RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.19■■■■■ 4.99
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.15■■■■■ 4.18
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TSTA3-211ENST00000529899 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.82■■■■□ 3.8
TSTA3-211ENST00000529899 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.69■■■■□ 3.78
TSTA3-211ENST00000529899 NACADO15069 1562 aa38.69■■■■□ 3.78
TSTA3-211ENST00000529899 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
TSTA3-211ENST00000529899 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.3■■■■□ 3.72
TSTA3-211ENST00000529899 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.16■■■■□ 3.7
TSTA3-211ENST00000529899 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.1■■■■□ 3.69
TSTA3-211ENST00000529899 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.89■■■■□ 3.66
TSTA3-211ENST00000529899 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.79■■■■□ 3.64
TSTA3-211ENST00000529899 SCRIBQ14160 1630 aa37.68■■■■□ 3.62
TSTA3-211ENST00000529899 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.5■■■■□ 3.59
TSTA3-211ENST00000529899 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.11■■■■□ 3.53
TSTA3-211ENST00000529899 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
TSTA3-211ENST00000529899 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.7■■■■□ 3.47
TSTA3-211ENST00000529899 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.43■■■■□ 3.42
TSTA3-211ENST00000529899 SMARCA4P51532 1647 aa35.94■■■■□ 3.34
TSTA3-211ENST00000529899 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
TSTA3-211ENST00000529899 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.76■■■■□ 3.32
TSTA3-211ENST00000529899 NCAPD3P42695 1498 aa35.7■■■■□ 3.31
TSTA3-211ENST00000529899 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.68■■■■□ 3.3
TSTA3-211ENST00000529899 SMARCA2P51531 1590 aa35.64■■■■□ 3.3
TSTA3-211ENST00000529899 HMGXB3Q12766 1538 aa35.54■■■■□ 3.28
TSTA3-211ENST00000529899 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.51■■■■□ 3.28
TSTA3-211ENST00000529899 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
TSTA3-211ENST00000529899 WIZO95785 1651 aa35.33■■■■□ 3.25
TSTA3-211ENST00000529899 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
TSTA3-211ENST00000529899 NESP48681 1621 aa35.11■■■■□ 3.21
TSTA3-211ENST00000529899 ERCC6Q03468 1493 aa34.9■■■■□ 3.18
TSTA3-211ENST00000529899 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
TSTA3-211ENST00000529899 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.82■■■■□ 3.16
TSTA3-211ENST00000529899 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.7■■■■□ 3.15
TSTA3-211ENST00000529899 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.65■■■■□ 3.14
TSTA3-211ENST00000529899 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
TSTA3-211ENST00000529899 CUX2O14529 1486 aa34.56■■■■□ 3.12
TSTA3-211ENST00000529899 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.52■■■■□ 3.12
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.45■■■■□ 3.1
TSTA3-211ENST00000529899 CFTRP13569 1480 aa34.42■■■■□ 3.1
TSTA3-211ENST00000529899 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.33■■■■□ 3.09
TSTA3-211ENST00000529899 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.28■■■■□ 3.08
TSTA3-211ENST00000529899 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.27■■■■□ 3.08
TSTA3-211ENST00000529899 PRDM2Q13029 1718 aa34.24■■■■□ 3.07
TSTA3-211ENST00000529899 WDR62O43379 1518 aa34.2■■■■□ 3.07
TSTA3-211ENST00000529899 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
TSTA3-211ENST00000529899 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
TSTA3-211ENST00000529899 TOPBP1Q92547 1522 aa33.78■■■■□ 3
TSTA3-211ENST00000529899 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.77■■■■□ 3
TSTA3-211ENST00000529899 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.69■■■□□ 2.98
TSTA3-211ENST00000529899 ABCC8Q09428 1581 aa33.57■■■□□ 2.96
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
TSTA3-211ENST00000529899 IFT140Q96RY7 1462 aa33.53■■■□□ 2.96
TSTA3-211ENST00000529899 CUX1P39880 1505 aa33.48■■■□□ 2.95
TSTA3-211ENST00000529899 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
TSTA3-211ENST00000529899 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
TSTA3-211ENST00000529899 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
TSTA3-211ENST00000529899 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.39■■■□□ 2.94
TSTA3-211ENST00000529899 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.37■■■□□ 2.93
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TSTA3-211ENST00000529899 WDR97A6NE52 1622 aa33.17■■■□□ 2.9
TSTA3-211ENST00000529899 SYNJ1O43426 1573 aa33.16■■■□□ 2.9
TSTA3-211ENST00000529899 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.1■■■□□ 2.89
TSTA3-211ENST00000529899 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.09■■■□□ 2.89
TSTA3-211ENST00000529899 TOP2BQ02880 1626 aa33.07■■■□□ 2.88
TSTA3-211ENST00000529899 CHD1O14646 1710 aa33.07■■■□□ 2.88
TSTA3-211ENST00000529899 OSCARQ8IYS5 282 aa33.05■■■□□ 2.88
TSTA3-211ENST00000529899 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.98■■■□□ 2.87
TSTA3-211ENST00000529899 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.97■■■□□ 2.87
TSTA3-211ENST00000529899 PBRM1Q86U86 1689 aa32.96■■■□□ 2.87
TSTA3-211ENST00000529899 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.95■■■□□ 2.86
TSTA3-211ENST00000529899 GRIN2BQ13224 1484 aa32.89■■■□□ 2.86
TSTA3-211ENST00000529899 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.89■■■□□ 2.86
TSTA3-211ENST00000529899 FBLN2P98095 1184 aa32.88■■■□□ 2.85
TSTA3-211ENST00000529899 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
TSTA3-211ENST00000529899 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.74■■■□□ 2.83
TSTA3-211ENST00000529899 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.74■■■□□ 2.83
TSTA3-211ENST00000529899 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.74■■■□□ 2.83
TSTA3-211ENST00000529899 SYNJ2O15056 1496 aa32.72■■■□□ 2.83
TSTA3-211ENST00000529899 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
TSTA3-211ENST00000529899 TRIM41Q8WV44 630 aa32.68■■■□□ 2.82
TSTA3-211ENST00000529899 ARHGEF11O15085 1522 aa32.67■■■□□ 2.82
TSTA3-211ENST00000529899 ADAMTS12P58397 1594 aa32.66■■■□□ 2.82
TSTA3-211ENST00000529899 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.62■■■□□ 2.81
TSTA3-211ENST00000529899 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.55■■■□□ 2.8
TSTA3-211ENST00000529899 GRIN2AQ12879 1464 aa32.52■■■□□ 2.8
TSTA3-211ENST00000529899 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.47■■■□□ 2.79
TSTA3-211ENST00000529899 CEP170Q5SW79 1584 aa32.45■■■□□ 2.79
TSTA3-211ENST00000529899 ARAP1Q96P48 1450 aa32.42■■■□□ 2.78
TSTA3-211ENST00000529899 NUP160Q12769 1436 aa32.36■■■□□ 2.77
TSTA3-211ENST00000529899 KIF27Q86VH2 1401 aa32.36■■■□□ 2.77
TSTA3-211ENST00000529899 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.32■■■□□ 2.76
TSTA3-211ENST00000529899 IGF1RP08069 1367 aa32.31■■■□□ 2.76
TSTA3-211ENST00000529899 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.28■■■□□ 2.76
TSTA3-211ENST00000529899 CUL7Q14999 1698 aa32.24■■■□□ 2.75
TSTA3-211ENST00000529899 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.22■■■□□ 2.75
TSTA3-211ENST00000529899 SHROOM2Q13796 1616 aa32.2■■■□□ 2.75
TSTA3-211ENST00000529899 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.09■■■□□ 2.73
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