RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530449.1

TCIRG1-211, Transcript of T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCIRG1, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1-211ENST00000530449 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.96■■■■■ 6.23
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TCIRG1-211ENST00000530449 ABCC9O60706 1549 aa48.03■■■■■ 5.28
TCIRG1-211ENST00000530449 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.84■■■■■ 4.93
TCIRG1-211ENST00000530449 NACADO15069 1562 aa45.6■■■■■ 4.89
TCIRG1-211ENST00000530449 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.37■■■■■ 4.85
TCIRG1-211ENST00000530449 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.07■■■■■ 4.81
TCIRG1-211ENST00000530449 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.84■■■■■ 4.77
TCIRG1-211ENST00000530449 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.8■■■■■ 4.76
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TCIRG1-211ENST00000530449 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.74■■■■■ 4.752e-16■■■■□ 26.5
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TCIRG1-211ENST00000530449 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.52■■■■■ 4.72
TCIRG1-211ENST00000530449 SCRIBQ14160 1630 aa44.03■■■■■ 4.64
TCIRG1-211ENST00000530449 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.94■■■■■ 4.62
TCIRG1-211ENST00000530449 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.41■■■■■ 4.54
TCIRG1-211ENST00000530449 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
TCIRG1-211ENST00000530449 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.23■■■■■ 4.51
TCIRG1-211ENST00000530449 NCAPD3P42695 1498 aa42.09■■■■■ 4.33
TCIRG1-211ENST00000530449 SMARCA4P51532 1647 aa42.04■■■■■ 4.32
TCIRG1-211ENST00000530449 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.01■■■■■ 4.32
TCIRG1-211ENST00000530449 SMARCA2P51531 1590 aa41.9■■■■■ 4.3
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TCIRG1-211ENST00000530449 HMGXB3Q12766 1538 aa41.82■■■■■ 4.29
TCIRG1-211ENST00000530449 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.64■■■■■ 4.26
TCIRG1-211ENST00000530449 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
TCIRG1-211ENST00000530449 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.59■■■■■ 4.25
TCIRG1-211ENST00000530449 ERCC6Q03468 1493 aa41.44■■■■■ 4.22
TCIRG1-211ENST00000530449 NESP48681 1621 aa41.34■■■■■ 4.21
TCIRG1-211ENST00000530449 CUX2O14529 1486 aa41.28■■■■■ 4.2
TCIRG1-211ENST00000530449 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.1■■■■■ 4.17
TCIRG1-211ENST00000530449 WIZO95785 1651 aa41.1■■■■■ 4.17
TCIRG1-211ENST00000530449 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.93■■■■■ 4.14
TCIRG1-211ENST00000530449 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
TCIRG1-211ENST00000530449 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.84■■■■■ 4.13
TCIRG1-211ENST00000530449 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.83■■■■■ 4.13
TCIRG1-211ENST00000530449 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.82■■■■■ 4.12
TCIRG1-211ENST00000530449 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
TCIRG1-211ENST00000530449 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
TCIRG1-211ENST00000530449 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.49■■■■■ 4.07
TCIRG1-211ENST00000530449 CFTRP13569 1480 aa40.42■■■■■ 4.06
TCIRG1-211ENST00000530449 WDR62O43379 1518 aa40.39■■■■■ 4.06
TCIRG1-211ENST00000530449 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.38■■■■■ 4.05
TCIRG1-211ENST00000530449 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.36■■■■■ 4.05
TCIRG1-211ENST00000530449 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.13■■■■■ 4.02
TCIRG1-211ENST00000530449 PRDM2Q13029 1718 aa40.06■■■■■ 4
TCIRG1-211ENST00000530449 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
TCIRG1-211ENST00000530449 TOPBP1Q92547 1522 aa39.64■■■■□ 3.94
TCIRG1-211ENST00000530449 IFT140Q96RY7 1462 aa39.56■■■■□ 3.92
