RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530335.1

ME3-208, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 4

Gene ME3, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-208ENST00000530335 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.56■■■■■ 5.84
ME3-208ENST00000530335 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.12■■■■■ 4.97
ME3-208ENST00000530335 ABCC9O60706 1549 aa45.4■■■■■ 4.86
ME3-208ENST00000530335 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.55■■■■■ 4.56
ME3-208ENST00000530335 NACADO15069 1562 aa43.4■■■■■ 4.54
ME3-208ENST00000530335 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.1■■■■■ 4.49
ME3-208ENST00000530335 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.02■■■■■ 4.48
ME3-208ENST00000530335 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
ME3-208ENST00000530335 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.68■■■■■ 4.42
ME3-208ENST00000530335 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.66■■■■■ 4.42
ME3-208ENST00000530335 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.29■■■■■ 4.36
ME3-208ENST00000530335 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.27■■■■■ 4.36
ME3-208ENST00000530335 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.01■■■■■ 4.32
ME3-208ENST00000530335 SCRIBQ14160 1630 aa41.97■■■■■ 4.31
ME3-208ENST00000530335 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.79■■■■■ 4.28
ME3-208ENST00000530335 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
ME3-208ENST00000530335 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.11■■■■■ 4.17
ME3-208ENST00000530335 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.85■■■■■ 4.13
ME3-208ENST00000530335 SMARCA4P51532 1647 aa40.13■■■■■ 4.02
ME3-208ENST00000530335 NCAPD3P42695 1498 aa40.01■■■■■ 4
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ME3-208ENST00000530335 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.97■■■■□ 3.99
ME3-208ENST00000530335 SMARCA2P51531 1590 aa39.93■■■■□ 3.98
ME3-208ENST00000530335 HMGXB3Q12766 1538 aa39.83■■■■□ 3.97
ME3-208ENST00000530335 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.76■■■■□ 3.96
ME3-208ENST00000530335 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.72■■■■□ 3.95
ME3-208ENST00000530335 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
ME3-208ENST00000530335 WIZO95785 1651 aa39.3■■■■□ 3.88
ME3-208ENST00000530335 NESP48681 1621 aa39.18■■■■□ 3.86
ME3-208ENST00000530335 ERCC6Q03468 1493 aa39.17■■■■□ 3.86
ME3-208ENST00000530335 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
ME3-208ENST00000530335 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.08■■■■□ 3.85
ME3-208ENST00000530335 CUX2O14529 1486 aa38.95■■■■□ 3.83
ME3-208ENST00000530335 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
ME3-208ENST00000530335 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.8■■■■□ 3.8
ME3-208ENST00000530335 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.79■■■■□ 3.8
ME3-208ENST00000530335 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.77■■■■□ 3.8
ME3-208ENST00000530335 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
ME3-208ENST00000530335 CFTRP13569 1480 aa38.51■■■■□ 3.76
ME3-208ENST00000530335 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.41■■■■□ 3.74
ME3-208ENST00000530335 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.38■■■■□ 3.73
ME3-208ENST00000530335 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.38■■■■□ 3.73
ME3-208ENST00000530335 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.35■■■■□ 3.73
ME3-208ENST00000530335 WDR62O43379 1518 aa38.33■■■■□ 3.73
ME3-208ENST00000530335 PRDM2Q13029 1718 aa38.33■■■■□ 3.73
ME3-208ENST00000530335 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.18■■■■□ 3.7
ME3-208ENST00000530335 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
ME3-208ENST00000530335 TOPBP1Q92547 1522 aa37.73■■■■□ 3.63
