RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529525.1

FADS3-209, Transcript of fatty acid desaturase 3, humanhuman

TSL 3

Gene FADS3, Length 530 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FADS3-209ENST00000529525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.26■■■■■ 7.72
FADS3-209ENST00000529525 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.7■■■■■ 6.67
FADS3-209ENST00000529525 ABCC9O60706 1549 aa56.29■■■■■ 6.6
FADS3-209ENST00000529525 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.82■■■■■ 6.21
FADS3-209ENST00000529525 NACADO15069 1562 aa53.55■■■■■ 6.16
FADS3-209ENST00000529525 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.1■■■■■ 6.09
FADS3-209ENST00000529525 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.98■■■■■ 6.07
FADS3-209ENST00000529525 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.6■■■■■ 6.01
FADS3-209ENST00000529525 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.59■■■■■ 6.01
FADS3-209ENST00000529525 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.49■■■■■ 5.99
FADS3-209ENST00000529525 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.42■■■■■ 5.98
FADS3-209ENST00000529525 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.37■■■■■ 5.97
FADS3-209ENST00000529525 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.22■■■■■ 5.95
FADS3-209ENST00000529525 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.67■■■■■ 5.86
FADS3-209ENST00000529525 SCRIBQ14160 1630 aa51.53■■■■■ 5.84
FADS3-209ENST00000529525 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.93■■■■■ 5.74
FADS3-209ENST00000529525 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.91■■■■■ 5.74
FADS3-209ENST00000529525 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.74■■■■■ 5.71
FADS3-209ENST00000529525 NCAPD3P42695 1498 aa49.43■■■■■ 5.5
FADS3-209ENST00000529525 SMARCA4P51532 1647 aa49.28■■■■■ 5.48
FADS3-209ENST00000529525 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.26■■■■■ 5.48
FADS3-209ENST00000529525 SMARCA2P51531 1590 aa49.18■■■■■ 5.46
FADS3-209ENST00000529525 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.1■■■■■ 5.45
FADS3-209ENST00000529525 HMGXB3Q12766 1538 aa49.09■■■■■ 5.45
FADS3-209ENST00000529525 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.89■■■■■ 5.42
FADS3-209ENST00000529525 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
FADS3-209ENST00000529525 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.68■■■■■ 5.38
FADS3-209ENST00000529525 ERCC6Q03468 1493 aa48.61■■■■■ 5.37
FADS3-209ENST00000529525 CUX2O14529 1486 aa48.55■■■■■ 5.36
FADS3-209ENST00000529525 NESP48681 1621 aa48.43■■■■■ 5.34
FADS3-209ENST00000529525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.26■■■■■ 5.32
FADS3-209ENST00000529525 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.19■■■■■ 5.3
FADS3-209ENST00000529525 WIZO95785 1651 aa48.11■■■■■ 5.29
FADS3-209ENST00000529525 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
FADS3-209ENST00000529525 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.97■■■■■ 5.27
FADS3-209ENST00000529525 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.9■■■■■ 5.26
FADS3-209ENST00000529525 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.87■■■■■ 5.25
FADS3-209ENST00000529525 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.8■■■■■ 5.24
FADS3-209ENST00000529525 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
FADS3-209ENST00000529525 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.5■■■■■ 5.19
FADS3-209ENST00000529525 CFTRP13569 1480 aa47.42■■■■■ 5.18
FADS3-209ENST00000529525 WDR62O43379 1518 aa47.4■■■■■ 5.18
FADS3-209ENST00000529525 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.35■■■■■ 5.17
FADS3-209ENST00000529525 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.33■■■■■ 5.17
FADS3-209ENST00000529525 PRDM2Q13029 1718 aa47.02■■■■■ 5.12
FADS3-209ENST00000529525 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.01■■■■■ 5.12
FADS3-209ENST00000529525 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
