RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.46■■■■■ 6.63
PACSIN3-207ENST00000530513 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.8■■■■■ 5.72
PACSIN3-207ENST00000530513 ABCC9O60706 1549 aa50.72■■■■■ 5.71
PACSIN3-207ENST00000530513 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.28■■■■■ 5.32
PACSIN3-207ENST00000530513 NACADO15069 1562 aa47.92■■■■■ 5.26
PACSIN3-207ENST00000530513 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.51■■■■■ 5.2
PACSIN3-207ENST00000530513 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.47■■■■■ 5.19
PACSIN3-207ENST00000530513 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.39■■■■■ 5.18
PACSIN3-207ENST00000530513 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.23■■■■■ 5.15
PACSIN3-207ENST00000530513 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.11■■■■■ 5.139e-7■□□□□ 8.3
PACSIN3-207ENST00000530513 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.94■■■■■ 5.11
PACSIN3-207ENST00000530513 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
PACSIN3-207ENST00000530513 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.64■■■■■ 5.06
PACSIN3-207ENST00000530513 SCRIBQ14160 1630 aa46.28■■■■■ 5
PACSIN3-207ENST00000530513 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.23■■■■■ 4.99
PACSIN3-207ENST00000530513 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.88■■■■■ 4.93
PACSIN3-207ENST00000530513 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
PACSIN3-207ENST00000530513 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.67■■■■■ 4.9
PACSIN3-207ENST00000530513 NCAPD3P42695 1498 aa44.18■■■■■ 4.66
PACSIN3-207ENST00000530513 SMARCA4P51532 1647 aa44.13■■■■■ 4.65
PACSIN3-207ENST00000530513 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.08■■■■■ 4.65
PACSIN3-207ENST00000530513 SMARCA2P51531 1590 aa43.98■■■■■ 4.63
PACSIN3-207ENST00000530513 HMGXB3Q12766 1538 aa43.95■■■■■ 4.63
PACSIN3-207ENST00000530513 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
PACSIN3-207ENST00000530513 ERCC6Q03468 1493 aa43.76■■■■■ 4.6
PACSIN3-207ENST00000530513 CUX2O14529 1486 aa43.7■■■■■ 4.59
PACSIN3-207ENST00000530513 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.67■■■■■ 4.58
PACSIN3-207ENST00000530513 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
PACSIN3-207ENST00000530513 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.6■■■■■ 4.57
PACSIN3-207ENST00000530513 NESP48681 1621 aa43.59■■■■■ 4.57
PACSIN3-207ENST00000530513 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.53■■■■■ 4.56
PACSIN3-207ENST00000530513 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.28■■■■■ 4.52
PACSIN3-207ENST00000530513 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
PACSIN3-207ENST00000530513 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.14■■■■■ 4.5
PACSIN3-207ENST00000530513 WIZO95785 1651 aa43.07■■■■■ 4.49
PACSIN3-207ENST00000530513 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.92■■■■■ 4.46
PACSIN3-207ENST00000530513 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.8■■■■■ 4.44
PACSIN3-207ENST00000530513 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.63■■■■■ 4.42
PACSIN3-207ENST00000530513 WDR62O43379 1518 aa42.58■■■■■ 4.41
PACSIN3-207ENST00000530513 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
PACSIN3-207ENST00000530513 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
PACSIN3-207ENST00000530513 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.46■■■■■ 4.39
PACSIN3-207ENST00000530513 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.4■■■■■ 4.38
PACSIN3-207ENST00000530513 CFTRP13569 1480 aa42.37■■■■■ 4.37
PACSIN3-207ENST00000530513 PRDM2Q13029 1718 aa42.17■■■■■ 4.34
PACSIN3-207ENST00000530513 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PACSIN3-207ENST00000530513 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.93■■■■■ 4.3
PACSIN3-207ENST00000530513 TRIM41Q8WV44 630 aa41.7■■■■■ 4.27
PACSIN3-207ENST00000530513 TOPBP1Q92547 1522 aa41.61■■■■■ 4.25
PACSIN3-207ENST00000530513 IFT140Q96RY7 1462 aa41.58■■■■■ 4.25
