RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530939.5

CHID1-217, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene CHID1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-217ENST00000530939 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.21■■■■■ 8.03
CHID1-217ENST00000530939 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.28■■■■■ 6.92
CHID1-217ENST00000530939 ABCC9O60706 1549 aa57.68■■■■■ 6.82
CHID1-217ENST00000530939 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.17■■■■■ 6.42
CHID1-217ENST00000530939 NACADO15069 1562 aa54.92■■■■■ 6.38
CHID1-217ENST00000530939 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.88■■■■■ 6.38
CHID1-217ENST00000530939 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.29■■■■■ 6.28
CHID1-217ENST00000530939 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.17■■■■■ 6.26
CHID1-217ENST00000530939 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.01■■■■■ 6.24
CHID1-217ENST00000530939 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.86■■■■■ 6.21
CHID1-217ENST00000530939 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.8■■■■■ 6.2
CHID1-217ENST00000530939 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.5■■■■■ 6.16
CHID1-217ENST00000530939 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.46■■■■■ 6.15
CHID1-217ENST00000530939 SCRIBQ14160 1630 aa53.21■■■■■ 6.11
CHID1-217ENST00000530939 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.8■■■■■ 6.04
CHID1-217ENST00000530939 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.17■■■■■ 5.94
CHID1-217ENST00000530939 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.14■■■■■ 5.94
CHID1-217ENST00000530939 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.86■■■■■ 5.89
CHID1-217ENST00000530939 SMARCA4P51532 1647 aa50.77■■■■■ 5.72
CHID1-217ENST00000530939 NCAPD3P42695 1498 aa50.65■■■■■ 5.7
CHID1-217ENST00000530939 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.61■■■■■ 5.69
CHID1-217ENST00000530939 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.6■■■■■ 5.69
CHID1-217ENST00000530939 SMARCA2P51531 1590 aa50.54■■■■■ 5.68
CHID1-217ENST00000530939 HMGXB3Q12766 1538 aa50.36■■■■■ 5.65
CHID1-217ENST00000530939 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.27■■■■■ 5.64
CHID1-217ENST00000530939 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.21■■■■■ 5.63
CHID1-217ENST00000530939 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.2■■■■■ 5.63
CHID1-217ENST00000530939 ERCC6Q03468 1493 aa49.78■■■■■ 5.56
CHID1-217ENST00000530939 WIZO95785 1651 aa49.76■■■■■ 5.56
CHID1-217ENST00000530939 NESP48681 1621 aa49.72■■■■■ 5.55
CHID1-217ENST00000530939 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.46■■■■■ 5.51
CHID1-217ENST00000530939 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.43■■■■■ 5.5
CHID1-217ENST00000530939 CUX2O14529 1486 aa49.4■■■■■ 5.5
CHID1-217ENST00000530939 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.17■■■■■ 5.46
CHID1-217ENST00000530939 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.16■■■■■ 5.46
CHID1-217ENST00000530939 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.15■■■■■ 5.46
CHID1-217ENST00000530939 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.13■■■■■ 5.45
CHID1-217ENST00000530939 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.09■■■■■ 5.45
CHID1-217ENST00000530939 CFTRP13569 1480 aa48.73■■■■■ 5.39
CHID1-217ENST00000530939 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.7■■■■■ 5.39
CHID1-217ENST00000530939 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.65■■■■■ 5.38
CHID1-217ENST00000530939 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.64■■■■■ 5.38
CHID1-217ENST00000530939 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.62■■■■■ 5.37
CHID1-217ENST00000530939 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.55■■■■■ 5.36
CHID1-217ENST00000530939 WDR62O43379 1518 aa48.54■■■■■ 5.36
CHID1-217ENST00000530939 PRDM2Q13029 1718 aa48.44■■■■■ 5.34
CHID1-217ENST00000530939 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