TCIRG1-211ENST00000530449 ABCC8Q09428 1581 aa39.55■■■■□ 3.92
TCIRG1-211ENST00000530449 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.51■■■■□ 3.92
TCIRG1-211ENST00000530449 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
TCIRG1-211ENST00000530449 OSCARQ8IYS5 282 aa39.42■■■■□ 3.9
TCIRG1-211ENST00000530449 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
TCIRG1-211ENST00000530449 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
TCIRG1-211ENST00000530449 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
TCIRG1-211ENST00000530449 TRIM41Q8WV44 630 aa39.24■■■■□ 3.87
TCIRG1-211ENST00000530449 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
TCIRG1-211ENST00000530449 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.15■■■■□ 3.867e-7■■■□□ 16.7
TCIRG1-211ENST00000530449 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.1■■■■□ 3.85
TCIRG1-211ENST00000530449 CUX1P39880 1505 aa39.06■■■■□ 3.84
TCIRG1-211ENST00000530449 SOGA1O94964 1423 aa39.06■■■■□ 3.84
TCIRG1-211ENST00000530449 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.05■■■■□ 3.84
TCIRG1-211ENST00000530449 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
TCIRG1-211ENST00000530449 CHD1O14646 1710 aa38.94■■■■□ 3.82
TCIRG1-211ENST00000530449 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
TCIRG1-211ENST00000530449 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
TCIRG1-211ENST00000530449 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
TCIRG1-211ENST00000530449 WDR97A6NE52 1622 aa38.89■■■■□ 3.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ARHGEF11O15085 1522 aa38.81■■■■□ 3.8
TCIRG1-211ENST00000530449 FBLN2P98095 1184 aa38.8■■■■□ 3.8
TCIRG1-211ENST00000530449 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.77■■■■□ 3.8
TCIRG1-211ENST00000530449 GRIN2BQ13224 1484 aa38.7■■■■□ 3.79
TCIRG1-211ENST00000530449 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
TCIRG1-211ENST00000530449 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.62■■■■□ 3.77
TCIRG1-211ENST00000530449 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.6■■■■□ 3.77
TCIRG1-211ENST00000530449 PBRM1Q86U86 1689 aa38.58■■■■□ 3.77
TCIRG1-211ENST00000530449 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
TCIRG1-211ENST00000530449 SYNJ2O15056 1496 aa38.54■■■■□ 3.76
TCIRG1-211ENST00000530449 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.54■■■■□ 3.76
TCIRG1-211ENST00000530449 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.51■■■■□ 3.76
TCIRG1-211ENST00000530449 TOP2BQ02880 1626 aa38.5■■■■□ 3.75
TCIRG1-211ENST00000530449 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.5■■■■□ 3.75
TCIRG1-211ENST00000530449 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.5■■■■□ 3.75
TCIRG1-211ENST00000530449 SYNJ1O43426 1573 aa38.49■■■■□ 3.75
TCIRG1-211ENST00000530449 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.48■■■■□ 3.75
TCIRG1-211ENST00000530449 ARAP1Q96P48 1450 aa38.46■■■■□ 3.75
TCIRG1-211ENST00000530449 ADAMTS12P58397 1594 aa38.23■■■■□ 3.71
TCIRG1-211ENST00000530449 GRIN2AQ12879 1464 aa38.21■■■■□ 3.71
TCIRG1-211ENST00000530449 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.13■■■■□ 3.69
TCIRG1-211ENST00000530449 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.12■■■■□ 3.69
TCIRG1-211ENST00000530449 NUP160Q12769 1436 aa38.07■■■■□ 3.69
TCIRG1-211ENST00000530449 CEP170Q5SW79 1584 aa38.06■■■■□ 3.68
TCIRG1-211ENST00000530449 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
TCIRG1-211ENST00000530449 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.93■■■■□ 3.66
TCIRG1-211ENST00000530449 SHROOM2Q13796 1616 aa37.88■■■■□ 3.65
TCIRG1-211ENST00000530449 KIF27Q86VH2 1401 aa37.75■■■■□ 3.63
TCIRG1-211ENST00000530449 IGF1RP08069 1367 aa37.7■■■■□ 3.63
TCIRG1-211ENST00000530449 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.69■■■■□ 3.62
TCIRG1-211ENST00000530449 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
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