RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530892.5

TM7SF2-219, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

TSL 2

Gene TM7SF2, Length 691 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-219ENST00000530892 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.26■■■■■ 6.44
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TM7SF2-219ENST00000530892 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.65■■■■■ 5.54
TM7SF2-219ENST00000530892 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.65■■■■■ 5.22
TM7SF2-219ENST00000530892 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.55■■■■■ 5.2
TM7SF2-219ENST00000530892 NACADO15069 1562 aa47.11■■■■■ 5.13
TM7SF2-219ENST00000530892 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.07■■■■■ 5.13
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TM7SF2-219ENST00000530892 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.47■■■■■ 5.03
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TM7SF2-219ENST00000530892 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.42■■■■■ 4.86
TM7SF2-219ENST00000530892 SCRIBQ14160 1630 aa45.37■■■■■ 4.85
TM7SF2-219ENST00000530892 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.34■■■■■ 4.85
TM7SF2-219ENST00000530892 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.31■■■■■ 4.84
TM7SF2-219ENST00000530892 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
TM7SF2-219ENST00000530892 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44■■■■■ 4.63
TM7SF2-219ENST00000530892 NCAPD3P42695 1498 aa43.54■■■■■ 4.56
TM7SF2-219ENST00000530892 ERCC6Q03468 1493 aa43.43■■■■■ 4.54
TM7SF2-219ENST00000530892 CUX2O14529 1486 aa43.41■■■■■ 4.54
TM7SF2-219ENST00000530892 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.38■■■■■ 4.53
TM7SF2-219ENST00000530892 SMARCA4P51532 1647 aa43.17■■■■■ 4.5
TM7SF2-219ENST00000530892 SMARCA2P51531 1590 aa43.16■■■■■ 4.5
TM7SF2-219ENST00000530892 HMGXB3Q12766 1538 aa43.11■■■■■ 4.49
TM7SF2-219ENST00000530892 NESP48681 1621 aa43.08■■■■■ 4.49
TM7SF2-219ENST00000530892 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
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TM7SF2-219ENST00000530892 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.7■■■■■ 4.43
TM7SF2-219ENST00000530892 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.61■■■■■ 4.41
TM7SF2-219ENST00000530892 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
TM7SF2-219ENST00000530892 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.58■■■■■ 4.41
TM7SF2-219ENST00000530892 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.42■■■■■ 4.38
TM7SF2-219ENST00000530892 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.41■■■■■ 4.38
TM7SF2-219ENST00000530892 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.24■■■■■ 4.35
TM7SF2-219ENST00000530892 WIZO95785 1651 aa42.07■■■■■ 4.33
TM7SF2-219ENST00000530892 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.06■■■■■ 4.32
TM7SF2-219ENST00000530892 TRIM41Q8WV44 630 aa41.99■■■■■ 4.31
TM7SF2-219ENST00000530892 WDR62O43379 1518 aa41.94■■■■■ 4.3
TM7SF2-219ENST00000530892 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.81■■■■■ 4.28
TM7SF2-219ENST00000530892 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.76■■■■■ 4.28
TM7SF2-219ENST00000530892 CFTRP13569 1480 aa41.63■■■■■ 4.25
TM7SF2-219ENST00000530892 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
TM7SF2-219ENST00000530892 OSCARQ8IYS5 282 aa41.48■■■■■ 4.23
TM7SF2-219ENST00000530892 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
TM7SF2-219ENST00000530892 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.23
TM7SF2-219ENST00000530892 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.08■■■■■ 4.17
TM7SF2-219ENST00000530892 PRDM2Q13029 1718 aa41.06■■■■■ 4.16
TM7SF2-219ENST00000530892 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
TM7SF2-219ENST00000530892 IFT140Q96RY7 1462 aa40.99■■■■■ 4.15
TM7SF2-219ENST00000530892 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.91■■■■■ 4.14
TM7SF2-219ENST00000530892 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.91■■■■■ 4.14
TM7SF2-219ENST00000530892 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.91■■■■■ 4.14
TM7SF2-219ENST00000530892 TOPBP1Q92547 1522 aa40.91■■■■■ 4.14
TM7SF2-219ENST00000530892 ARHGEF11O15085 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
TM7SF2-219ENST00000530892 ABCC8Q09428 1581 aa40.73■■■■■ 4.11
TM7SF2-219ENST00000530892 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.11
TM7SF2-219ENST00000530892 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.67■■■■■ 4.1
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TM7SF2-219ENST00000530892 FBLN2P98095 1184 aa40.54■■■■■ 4.08
TM7SF2-219ENST00000530892 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
TM7SF2-219ENST00000530892 CHD1O14646 1710 aa40.48■■■■■ 4.07
TM7SF2-219ENST00000530892 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
TM7SF2-219ENST00000530892 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.39■■■■■ 4.06
TM7SF2-219ENST00000530892 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
TM7SF2-219ENST00000530892 ARAP1Q96P48 1450 aa40.33■■■■■ 4.05
TM7SF2-219ENST00000530892 SOGA1O94964 1423 aa40.32■■■■■ 4.04
TM7SF2-219ENST00000530892 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
TM7SF2-219ENST00000530892 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.16■■■■■ 4.02
TM7SF2-219ENST00000530892 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.15■■■■■ 4.02
TM7SF2-219ENST00000530892 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
TM7SF2-219ENST00000530892 CUX1P39880 1505 aa40.05■■■■■ 4
TM7SF2-219ENST00000530892 WDR97A6NE52 1622 aa40■■■■□ 3.99
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TM7SF2-219ENST00000530892 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
TM7SF2-219ENST00000530892 GRIN2BQ13224 1484 aa39.96■■■■□ 3.99
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TM7SF2-219ENST00000530892 SYNJ2O15056 1496 aa39.87■■■■□ 3.97
TM7SF2-219ENST00000530892 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.79■■■■□ 3.96
TM7SF2-219ENST00000530892 PBRM1Q86U86 1689 aa39.72■■■■□ 3.95
TM7SF2-219ENST00000530892 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.64■■■■□ 3.94
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TM7SF2-219ENST00000530892 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
TM7SF2-219ENST00000530892 GRIN2AQ12879 1464 aa39.44■■■■□ 3.9
TM7SF2-219ENST00000530892 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.43■■■■□ 3.9
TM7SF2-219ENST00000530892 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.43■■■■□ 3.95e-6■■■■■ 29.2
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TM7SF2-219ENST00000530892 ADAMTS12P58397 1594 aa39.33■■■■□ 3.89
TM7SF2-219ENST00000530892 CEP170Q5SW79 1584 aa39.33■■■■□ 3.89
TM7SF2-219ENST00000530892 NUP160Q12769 1436 aa39.31■■■■□ 3.88
TM7SF2-219ENST00000530892 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.25■■■■□ 3.87
TM7SF2-219ENST00000530892 TOP2BQ02880 1626 aa39.24■■■■□ 3.87
TM7SF2-219ENST00000530892 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.22■■■■□ 3.87
TM7SF2-219ENST00000530892 SHROOM2Q13796 1616 aa39.14■■■■□ 3.86
TM7SF2-219ENST00000530892 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.11■■■■□ 3.85
TM7SF2-219ENST00000530892 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
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TM7SF2-219ENST00000530892 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.88■■■■□ 3.81
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