FADS3-209ENST00000529525 TOPBP1Q92547 1522 aa46.47■■■■■ 5.03
FADS3-209ENST00000529525 ABCC8Q09428 1581 aa46.47■■■■■ 5.03
FADS3-209ENST00000529525 IFT140Q96RY7 1462 aa46.43■■■■■ 5.02
FADS3-209ENST00000529525 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.34■■■■■ 5.01
FADS3-209ENST00000529525 OSCARQ8IYS5 282 aa46.32■■■■■ 5.01
FADS3-209ENST00000529525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.25■■■■■ 4.99
FADS3-209ENST00000529525 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
FADS3-209ENST00000529525 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
FADS3-209ENST00000529525 TRIM41Q8WV44 630 aa46.03■■■■■ 4.96
FADS3-209ENST00000529525 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
FADS3-209ENST00000529525 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.87■■■■■ 4.93
FADS3-209ENST00000529525 SOGA1O94964 1423 aa45.79■■■■■ 4.92
FADS3-209ENST00000529525 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.78■■■■■ 4.92
FADS3-209ENST00000529525 CUX1P39880 1505 aa45.74■■■■■ 4.91
FADS3-209ENST00000529525 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
FADS3-209ENST00000529525 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.73■■■■■ 4.91
FADS3-209ENST00000529525 WDR97A6NE52 1622 aa45.7■■■■■ 4.91
FADS3-209ENST00000529525 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.66■■■■■ 4.9
FADS3-209ENST00000529525 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.66■■■■■ 4.9
FADS3-209ENST00000529525 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.66■■■■■ 4.9
FADS3-209ENST00000529525 CHD1O14646 1710 aa45.66■■■■■ 4.9
FADS3-209ENST00000529525 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
FADS3-209ENST00000529525 ARHGEF11O15085 1522 aa45.57■■■■■ 4.88
FADS3-209ENST00000529525 FBLN2P98095 1184 aa45.46■■■■■ 4.87
FADS3-209ENST00000529525 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.42■■■■■ 4.86
FADS3-209ENST00000529525 GRIN2BQ13224 1484 aa45.39■■■■■ 4.86
FADS3-209ENST00000529525 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
FADS3-209ENST00000529525 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.29■■■■■ 4.84
FADS3-209ENST00000529525 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.25■■■■■ 4.83
FADS3-209ENST00000529525 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.24■■■■■ 4.83
FADS3-209ENST00000529525 SYNJ2O15056 1496 aa45.22■■■■■ 4.83
FADS3-209ENST00000529525 PBRM1Q86U86 1689 aa45.21■■■■■ 4.83
FADS3-209ENST00000529525 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.18■■■■■ 4.82
FADS3-209ENST00000529525 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.18■■■■■ 4.82
FADS3-209ENST00000529525 SYNJ1O43426 1573 aa45.17■■■■■ 4.82
FADS3-209ENST00000529525 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.15■■■■■ 4.82
FADS3-209ENST00000529525 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.14■■■■■ 4.82
FADS3-209ENST00000529525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.13■■■■■ 4.82
FADS3-209ENST00000529525 TOP2BQ02880 1626 aa45.12■■■■■ 4.81
FADS3-209ENST00000529525 ARAP1Q96P48 1450 aa45.12■■■■■ 4.81
FADS3-209ENST00000529525 ADAMTS12P58397 1594 aa44.8■■■■■ 4.76
FADS3-209ENST00000529525 GRIN2AQ12879 1464 aa44.79■■■■■ 4.76
FADS3-209ENST00000529525 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.75■■■■■ 4.75
FADS3-209ENST00000529525 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.71■■■■■ 4.75
FADS3-209ENST00000529525 NUP160Q12769 1436 aa44.67■■■■■ 4.74
FADS3-209ENST00000529525 CEP170Q5SW79 1584 aa44.6■■■■■ 4.73
FADS3-209ENST00000529525 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
FADS3-209ENST00000529525 SHROOM2Q13796 1616 aa44.46■■■■■ 4.71
FADS3-209ENST00000529525 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.41■■■■■ 4.7
FADS3-209ENST00000529525 KIF27Q86VH2 1401 aa44.23■■■■■ 4.67
FADS3-209ENST00000529525 IGF1RP08069 1367 aa44.19■■■■■ 4.67
FADS3-209ENST00000529525 JPH4Q96JJ6 628 aa44.18■■■■■ 4.66
FADS3-209ENST00000529525 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
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