RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529833.5

ZNF707-215, Transcript of zinc finger protein 707, human

TSL 4

Gene ZNF707, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF707-215	ENST00000529833	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.31	■■■■■ 4.68
ZNF707-215	ENST00000529833	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.79	■■■■□ 3.96
ZNF707-215	ENST00000529833	ABCC9	O60706	1549 aa		39.66	■■■■□ 3.94
ZNF707-215	ENST00000529833	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.84	■■■■□ 3.65
ZNF707-215	ENST00000529833	NACAD	O15069	1562 aa		37.61	■■■■□ 3.61
ZNF707-215	ENST00000529833	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.3	■■■■□ 3.56
ZNF707-215	ENST00000529833	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.19	■■■■□ 3.54
ZNF707-215	ENST00000529833	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.15	■■■■□ 3.54
ZNF707-215	ENST00000529833	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.96	■■■■□ 3.51
ZNF707-215	ENST00000529833	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.91	■■■■□ 3.5
ZNF707-215	ENST00000529833	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.73	■■■■□ 3.47
ZNF707-215	ENST00000529833	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.72	■■■■□ 3.47
ZNF707-215	ENST00000529833	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.67	■■■■□ 3.46
ZNF707-215	ENST00000529833	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.31	■■■■□ 3.4
ZNF707-215	ENST00000529833	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.15	■■■■□ 3.38
ZNF707-215	ENST00000529833	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.87	■■■■□ 3.33
ZNF707-215	ENST00000529833	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.81	■■■■□ 3.32
ZNF707-215	ENST00000529833	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.75	■■■■□ 3.31
ZNF707-215	ENST00000529833	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.72	■■■■□ 3.15
ZNF707-215	ENST00000529833	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.58	■■■■□ 3.13
ZNF707-215	ENST00000529833	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.55	■■■■□ 3.12
ZNF707-215	ENST00000529833	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.51	■■■■□ 3.12
ZNF707-215	ENST00000529833	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.45	■■■■□ 3.11
ZNF707-215	ENST00000529833	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.41	■■■■□ 3.1
ZNF707-215	ENST00000529833	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.27	■■■■□ 3.08
ZNF707-215	ENST00000529833	CUX2	O14529	1486 aa		34.25	■■■■□ 3.07
ZNF707-215	ENST00000529833	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.25	■■■■□ 3.07
ZNF707-215	ENST00000529833	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.23	■■■■□ 3.07
ZNF707-215	ENST00000529833	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.19	■■■■□ 3.06
ZNF707-215	ENST00000529833	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.11	■■■■□ 3.05
ZNF707-215	ENST00000529833	NES	P48681	1621 aa		34.08	■■■■□ 3.05
ZNF707-215	ENST00000529833	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ZNF707-215	ENST00000529833	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
ZNF707-215	ENST00000529833	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ZNF707-215	ENST00000529833	WIZ	O95785	1651 aa		33.7	■■■□□ 2.99
ZNF707-215	ENST00000529833	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.66	■■■□□ 2.98
ZNF707-215	ENST00000529833	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ZNF707-215	ENST00000529833	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
ZNF707-215	ENST00000529833	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.4	■■■□□ 2.94
ZNF707-215	ENST00000529833	WDR62	O43379	1518 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ZNF707-215	ENST00000529833	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
ZNF707-215	ENST00000529833	CFTR	P13569	1480 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ZNF707-215	ENST00000529833	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ZNF707-215	ENST00000529833	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ZNF707-215	ENST00000529833	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ZNF707-215	ENST00000529833	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
ZNF707-215	ENST00000529833	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ZNF707-215	ENST00000529833	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.68	■■■□□ 2.82
ZNF707-215	ENST00000529833	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ZNF707-215	ENST00000529833	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
ZNF707-215	ENST00000529833	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ZNF707-215	ENST00000529833	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ZNF707-215	ENST00000529833	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ZNF707-215	ENST00000529833	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
ZNF707-215	ENST00000529833	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ZNF707-215	ENST00000529833	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
ZNF707-215	ENST00000529833	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
ZNF707-215	ENST00000529833	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
ZNF707-215	ENST00000529833	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.24	■■■□□ 2.75	8e-7	■■■■■ 28.7
ZNF707-215	ENST00000529833	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ZNF707-215	ENST00000529833	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ZNF707-215	ENST00000529833	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ZNF707-215	ENST00000529833	SOGA1	O94964	1423 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ZNF707-215	ENST00000529833	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.13	■■■□□ 2.73
ZNF707-215	ENST00000529833	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.13	■■■□□ 2.73
ZNF707-215	ENST00000529833	CHD1	O14646	1710 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ZNF707-215	ENST00000529833	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ZNF707-215	ENST00000529833	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ZNF707-215	ENST00000529833	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
ZNF707-215	ENST00000529833	CUX1	P39880	1505 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ZNF707-215	ENST00000529833	FBLN2	P98095	1184 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ZNF707-215	ENST00000529833	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ZNF707-215	ENST00000529833	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
ZNF707-215	ENST00000529833	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.87	■■■□□ 2.69
ZNF707-215	ENST00000529833	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.87	■■■□□ 2.69
ZNF707-215	ENST00000529833	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
ZNF707-215	ENST00000529833	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ZNF707-215	ENST00000529833	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ZNF707-215	ENST00000529833	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.76	■■■□□ 2.67
ZNF707-215	ENST00000529833	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.76	■■■□□ 2.67
ZNF707-215	ENST00000529833	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ZNF707-215	ENST00000529833	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ZNF707-215	ENST00000529833	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.73	■■■□□ 2.67
ZNF707-215	ENST00000529833	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.68	■■■□□ 2.66
ZNF707-215	ENST00000529833	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.61	■■■□□ 2.65
ZNF707-215	ENST00000529833	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ZNF707-215	ENST00000529833	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ZNF707-215	ENST00000529833	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
ZNF707-215	ENST00000529833	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.45	■■■□□ 2.62
ZNF707-215	ENST00000529833	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ZNF707-215	ENST00000529833	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ZNF707-215	ENST00000529833	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ZNF707-215	ENST00000529833	NUP160	Q12769	1436 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ZNF707-215	ENST00000529833	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ZNF707-215	ENST00000529833	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ZNF707-215	ENST00000529833	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ZNF707-215	ENST00000529833	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ZNF707-215	ENST00000529833	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
ZNF707-215	ENST00000529833	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.98	■■■□□ 2.55
ZNF707-215	ENST00000529833	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.96	■■■□□ 2.55

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