RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529295.5

MCAM-211, Transcript of melanoma cell adhesion molecule, humanhuman

TSL 4

Gene MCAM, Length 757 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAM-211ENST00000529295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.51■■■■■ 5.2
MCAM-211ENST00000529295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.53■■■■■ 4.4
MCAM-211ENST00000529295 ABCC9O60706 1549 aa42.29■■■■■ 4.36
MCAM-211ENST00000529295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.4■■■■■ 4.06
MCAM-211ENST00000529295 NACADO15069 1562 aa40.19■■■■■ 4.02
MCAM-211ENST00000529295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.96■■■■□ 3.99
MCAM-211ENST00000529295 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.76■■■■□ 3.96
MCAM-211ENST00000529295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.46■■■■□ 3.91
MCAM-211ENST00000529295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
MCAM-211ENST00000529295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
MCAM-211ENST00000529295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.34■■■■□ 3.89
MCAM-211ENST00000529295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.31■■■■□ 3.88
MCAM-211ENST00000529295 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.16■■■■□ 3.86
MCAM-211ENST00000529295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.79■■■■□ 3.8
MCAM-211ENST00000529295 SCRIBQ14160 1630 aa38.72■■■■□ 3.79
MCAM-211ENST00000529295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.21■■■■□ 3.71
MCAM-211ENST00000529295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
MCAM-211ENST00000529295 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.11■■■■□ 3.69
MCAM-211ENST00000529295 NCAPD3P42695 1498 aa37.11■■■■□ 3.53
MCAM-211ENST00000529295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.01■■■■□ 3.51
MCAM-211ENST00000529295 SMARCA4P51532 1647 aa36.99■■■■□ 3.51
MCAM-211ENST00000529295 SMARCA2P51531 1590 aa36.93■■■■□ 3.5
MCAM-211ENST00000529295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
MCAM-211ENST00000529295 HMGXB3Q12766 1538 aa36.85■■■■□ 3.49
MCAM-211ENST00000529295 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.67■■■■□ 3.46
MCAM-211ENST00000529295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
MCAM-211ENST00000529295 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.58■■■■□ 3.45
MCAM-211ENST00000529295 ERCC6Q03468 1493 aa36.54■■■■□ 3.44
MCAM-211ENST00000529295 CUX2O14529 1486 aa36.43■■■■□ 3.42
MCAM-211ENST00000529295 NESP48681 1621 aa36.37■■■■□ 3.41
MCAM-211ENST00000529295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.21■■■■□ 3.39
MCAM-211ENST00000529295 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.14■■■■□ 3.38
MCAM-211ENST00000529295 WIZO95785 1651 aa36.11■■■■□ 3.37
MCAM-211ENST00000529295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.04■■■■□ 3.36
MCAM-211ENST00000529295 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.99■■■■□ 3.35
MCAM-211ENST00000529295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
MCAM-211ENST00000529295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
MCAM-211ENST00000529295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.87■■■■□ 3.33
MCAM-211ENST00000529295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
MCAM-211ENST00000529295 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.68■■■■□ 3.3
MCAM-211ENST00000529295 CFTRP13569 1480 aa35.61■■■■□ 3.29
MCAM-211ENST00000529295 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.59■■■■□ 3.29
MCAM-211ENST00000529295 WDR62O43379 1518 aa35.57■■■■□ 3.29
MCAM-211ENST00000529295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.56■■■■□ 3.28
MCAM-211ENST00000529295 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.32■■■■□ 3.24
MCAM-211ENST00000529295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
MCAM-211ENST00000529295 PRDM2Q13029 1718 aa35.18■■■■□ 3.22
