RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530484.1

USP17L3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L3, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3-201ENST00000530484 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.59■■□□□ 1.85
USP17L3-201ENST00000530484 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.22■■□□□ 1.31
USP17L3-201ENST00000530484 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP17L3-201ENST00000530484 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.04■■□□□ 1.12
USP17L3-201ENST00000530484 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.82■■□□□ 1.08
USP17L3-201ENST00000530484 ABCC9O60706 1549 aa21.79■■□□□ 1.08
USP17L3-201ENST00000530484 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.77■■□□□ 1.07
USP17L3-201ENST00000530484 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.62■■□□□ 1.05
USP17L3-201ENST00000530484 NACADO15069 1562 aa21.58■■□□□ 1.05
USP17L3-201ENST00000530484 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.38■■□□□ 1.01
USP17L3-201ENST00000530484 SCRIBQ14160 1630 aa21.28■■□□□ 1
USP17L3-201ENST00000530484 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.95■□□□□ 0.94
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USP17L3-201ENST00000530484 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.72■□□□□ 0.91
USP17L3-201ENST00000530484 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP17L3-201ENST00000530484 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.61■□□□□ 0.89
USP17L3-201ENST00000530484 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP17L3-201ENST00000530484 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.52■□□□□ 0.88
USP17L3-201ENST00000530484 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
USP17L3-201ENST00000530484 SMARCA4P51532 1647 aa20.44■□□□□ 0.86
USP17L3-201ENST00000530484 WIZO95785 1651 aa20.36■□□□□ 0.85
USP17L3-201ENST00000530484 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.22■□□□□ 0.83
USP17L3-201ENST00000530484 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP17L3-201ENST00000530484 SMARCA2P51531 1590 aa20.09■□□□□ 0.81
USP17L3-201ENST00000530484 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP17L3-201ENST00000530484 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.07■□□□□ 0.8
USP17L3-201ENST00000530484 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.02■□□□□ 0.8
USP17L3-201ENST00000530484 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
USP17L3-201ENST00000530484 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.94■□□□□ 0.78
USP17L3-201ENST00000530484 HMGXB3Q12766 1538 aa19.91■□□□□ 0.78
USP17L3-201ENST00000530484 NCAPD3P42695 1498 aa19.9■□□□□ 0.78
USP17L3-201ENST00000530484 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.77■□□□□ 0.75
USP17L3-201ENST00000530484 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
USP17L3-201ENST00000530484 TRIM41Q8WV44 630 aa19.62■□□□□ 0.73
USP17L3-201ENST00000530484 ABCC8Q09428 1581 aa19.53■□□□□ 0.72
USP17L3-201ENST00000530484 CFTRP13569 1480 aa19.47■□□□□ 0.71
USP17L3-201ENST00000530484 PRDM2Q13029 1718 aa19.43■□□□□ 0.7
USP17L3-201ENST00000530484 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.42■□□□□ 0.7
USP17L3-201ENST00000530484 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.37■□□□□ 0.69
USP17L3-201ENST00000530484 SYNJ1O43426 1573 aa19.34■□□□□ 0.69
USP17L3-201ENST00000530484 TOP2BQ02880 1626 aa19.28■□□□□ 0.68
USP17L3-201ENST00000530484 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.28■□□□□ 0.68
USP17L3-201ENST00000530484 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.23■□□□□ 0.67
USP17L3-201ENST00000530484 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
USP17L3-201ENST00000530484 EEA1Q15075 1411 aa19.21■□□□□ 0.67
USP17L3-201ENST00000530484 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.2■□□□□ 0.66
USP17L3-201ENST00000530484 CUX1P39880 1505 aa19.19■□□□□ 0.66
USP17L3-201ENST00000530484 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.17■□□□□ 0.66
USP17L3-201ENST00000530484 SOGA1O94964 1423 aa19.17■□□□□ 0.66
USP17L3-201ENST00000530484 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.16■□□□□ 0.66
USP17L3-201ENST00000530484 NESP48681 1621 aa19.16■□□□□ 0.66
USP17L3-201ENST00000530484 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.08■□□□□ 0.64
USP17L3-201ENST00000530484 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.06■□□□□ 0.64
USP17L3-201ENST00000530484 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.05■□□□□ 0.64
USP17L3-201ENST00000530484 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.04■□□□□ 0.64
USP17L3-201ENST00000530484 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.03■□□□□ 0.64
USP17L3-201ENST00000530484 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.97■□□□□ 0.63
USP17L3-201ENST00000530484 TOPBP1Q92547 1522 aa18.97■□□□□ 0.63
USP17L3-201ENST00000530484 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.97■□□□□ 0.63
USP17L3-201ENST00000530484 KIF21BO75037 1637 aa18.96■□□□□ 0.63
USP17L3-201ENST00000530484 KIF27Q86VH2 1401 aa18.93■□□□□ 0.62
USP17L3-201ENST00000530484 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
USP17L3-201ENST00000530484 GOLGA3Q08378 1498 aa18.91■□□□□ 0.62
USP17L3-201ENST00000530484 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.89■□□□□ 0.61
USP17L3-201ENST00000530484 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
USP17L3-201ENST00000530484 TNIKQ9UKE5 1360 aa18.86■□□□□ 0.61
USP17L3-201ENST00000530484 CUX2O14529 1486 aa18.84■□□□□ 0.61
USP17L3-201ENST00000530484 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.84■□□□□ 0.61
USP17L3-201ENST00000530484 PRXQ9BXM0 1461 aa18.82■□□□□ 0.6
USP17L3-201ENST00000530484 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.82■□□□□ 0.6
USP17L3-201ENST00000530484 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.81■□□□□ 0.6
USP17L3-201ENST00000530484 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.79■□□□□ 0.6
USP17L3-201ENST00000530484 WDR97A6NE52 1622 aa18.78■□□□□ 0.6
USP17L3-201ENST00000530484 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.78■□□□□ 0.6
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USP17L3-201ENST00000530484 CEP162Q5TB80 1403 aa18.76■□□□□ 0.59
USP17L3-201ENST00000530484 IGF1RP08069 1367 aa18.74■□□□□ 0.59
USP17L3-201ENST00000530484 WDR62O43379 1518 aa18.73■□□□□ 0.59
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USP17L3-201ENST00000530484 ERCC6Q03468 1493 aa18.69■□□□□ 0.58
USP17L3-201ENST00000530484 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.69■□□□□ 0.58
USP17L3-201ENST00000530484 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
USP17L3-201ENST00000530484 CUL7Q14999 1698 aa18.65■□□□□ 0.58
USP17L3-201ENST00000530484 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.65■□□□□ 0.58
USP17L3-201ENST00000530484 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.61■□□□□ 0.57
USP17L3-201ENST00000530484 CLIP1P30622 1438 aa18.6■□□□□ 0.57
USP17L3-201ENST00000530484 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
USP17L3-201ENST00000530484 IFT140Q96RY7 1462 aa18.59■□□□□ 0.57
USP17L3-201ENST00000530484 PBRM1Q86U86 1689 aa18.53■□□□□ 0.56
USP17L3-201ENST00000530484 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
USP17L3-201ENST00000530484 GRIN2BQ13224 1484 aa18.47■□□□□ 0.55
USP17L3-201ENST00000530484 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.46■□□□□ 0.54
USP17L3-201ENST00000530484 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
USP17L3-201ENST00000530484 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.44■□□□□ 0.54
USP17L3-201ENST00000530484 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
USP17L3-201ENST00000530484 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
USP17L3-201ENST00000530484 ADAMTS12P58397 1594 aa18.43■□□□□ 0.54
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USP17L3-201ENST00000530484 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.4■□□□□ 0.54
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