RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529273.1

ROM1-204, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene ROM1, Length 249 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-204ENST00000529273 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.44■■■■■ 8.55
ROM1-204ENST00000529273 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.07■■■■■ 7.37
ROM1-204ENST00000529273 ABCC9O60706 1549 aa60.71■■■■■ 7.31
ROM1-204ENST00000529273 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.95■■■■■ 6.87
ROM1-204ENST00000529273 NACADO15069 1562 aa57.7■■■■■ 6.83
ROM1-204ENST00000529273 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.66■■■■■ 6.82
ROM1-204ENST00000529273 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.08■■■■■ 6.73
ROM1-204ENST00000529273 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.82■■■■■ 6.69
ROM1-204ENST00000529273 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.67■■■■■ 6.66
ROM1-204ENST00000529273 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.54■■■■■ 6.64
ROM1-204ENST00000529273 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.54■■■■■ 6.64
ROM1-204ENST00000529273 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.51■■■■■ 6.64
ROM1-204ENST00000529273 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.25■■■■■ 6.59
ROM1-204ENST00000529273 SCRIBQ14160 1630 aa55.75■■■■■ 6.52
ROM1-204ENST00000529273 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.54■■■■■ 6.48
ROM1-204ENST00000529273 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.83■■■■■ 6.37
ROM1-204ENST00000529273 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.81■■■■■ 6.36
ROM1-204ENST00000529273 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.62■■■■■ 6.33
ROM1-204ENST00000529273 NCAPD3P42695 1498 aa53.31■■■■■ 6.12
ROM1-204ENST00000529273 SMARCA4P51532 1647 aa53.23■■■■■ 6.11
ROM1-204ENST00000529273 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.21■■■■■ 6.11
ROM1-204ENST00000529273 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.07■■■■■ 6.09
ROM1-204ENST00000529273 SMARCA2P51531 1590 aa53.06■■■■■ 6.08
ROM1-204ENST00000529273 HMGXB3Q12766 1538 aa52.9■■■■■ 6.06
ROM1-204ENST00000529273 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.75■■■■■ 6.03
ROM1-204ENST00000529273 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.72■■■■■ 6.03
ROM1-204ENST00000529273 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.71■■■■■ 6.03
ROM1-204ENST00000529273 ERCC6Q03468 1493 aa52.37■■■■■ 5.97
ROM1-204ENST00000529273 NESP48681 1621 aa52.29■■■■■ 5.96
ROM1-204ENST00000529273 WIZO95785 1651 aa52.1■■■■■ 5.93
ROM1-204ENST00000529273 CUX2O14529 1486 aa52.07■■■■■ 5.93
ROM1-204ENST00000529273 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.96■■■■■ 5.91
ROM1-204ENST00000529273 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.89■■■■■ 5.9
ROM1-204ENST00000529273 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.74■■■■■ 5.87
ROM1-204ENST00000529273 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.72■■■■■ 5.87
ROM1-204ENST00000529273 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.57■■■■■ 5.85
ROM1-204ENST00000529273 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.53■■■■■ 5.84
ROM1-204ENST00000529273 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.52■■■■■ 5.84
ROM1-204ENST00000529273 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.49■■■■■ 5.83
ROM1-204ENST00000529273 CFTRP13569 1480 aa51.22■■■■■ 5.79
ROM1-204ENST00000529273 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.21■■■■■ 5.79
ROM1-204ENST00000529273 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.12■■■■■ 5.77
ROM1-204ENST00000529273 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.11■■■■■ 5.77
ROM1-204ENST00000529273 WDR62O43379 1518 aa51.03■■■■■ 5.76
ROM1-204ENST00000529273 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.96■■■■■ 5.75
ROM1-204ENST00000529273 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.66■■■■■ 5.7
ROM1-204ENST00000529273 PRDM2Q13029 1718 aa50.57■■■■■ 5.69