MCAM-211ENST00000529295 TOPBP1Q92547 1522 aa34.91■■■■□ 3.18
MCAM-211ENST00000529295 ABCC8Q09428 1581 aa34.9■■■■□ 3.18
MCAM-211ENST00000529295 IFT140Q96RY7 1462 aa34.89■■■■□ 3.18
MCAM-211ENST00000529295 OSCARQ8IYS5 282 aa34.8■■■■□ 3.16
MCAM-211ENST00000529295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.79■■■■□ 3.16
MCAM-211ENST00000529295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
MCAM-211ENST00000529295 TRIM41Q8WV44 630 aa34.59■■■■□ 3.13
MCAM-211ENST00000529295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
MCAM-211ENST00000529295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
MCAM-211ENST00000529295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
MCAM-211ENST00000529295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
MCAM-211ENST00000529295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.46■■■■□ 3.115e-6■■■■■ 28
MCAM-211ENST00000529295 SOGA1O94964 1423 aa34.43■■■■□ 3.1
MCAM-211ENST00000529295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.39■■■■□ 3.1
MCAM-211ENST00000529295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.37■■■■□ 3.09
MCAM-211ENST00000529295 CUX1P39880 1505 aa34.36■■■■□ 3.09
MCAM-211ENST00000529295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
MCAM-211ENST00000529295 WDR97A6NE52 1622 aa34.29■■■■□ 3.08
MCAM-211ENST00000529295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.25■■■■□ 3.07
MCAM-211ENST00000529295 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.25■■■■□ 3.07
MCAM-211ENST00000529295 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.25■■■■□ 3.07
MCAM-211ENST00000529295 CHD1O14646 1710 aa34.21■■■■□ 3.07
MCAM-211ENST00000529295 FBLN2P98095 1184 aa34.21■■■■□ 3.07
MCAM-211ENST00000529295 ARHGEF11O15085 1522 aa34.2■■■■□ 3.06
MCAM-211ENST00000529295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.14■■■■□ 3.06
MCAM-211ENST00000529295 GRIN2BQ13224 1484 aa34.11■■■■□ 3.05
MCAM-211ENST00000529295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
MCAM-211ENST00000529295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
MCAM-211ENST00000529295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.03■■■■□ 3.04
MCAM-211ENST00000529295 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.01■■■■□ 3.03
MCAM-211ENST00000529295 SYNJ2O15056 1496 aa33.97■■■■□ 3.03
MCAM-211ENST00000529295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.95■■■■□ 3.02
MCAM-211ENST00000529295 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.93■■■■□ 3.02
MCAM-211ENST00000529295 SYNJ1O43426 1573 aa33.92■■■■□ 3.02
MCAM-211ENST00000529295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.92■■■■□ 3.02
MCAM-211ENST00000529295 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.9■■■■□ 3.02
MCAM-211ENST00000529295 PBRM1Q86U86 1689 aa33.9■■■■□ 3.02
MCAM-211ENST00000529295 TOP2BQ02880 1626 aa33.89■■■■□ 3.02
MCAM-211ENST00000529295 ARAP1Q96P48 1450 aa33.88■■■■□ 3.01
MCAM-211ENST00000529295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.86■■■■□ 3.01
MCAM-211ENST00000529295 GRIN2AQ12879 1464 aa33.66■■■□□ 2.98
MCAM-211ENST00000529295 ADAMTS12P58397 1594 aa33.65■■■□□ 2.98
MCAM-211ENST00000529295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.62■■■□□ 2.97
MCAM-211ENST00000529295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.6■■■□□ 2.97
MCAM-211ENST00000529295 NUP160Q12769 1436 aa33.55■■■□□ 2.96
MCAM-211ENST00000529295 CEP170Q5SW79 1584 aa33.49■■■□□ 2.95
MCAM-211ENST00000529295 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
MCAM-211ENST00000529295 SHROOM2Q13796 1616 aa33.34■■■□□ 2.93
MCAM-211ENST00000529295 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.34■■■□□ 2.93
MCAM-211ENST00000529295 KIF27Q86VH2 1401 aa33.28■■■□□ 2.92
MCAM-211ENST00000529295 IGF1RP08069 1367 aa33.22■■■□□ 2.91
MCAM-211ENST00000529295 JPH4Q96JJ6 628 aa33.21■■■□□ 2.91
MCAM-211ENST00000529295 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
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