CHID1-217ENST00000530939 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
CHID1-217ENST00000530939 TOPBP1Q92547 1522 aa47.79■■■■■ 5.24
CHID1-217ENST00000530939 ABCC8Q09428 1581 aa47.71■■■■■ 5.23
CHID1-217ENST00000530939 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.69■■■■■ 5.22
CHID1-217ENST00000530939 IFT140Q96RY7 1462 aa47.63■■■■■ 5.22
CHID1-217ENST00000530939 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.19
CHID1-217ENST00000530939 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
CHID1-217ENST00000530939 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.32■■■■■ 5.17
CHID1-217ENST00000530939 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
CHID1-217ENST00000530939 OSCARQ8IYS5 282 aa47.27■■■■■ 5.16
CHID1-217ENST00000530939 CUX1P39880 1505 aa47.2■■■■■ 5.15
CHID1-217ENST00000530939 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.17■■■■■ 5.14
CHID1-217ENST00000530939 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.15■■■■■ 5.142e-6■■■■■ 33.3
CHID1-217ENST00000530939 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.15■■■■■ 5.14
CHID1-217ENST00000530939 SOGA1O94964 1423 aa47.14■■■■■ 5.14
CHID1-217ENST00000530939 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.97■■■■■ 5.11
CHID1-217ENST00000530939 CHD1O14646 1710 aa46.89■■■■■ 5.1
CHID1-217ENST00000530939 WDR97A6NE52 1622 aa46.87■■■■■ 5.09
CHID1-217ENST00000530939 TRIM41Q8WV44 630 aa46.87■■■■■ 5.09
CHID1-217ENST00000530939 FBLN2P98095 1184 aa46.78■■■■■ 5.08
CHID1-217ENST00000530939 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.71■■■■■ 5.07
CHID1-217ENST00000530939 GRIN2BQ13224 1484 aa46.65■■■■■ 5.06
CHID1-217ENST00000530939 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.65■■■■■ 5.06
CHID1-217ENST00000530939 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.65■■■■■ 5.06
CHID1-217ENST00000530939 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.63■■■■■ 5.06
CHID1-217ENST00000530939 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.63■■■■■ 5.06
CHID1-217ENST00000530939 TOP2BQ02880 1626 aa46.63■■■■■ 5.06
CHID1-217ENST00000530939 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.63■■■■■ 5.06
CHID1-217ENST00000530939 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.62■■■■■ 5.05
CHID1-217ENST00000530939 SYNJ1O43426 1573 aa46.61■■■■■ 5.05
CHID1-217ENST00000530939 PBRM1Q86U86 1689 aa46.61■■■■■ 5.05
CHID1-217ENST00000530939 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.58■■■■■ 5.05
CHID1-217ENST00000530939 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.58■■■■■ 5.05
CHID1-217ENST00000530939 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.53■■■■■ 5.04
CHID1-217ENST00000530939 ARHGEF11O15085 1522 aa46.51■■■■■ 5.04
CHID1-217ENST00000530939 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.5■■■■■ 5.03
CHID1-217ENST00000530939 SYNJ2O15056 1496 aa46.42■■■■■ 5.02
CHID1-217ENST00000530939 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.27■■■■■ 5
CHID1-217ENST00000530939 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.16■■■■■ 4.98
CHID1-217ENST00000530939 ADAMTS12P58397 1594 aa46.14■■■■■ 4.98
CHID1-217ENST00000530939 ARAP1Q96P48 1450 aa46.09■■■■■ 4.97
CHID1-217ENST00000530939 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.06■■■■■ 4.96
CHID1-217ENST00000530939 GRIN2AQ12879 1464 aa46.06■■■■■ 4.96
CHID1-217ENST00000530939 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.01■■■■■ 4.96
CHID1-217ENST00000530939 CEP170Q5SW79 1584 aa45.88■■■■■ 4.94
CHID1-217ENST00000530939 NUP160Q12769 1436 aa45.84■■■■■ 4.93
CHID1-217ENST00000530939 KIF27Q86VH2 1401 aa45.73■■■■■ 4.91
CHID1-217ENST00000530939 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.63■■■■■ 4.9
CHID1-217ENST00000530939 SHROOM2Q13796 1616 aa45.6■■■■■ 4.89
CHID1-217ENST00000530939 IGF1RP08069 1367 aa45.58■■■■■ 4.89
CHID1-217ENST00000530939 CUL7Q14999 1698 aa45.57■■■■■ 4.89
CHID1-217ENST00000530939 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
CHID1-217ENST00000530939 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.47■■■■■ 4.87
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