.16■■■□□ 2.74
PTPRU-211ENST00000531385 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.13■■■□□ 2.73
PTPRU-211ENST00000531385 CUL7Q14999 1698 aa32.08■■■□□ 2.73
PTPRU-211ENST00000531385 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.04■■■□□ 2.72
PTPRU-211ENST00000531385 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.03■■■□□ 2.72
PTPRU-211ENST00000531385 SHROOM2Q13796 1616 aa31.98■■■□□ 2.71
PTPRU-211ENST00000531385 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.96■■■□□ 2.71
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