RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530067.1

SIRT3-212, Transcript of sirtuin 3, humanhuman

TSL 5

Gene SIRT3, Length 681 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3-212ENST00000530067 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.3■■■■■ 6.44
SIRT3-212ENST00000530067 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.2■■■■■ 5.47
SIRT3-212ENST00000530067 ABCC9O60706 1549 aa48.27■■■■■ 5.32
SIRT3-212ENST00000530067 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.32■■■■■ 5.01
SIRT3-212ENST00000530067 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.27■■■■■ 5
SIRT3-212ENST00000530067 NACADO15069 1562 aa46.22■■■■■ 4.99
SIRT3-212ENST00000530067 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
SIRT3-212ENST00000530067 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.87■■■■■ 4.93
SIRT3-212ENST00000530067 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.68■■■■■ 4.9
SIRT3-212ENST00000530067 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.45■■■■■ 4.87
SIRT3-212ENST00000530067 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.09■■■■■ 4.81
SIRT3-212ENST00000530067 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.01■■■■■ 4.8
SIRT3-212ENST00000530067 SCRIBQ14160 1630 aa44.97■■■■■ 4.79
SIRT3-212ENST00000530067 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.4■■■■■ 4.7
SIRT3-212ENST00000530067 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.33■■■■■ 4.69
SIRT3-212ENST00000530067 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
SIRT3-212ENST00000530067 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.66■■■■■ 4.58
SIRT3-212ENST00000530067 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.32■■■■■ 4.52
SIRT3-212ENST00000530067 SMARCA4P51532 1647 aa42.96■■■■■ 4.47
SIRT3-212ENST00000530067 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
SIRT3-212ENST00000530067 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.71■■■■■ 4.43
SIRT3-212ENST00000530067 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.67■■■■■ 4.42
SIRT3-212ENST00000530067 NCAPD3P42695 1498 aa42.65■■■■■ 4.42
SIRT3-212ENST00000530067 SMARCA2P51531 1590 aa42.61■■■■■ 4.41
SIRT3-212ENST00000530067 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.48■■■■■ 4.39
SIRT3-212ENST00000530067 HMGXB3Q12766 1538 aa42.45■■■■■ 4.39
SIRT3-212ENST00000530067 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
SIRT3-212ENST00000530067 WIZO95785 1651 aa42.25■■■■■ 4.35
SIRT3-212ENST00000530067 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
SIRT3-212ENST00000530067 NESP48681 1621 aa41.77■■■■■ 4.28
SIRT3-212ENST00000530067 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
SIRT3-212ENST00000530067 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.55■■■■■ 4.24
SIRT3-212ENST00000530067 ERCC6Q03468 1493 aa41.53■■■■■ 4.24
SIRT3-212ENST00000530067 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.41■■■■■ 4.22
SIRT3-212ENST00000530067 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.31■■■■■ 4.2
SIRT3-212ENST00000530067 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.24■■■■■ 4.19
SIRT3-212ENST00000530067 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.24■■■■■ 4.19
SIRT3-212ENST00000530067 CFTRP13569 1480 aa41.15■■■■■ 4.18
SIRT3-212ENST00000530067 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
SIRT3-212ENST00000530067 CUX2O14529 1486 aa41.08■■■■■ 4.17
SIRT3-212ENST00000530067 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
SIRT3-212ENST00000530067 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.97■■■■■ 4.15
SIRT3-212ENST00000530067 PRDM2Q13029 1718 aa40.96■■■■■ 4.15
SIRT3-212ENST00000530067 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.91■■■■■ 4.14
SIRT3-212ENST00000530067 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.87■■■■■ 4.13
SIRT3-212ENST00000530067 WDR62O43379 1518 aa40.75■■■■■ 4.11
SIRT3-212ENST00000530067 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
SIRT3-212ENST00000530067 TOPBP1Q92547 1522 aa40.33■■■■■ 4.05
SIRT3-212ENST00000530067 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.27■■■■■ 4.04
SIRT3-212ENST00000530067 ABCC8Q09428 1581 aa40.22■■■■■ 4.03
SIRT3-212ENST00000530067 CUX1P39880 1505 aa40.03■■■■■ 4
SIRT3-212ENST00000530067 IFT140Q96RY7 1462 aa40.03■■■■■ 4
SIRT3-212ENST00000530067 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
SIRT3-212ENST00000530067 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
SIRT3-212ENST00000530067 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.93■■■■□ 3.98
SIRT3-212ENST00000530067 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
SIRT3-212ENST00000530067 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.88■■■■□ 3.98
SIRT3-212ENST00000530067 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.86■■■■□ 3.97
SIRT3-212ENST00000530067 SOGA1O94964 1423 aa39.79■■■■□ 3.96
SIRT3-212ENST00000530067 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
SIRT3-212ENST00000530067 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.71■■■■□ 3.95
SIRT3-212ENST00000530067 SYNJ1O43426 1573 aa39.68■■■■□ 3.94
SIRT3-212ENST00000530067 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.68■■■■□ 3.94
SIRT3-212ENST00000530067 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.66■■■■□ 3.94
SIRT3-212ENST00000530067 TOP2BQ02880 1626 aa39.64■■■■□ 3.94
SIRT3-212ENST00000530067 WDR97A6NE52 1622 aa39.61■■■■□ 3.93
SIRT3-212ENST00000530067 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
SIRT3-212ENST00000530067 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.45■■■■□ 3.91
SIRT3-212ENST00000530067 OSCARQ8IYS5 282 aa39.37■■■■□ 3.89
SIRT3-212ENST00000530067 CHD1O14646 1710 aa39.37■■■■□ 3.89
SIRT3-212ENST00000530067 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.36■■■■□ 3.89
SIRT3-212ENST00000530067 PBRM1Q86U86 1689 aa39.35■■■■□ 3.89
SIRT3-212ENST00000530067 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.33■■■■□ 3.89
SIRT3-212ENST00000530067 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.32■■■■□ 3.89
SIRT3-212ENST00000530067 GRIN2BQ13224 1484 aa39.31■■■■□ 3.88
SIRT3-212ENST00000530067 FBLN2P98095 1184 aa39.22■■■■□ 3.87
SIRT3-212ENST00000530067 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
SIRT3-212ENST00000530067 SYNJ2O15056 1496 aa39.06■■■■□ 3.84
SIRT3-212ENST00000530067 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
SIRT3-212ENST00000530067 ADAMTS12P58397 1594 aa38.98■■■■□ 3.83
SIRT3-212ENST00000530067 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.97■■■■□ 3.83
SIRT3-212ENST00000530067 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
SIRT3-212ENST00000530067 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
SIRT3-212ENST00000530067 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
SIRT3-212ENST00000530067 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.85■■■■□ 3.81
SIRT3-212ENST00000530067 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.84■■■■□ 3.81
SIRT3-212ENST00000530067 GRIN2AQ12879 1464 aa38.84■■■■□ 3.81
SIRT3-212ENST00000530067 KIF27Q86VH2 1401 aa38.83■■■■□ 3.81
SIRT3-212ENST00000530067 ARHGEF11O15085 1522 aa38.8■■■■□ 3.8
SIRT3-212ENST00000530067 IGF1RP08069 1367 aa38.72■■■■□ 3.79
SIRT3-212ENST00000530067 CEP170Q5SW79 1584 aa38.7■■■■□ 3.79
SIRT3-212ENST00000530067 TRIM41Q8WV44 630 aa38.7■■■■□ 3.79
SIRT3-212ENST00000530067 NUP160Q12769 1436 aa38.65■■■■□ 3.78
SIRT3-212ENST00000530067 CUL7Q14999 1698 aa38.63■■■■□ 3.77
SIRT3-212ENST00000530067 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.61■■■■□ 3.77
SIRT3-212ENST00000530067 ARAP1Q96P48 1450 aa38.5■■■■□ 3.75
SIRT3-212ENST00000530067 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.48■■■■□ 3.75
SIRT3-212ENST00000530067 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.44■■■■□ 3.74
SIRT3-212ENST00000530067 SHROOM2Q13796 1616 aa38.41■■■■□ 3.74
SIRT3-212ENST00000530067 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.4■■■■□ 3.74
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