ME3-208ENST00000530335 ABCC8Q09428 1581 aa37.71■■■■□ 3.63
ME3-208ENST00000530335 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
ME3-208ENST00000530335 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.68■■■■□ 3.62
ME3-208ENST00000530335 IFT140Q96RY7 1462 aa37.59■■■■□ 3.61
ME3-208ENST00000530335 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
ME3-208ENST00000530335 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
ME3-208ENST00000530335 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
ME3-208ENST00000530335 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
ME3-208ENST00000530335 CUX1P39880 1505 aa37.3■■■■□ 3.56
ME3-208ENST00000530335 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.22■■■■□ 3.55
ME3-208ENST00000530335 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.2■■■■□ 3.54
ME3-208ENST00000530335 SOGA1O94964 1423 aa37.18■■■■□ 3.54
ME3-208ENST00000530335 OSCARQ8IYS5 282 aa37.17■■■■□ 3.54
ME3-208ENST00000530335 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.15■■■■□ 3.54
ME3-208ENST00000530335 WDR97A6NE52 1622 aa37.1■■■■□ 3.53
ME3-208ENST00000530335 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
ME3-208ENST00000530335 CHD1O14646 1710 aa36.98■■■■□ 3.51
ME3-208ENST00000530335 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.92■■■■□ 3.5
ME3-208ENST00000530335 TOP2BQ02880 1626 aa36.89■■■■□ 3.5
ME3-208ENST00000530335 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.86■■■■□ 3.49
ME3-208ENST00000530335 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.85■■■■□ 3.49
ME3-208ENST00000530335 SYNJ1O43426 1573 aa36.85■■■■□ 3.49
ME3-208ENST00000530335 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.83■■■■□ 3.49
ME3-208ENST00000530335 GRIN2BQ13224 1484 aa36.82■■■■□ 3.49
ME3-208ENST00000530335 PBRM1Q86U86 1689 aa36.81■■■■□ 3.48
ME3-208ENST00000530335 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
ME3-208ENST00000530335 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.79■■■■□ 3.48
ME3-208ENST00000530335 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.77■■■■□ 3.48
ME3-208ENST00000530335 FBLN2P98095 1184 aa36.73■■■■□ 3.47
ME3-208ENST00000530335 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.73■■■■□ 3.47
ME3-208ENST00000530335 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.73■■■■□ 3.47
ME3-208ENST00000530335 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.73■■■■□ 3.47
ME3-208ENST00000530335 TRIM41Q8WV44 630 aa36.7■■■■□ 3.47
ME3-208ENST00000530335 ARHGEF11O15085 1522 aa36.64■■■■□ 3.46
ME3-208ENST00000530335 SYNJ2O15056 1496 aa36.64■■■■□ 3.46
ME3-208ENST00000530335 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
ME3-208ENST00000530335 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.54■■■■□ 3.44
ME3-208ENST00000530335 ADAMTS12P58397 1594 aa36.46■■■■□ 3.43
ME3-208ENST00000530335 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.42■■■■□ 3.42
ME3-208ENST00000530335 GRIN2AQ12879 1464 aa36.37■■■■□ 3.41
ME3-208ENST00000530335 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.33■■■■□ 3.41
ME3-208ENST00000530335 ARAP1Q96P48 1450 aa36.32■■■■□ 3.41
ME3-208ENST00000530335 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.24■■■■□ 3.39
ME3-208ENST00000530335 NUP160Q12769 1436 aa36.22■■■■□ 3.39
ME3-208ENST00000530335 CEP170Q5SW79 1584 aa36.22■■■■□ 3.39
ME3-208ENST00000530335 KIF27Q86VH2 1401 aa36.13■■■■□ 3.37
ME3-208ENST00000530335 SHROOM2Q13796 1616 aa36.05■■■■□ 3.36
ME3-208ENST00000530335 CUL7Q14999 1698 aa36.04■■■■□ 3.36
ME3-208ENST00000530335 IGF1RP08069 1367 aa36.02■■■■□ 3.36
ME3-208ENST00000530335 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.97■■■■□ 3.35
ME3-208ENST00000530335 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.93■■■■□ 3.34
ME3-208ENST00000530335 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.79■■■■□ 3.32
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