RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530528.1

MKNK1-223, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 2

Gene MKNK1, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-223	ENST00000530528	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.18	■■■■■ 4.5
MKNK1-223	ENST00000530528	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		38.69	■■■■□ 3.78
MKNK1-223	ENST00000530528	ABCC9	O60706	1549 aa		38.57	■■■■□ 3.76
MKNK1-223	ENST00000530528	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.74	■■■■□ 3.47
MKNK1-223	ENST00000530528	NACAD	O15069	1562 aa		36.5	■■■■□ 3.43
MKNK1-223	ENST00000530528	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.42	■■■■□ 3.42
MKNK1-223	ENST00000530528	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.03	■■■■□ 3.36
MKNK1-223	ENST00000530528	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.03	■■■■□ 3.36
MKNK1-223	ENST00000530528	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.01	■■■■□ 3.36
MKNK1-223	ENST00000530528	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.94	■■■■□ 3.34
MKNK1-223	ENST00000530528	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.83	■■■■□ 3.33
MKNK1-223	ENST00000530528	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.71	■■■■□ 3.31
MKNK1-223	ENST00000530528	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.63	■■■■□ 3.29
MKNK1-223	ENST00000530528	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.33	■■■■□ 3.25
MKNK1-223	ENST00000530528	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.12	■■■■□ 3.21
MKNK1-223	ENST00000530528	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.84	■■■■□ 3.17
MKNK1-223	ENST00000530528	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.79	■■■■□ 3.16
MKNK1-223	ENST00000530528	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.7	■■■■□ 3.15
MKNK1-223	ENST00000530528	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MKNK1-223	ENST00000530528	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MKNK1-223	ENST00000530528	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.64	■■■□□ 2.98
MKNK1-223	ENST00000530528	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.55	■■■□□ 2.96
MKNK1-223	ENST00000530528	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
MKNK1-223	ENST00000530528	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.48	■■■□□ 2.95
MKNK1-223	ENST00000530528	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
MKNK1-223	ENST00000530528	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.31	■■■□□ 2.92
MKNK1-223	ENST00000530528	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.3	■■■□□ 2.92
MKNK1-223	ENST00000530528	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.26	■■■□□ 2.92
MKNK1-223	ENST00000530528	NES	P48681	1621 aa		33.2	■■■□□ 2.9
MKNK1-223	ENST00000530528	CUX2	O14529	1486 aa		33.11	■■■□□ 2.89
MKNK1-223	ENST00000530528	WIZ	O95785	1651 aa		32.96	■■■□□ 2.87
MKNK1-223	ENST00000530528	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.92	■■■□□ 2.86
MKNK1-223	ENST00000530528	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.9	■■■□□ 2.86
MKNK1-223	ENST00000530528	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
MKNK1-223	ENST00000530528	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MKNK1-223	ENST00000530528	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.7	■■■□□ 2.83
MKNK1-223	ENST00000530528	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MKNK1-223	ENST00000530528	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
MKNK1-223	ENST00000530528	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MKNK1-223	ENST00000530528	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MKNK1-223	ENST00000530528	WDR62	O43379	1518 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MKNK1-223	ENST00000530528	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MKNK1-223	ENST00000530528	CFTR	P13569	1480 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MKNK1-223	ENST00000530528	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MKNK1-223	ENST00000530528	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MKNK1-223	ENST00000530528	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MKNK1-223	ENST00000530528	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
MKNK1-223	ENST00000530528	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.76	■■■□□ 2.68
MKNK1-223	ENST00000530528	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.69	■■■□□ 2.66
MKNK1-223	ENST00000530528	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
MKNK1-223	ENST00000530528	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MKNK1-223	ENST00000530528	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MKNK1-223	ENST00000530528	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.62	■■■□□ 2.65
MKNK1-223	ENST00000530528	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.6	■■■□□ 2.65
MKNK1-223	ENST00000530528	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.64
MKNK1-223	ENST00000530528	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
MKNK1-223	ENST00000530528	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
MKNK1-223	ENST00000530528	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.4	■■■□□ 2.62	1e-8	■■■■■ 42.9
MKNK1-223	ENST00000530528	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
MKNK1-223	ENST00000530528	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MKNK1-223	ENST00000530528	CHD1	O14646	1710 aa		31.3	■■■□□ 2.6
MKNK1-223	ENST00000530528	CUX1	P39880	1505 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MKNK1-223	ENST00000530528	SOGA1	O94964	1423 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MKNK1-223	ENST00000530528	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.28	■■■□□ 2.6
MKNK1-223	ENST00000530528	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MKNK1-223	ENST00000530528	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MKNK1-223	ENST00000530528	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MKNK1-223	ENST00000530528	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
MKNK1-223	ENST00000530528	FBLN2	P98095	1184 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MKNK1-223	ENST00000530528	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MKNK1-223	ENST00000530528	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.1	■■■□□ 2.57
MKNK1-223	ENST00000530528	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.08	■■■□□ 2.57
MKNK1-223	ENST00000530528	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.99	■■■□□ 2.55
MKNK1-223	ENST00000530528	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.97	■■■□□ 2.55
MKNK1-223	ENST00000530528	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.96	■■■□□ 2.55
MKNK1-223	ENST00000530528	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.92	■■■□□ 2.54
MKNK1-223	ENST00000530528	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.91	■■■□□ 2.54
MKNK1-223	ENST00000530528	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.91	■■■□□ 2.54
MKNK1-223	ENST00000530528	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.91	■■■□□ 2.54
MKNK1-223	ENST00000530528	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.88	■■■□□ 2.53
MKNK1-223	ENST00000530528	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.88	■■■□□ 2.53
MKNK1-223	ENST00000530528	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.87	■■■□□ 2.53
MKNK1-223	ENST00000530528	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.87	■■■□□ 2.53
MKNK1-223	ENST00000530528	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.86	■■■□□ 2.53
MKNK1-223	ENST00000530528	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.84	■■■□□ 2.53
MKNK1-223	ENST00000530528	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.81	■■■□□ 2.52
MKNK1-223	ENST00000530528	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.8	■■■□□ 2.52
MKNK1-223	ENST00000530528	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.64	■■■□□ 2.5
MKNK1-223	ENST00000530528	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.6	■■■□□ 2.49
MKNK1-223	ENST00000530528	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.53	■■■□□ 2.48
MKNK1-223	ENST00000530528	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.52	■■■□□ 2.48
MKNK1-223	ENST00000530528	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.52	■■■□□ 2.48
MKNK1-223	ENST00000530528	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.51	■■■□□ 2.47
MKNK1-223	ENST00000530528	NUP160	Q12769	1436 aa		30.47	■■■□□ 2.47
MKNK1-223	ENST00000530528	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		30.46	■■■□□ 2.47
MKNK1-223	ENST00000530528	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30.36	■■■□□ 2.45
MKNK1-223	ENST00000530528	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.2	■■■□□ 2.42
MKNK1-223	ENST00000530528	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.19	■■■□□ 2.42
MKNK1-223	ENST00000530528	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.18	■■■□□ 2.42
MKNK1-223	ENST00000530528	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.17	■■■□□ 2.42

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