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
PACSIN3-207ENST00000530513 OSCARQ8IYS5 282 aa41.55■■■■■ 4.24
PACSIN3-207ENST00000530513 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.49■■■■■ 4.23
PACSIN3-207ENST00000530513 ABCC8Q09428 1581 aa41.44■■■■■ 4.22
PACSIN3-207ENST00000530513 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
PACSIN3-207ENST00000530513 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
PACSIN3-207ENST00000530513 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.26■■■■■ 4.2
PACSIN3-207ENST00000530513 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.26■■■■■ 4.2
PACSIN3-207ENST00000530513 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.26■■■■■ 4.2
PACSIN3-207ENST00000530513 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
PACSIN3-207ENST00000530513 CHD1O14646 1710 aa41.17■■■■■ 4.18
PACSIN3-207ENST00000530513 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.171e-6■■■■□ 23.2
PACSIN3-207ENST00000530513 ARHGEF11O15085 1522 aa41.08■■■■■ 4.17
PACSIN3-207ENST00000530513 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.02■■■■■ 4.16
PACSIN3-207ENST00000530513 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.93■■■■■ 4.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CUX1P39880 1505 aa40.92■■■■■ 4.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SOGA1O94964 1423 aa40.9■■■■■ 4.14
PACSIN3-207ENST00000530513 WDR97A6NE52 1622 aa40.85■■■■■ 4.13
PACSIN3-207ENST00000530513 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
PACSIN3-207ENST00000530513 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.77■■■■■ 4.12
PACSIN3-207ENST00000530513 FBLN2P98095 1184 aa40.76■■■■■ 4.12
PACSIN3-207ENST00000530513 ARAP1Q96P48 1450 aa40.68■■■■■ 4.1
PACSIN3-207ENST00000530513 PBRM1Q86U86 1689 aa40.63■■■■■ 4.1
PACSIN3-207ENST00000530513 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
PACSIN3-207ENST00000530513 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.62■■■■■ 4.09
PACSIN3-207ENST00000530513 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.61■■■■■ 4.09
PACSIN3-207ENST00000530513 GRIN2BQ13224 1484 aa40.6■■■■■ 4.09
PACSIN3-207ENST00000530513 SYNJ1O43426 1573 aa40.55■■■■■ 4.08
PACSIN3-207ENST00000530513 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
PACSIN3-207ENST00000530513 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.49■■■■■ 4.07
PACSIN3-207ENST00000530513 SYNJ2O15056 1496 aa40.49■■■■■ 4.07
PACSIN3-207ENST00000530513 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.45■■■■■ 4.07
PACSIN3-207ENST00000530513 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
PACSIN3-207ENST00000530513 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.44■■■■■ 4.06
PACSIN3-207ENST00000530513 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.31■■■■■ 4.04
PACSIN3-207ENST00000530513 TOP2BQ02880 1626 aa40.26■■■■■ 4.04
PACSIN3-207ENST00000530513 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.03
PACSIN3-207ENST00000530513 ADAMTS12P58397 1594 aa40.18■■■■■ 4.02
PACSIN3-207ENST00000530513 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
PACSIN3-207ENST00000530513 GRIN2AQ12879 1464 aa40.13■■■■■ 4.01
PACSIN3-207ENST00000530513 CEP170Q5SW79 1584 aa40.05■■■■■ 4
PACSIN3-207ENST00000530513 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40■■■■□ 3.99
PACSIN3-207ENST00000530513 NUP160Q12769 1436 aa39.97■■■■□ 3.99
PACSIN3-207ENST00000530513 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.95■■■■□ 3.99
PACSIN3-207ENST00000530513 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.92■■■■□ 3.98
PACSIN3-207ENST00000530513 SHROOM2Q13796 1616 aa39.9■■■■□ 3.98
PACSIN3-207ENST00000530513 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.64■■■■□ 3.94
PACSIN3-207ENST00000530513 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
PACSIN3-207ENST00000530513 CUL7Q14999 1698 aa39.43■■■■□ 3.9
PACSIN3-207ENST00000530513 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.42■■■■□ 3.9
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