ROM1-204ENST00000529273 TOPBP1Q92547 1522 aa50.2■■■■■ 5.63
ROM1-204ENST00000529273 ABCC8Q09428 1581 aa50.13■■■■■ 5.61
ROM1-204ENST00000529273 IFT140Q96RY7 1462 aa50.08■■■■■ 5.61
ROM1-204ENST00000529273 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
ROM1-204ENST00000529273 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.03■■■■■ 5.6
ROM1-204ENST00000529273 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.95■■■■■ 5.59
ROM1-204ENST00000529273 OSCARQ8IYS5 282 aa49.87■■■■■ 5.57
ROM1-204ENST00000529273 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.72■■■■■ 5.55
ROM1-204ENST00000529273 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.67■■■■■ 5.54
ROM1-204ENST00000529273 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.54
ROM1-204ENST00000529273 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.6■■■■■ 5.53
ROM1-204ENST00000529273 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.56■■■■■ 5.52
ROM1-204ENST00000529273 SOGA1O94964 1423 aa49.55■■■■■ 5.52
ROM1-204ENST00000529273 CUX1P39880 1505 aa49.53■■■■■ 5.52
ROM1-204ENST00000529273 TRIM41Q8WV44 630 aa49.5■■■■■ 5.51
ROM1-204ENST00000529273 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.49■■■■■ 5.51
ROM1-204ENST00000529273 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
ROM1-204ENST00000529273 FBLN2P98095 1184 aa49.21■■■■■ 5.47
ROM1-204ENST00000529273 WDR97A6NE52 1622 aa49.17■■■■■ 5.46
ROM1-204ENST00000529273 CHD1O14646 1710 aa49.12■■■■■ 5.45
ROM1-204ENST00000529273 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.07■■■■■ 5.45
ROM1-204ENST00000529273 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.04■■■■■ 5.44
ROM1-204ENST00000529273 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.04■■■■■ 5.44
ROM1-204ENST00000529273 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.04■■■■■ 5.44
ROM1-204ENST00000529273 GRIN2BQ13224 1484 aa49.03■■■■■ 5.44
ROM1-204ENST00000529273 ARHGEF11O15085 1522 aa48.99■■■■■ 5.43
ROM1-204ENST00000529273 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.96■■■■■ 5.43
ROM1-204ENST00000529273 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.95■■■■■ 5.43
ROM1-204ENST00000529273 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.93■■■■■ 5.42
ROM1-204ENST00000529273 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.93■■■■■ 5.42
ROM1-204ENST00000529273 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.92■■■■■ 5.42
ROM1-204ENST00000529273 TOP2BQ02880 1626 aa48.83■■■■■ 5.41
ROM1-204ENST00000529273 SYNJ1O43426 1573 aa48.81■■■■■ 5.4
ROM1-204ENST00000529273 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.8■■■■■ 5.4
ROM1-204ENST00000529273 SYNJ2O15056 1496 aa48.8■■■■■ 5.4
ROM1-204ENST00000529273 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.77■■■■■ 5.4
ROM1-204ENST00000529273 PBRM1Q86U86 1689 aa48.75■■■■■ 5.39
ROM1-204ENST00000529273 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.68■■■■■ 5.38
ROM1-204ENST00000529273 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.64■■■■■ 5.38
ROM1-204ENST00000529273 ARAP1Q96P48 1450 aa48.55■■■■■ 5.36
ROM1-204ENST00000529273 GRIN2AQ12879 1464 aa48.39■■■■■ 5.34
ROM1-204ENST00000529273 ADAMTS12P58397 1594 aa48.39■■■■■ 5.34
ROM1-204ENST00000529273 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.34■■■■■ 5.33
ROM1-204ENST00000529273 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.33■■■■■ 5.33
ROM1-204ENST00000529273 NUP160Q12769 1436 aa48.22■■■■■ 5.31
ROM1-204ENST00000529273 CEP170Q5SW79 1584 aa48.16■■■■■ 5.3
ROM1-204ENST00000529273 KIF27Q86VH2 1401 aa47.98■■■■■ 5.27
ROM1-204ENST00000529273 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
ROM1-204ENST00000529273 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.94■■■■■ 5.26
ROM1-204ENST00000529273 IGF1RP08069 1367 aa47.92■■■■■ 5.26
ROM1-204ENST00000529273 SHROOM2Q13796 1616 aa47.87■■■■■ 5.25
ROM1-204ENST00000529273 JPH4Q96JJ6 628 aa47.79■■■■■ 5.24
ROM1-204ENST00000529273 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.73■■■■■ 5.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms