RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528966.5

LTBP3-211, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP3, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3-211ENST00000528966 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.77■■■■■ 4.92
LTBP3-211ENST00000528966 ABCC9O60706 1549 aa42.1■■■■■ 4.33
LTBP3-211ENST00000528966 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.4■■■■■ 4.22
LTBP3-211ENST00000528966 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.17■■■■■ 4.02
LTBP3-211ENST00000528966 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.73■■■■□ 3.95
LTBP3-211ENST00000528966 NACADO15069 1562 aa39.29■■■■□ 3.88
LTBP3-211ENST00000528966 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.06■■■■□ 3.84
LTBP3-211ENST00000528966 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.93■■■■□ 3.82
LTBP3-211ENST00000528966 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.87■■■■□ 3.81
LTBP3-211ENST00000528966 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.68■■■■□ 3.78
LTBP3-211ENST00000528966 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.52■■■■□ 3.76
LTBP3-211ENST00000528966 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.01■■■■□ 3.67
LTBP3-211ENST00000528966 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38■■■■□ 3.67
LTBP3-211ENST00000528966 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.99■■■■□ 3.67
LTBP3-211ENST00000528966 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
LTBP3-211ENST00000528966 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.76■■■■□ 3.63
LTBP3-211ENST00000528966 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
LTBP3-211ENST00000528966 SCRIBQ14160 1630 aa37.69■■■■□ 3.62
LTBP3-211ENST00000528966 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.36■■■■□ 3.57
LTBP3-211ENST00000528966 CUX2O14529 1486 aa36.56■■■■□ 3.44
LTBP3-211ENST00000528966 ERCC6Q03468 1493 aa36.36■■■■□ 3.41
LTBP3-211ENST00000528966 NCAPD3P42695 1498 aa36.29■■■■□ 3.4
LTBP3-211ENST00000528966 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.08■■■■□ 3.37
LTBP3-211ENST00000528966 NESP48681 1621 aa35.98■■■■□ 3.35
LTBP3-211ENST00000528966 HMGXB3Q12766 1538 aa35.96■■■■□ 3.35
LTBP3-211ENST00000528966 SMARCA2P51531 1590 aa35.92■■■■□ 3.34
LTBP3-211ENST00000528966 SMARCA4P51532 1647 aa35.88■■■■□ 3.33
LTBP3-211ENST00000528966 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
LTBP3-211ENST00000528966 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
LTBP3-211ENST00000528966 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.58■■■■□ 3.29
LTBP3-211ENST00000528966 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
LTBP3-211ENST00000528966 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.54■■■■□ 3.28
LTBP3-211ENST00000528966 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.51■■■■□ 3.28
LTBP3-211ENST00000528966 TRIM41Q8WV44 630 aa35.4■■■■□ 3.26
LTBP3-211ENST00000528966 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.36■■■■□ 3.25
LTBP3-211ENST00000528966 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.29■■■■□ 3.24
LTBP3-211ENST00000528966 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.13■■■■□ 3.21
LTBP3-211ENST00000528966 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.13■■■■□ 3.21
LTBP3-211ENST00000528966 WDR62O43379 1518 aa35.1■■■■□ 3.21
LTBP3-211ENST00000528966 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.84■■■■□ 3.17
LTBP3-211ENST00000528966 WIZO95785 1651 aa34.84■■■■□ 3.17
LTBP3-211ENST00000528966 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.75■■■■□ 3.15
LTBP3-211ENST00000528966 OSCARQ8IYS5 282 aa34.73■■■■□ 3.15
LTBP3-211ENST00000528966 CFTRP13569 1480 aa34.6■■■■□ 3.13
LTBP3-211ENST00000528966 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
LTBP3-211ENST00000528966 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.44■■■■□ 3.1
LTBP3-211ENST00000528966 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.44■■■■□ 3.1
LTBP3-211ENST00000528966 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.44■■■■□ 3.1
LTBP3-211ENST00000528966 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
LTBP3-211ENST00000528966 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
LTBP3-211ENST00000528966 ARHGEF11O15085 1522 aa34.25■■■■□ 3.07
LTBP3-211ENST00000528966 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
LTBP3-211ENST00000528966 PRDM2Q13029 1718 aa34.23■■■■□ 3.07
LTBP3-211ENST00000528966 IFT140Q96RY7 1462 aa34.17■■■■□ 3.06
LTBP3-211ENST00000528966 TOPBP1Q92547 1522 aa34.03■■■■□ 3.04
LTBP3-211ENST00000528966 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
LTBP3-211ENST00000528966 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.99■■■■□ 3.03
LTBP3-211ENST00000528966 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.94■■■■□ 3.02
LTBP3-211ENST00000528966 CHD1O14646 1710 aa33.91■■■■□ 3.02
LTBP3-211ENST00000528966 ARAP1Q96P48 1450 aa33.87■■■■□ 3.01
LTBP3-211ENST00000528966 ABCC8Q09428 1581 aa33.85■■■■□ 3.01
LTBP3-211ENST00000528966 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.83■■■■□ 3.01
LTBP3-211ENST00000528966 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.82■■■■□ 36e-8■■■■□ 23.2
LTBP3-211ENST00000528966 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
LTBP3-211ENST00000528966 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
LTBP3-211ENST00000528966 FBLN2P98095 1184 aa33.67■■■□□ 2.98
LTBP3-211ENST00000528966 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
LTBP3-211ENST00000528966 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.53■■■□□ 2.96
LTBP3-211ENST00000528966 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.49■■■□□ 2.95
LTBP3-211ENST00000528966 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
LTBP3-211ENST00000528966 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.44■■■□□ 2.94
LTBP3-211ENST00000528966 SOGA1O94964 1423 aa33.44■■■□□ 2.94
LTBP3-211ENST00000528966 SYNJ1O43426 1573 aa33.36■■■□□ 2.93
LTBP3-211ENST00000528966 WDR97A6NE52 1622 aa33.35■■■□□ 2.93
LTBP3-211ENST00000528966 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
LTBP3-211ENST00000528966 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.31■■■□□ 2.92
LTBP3-211ENST00000528966 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
LTBP3-211ENST00000528966 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
LTBP3-211ENST00000528966 GRIN2BQ13224 1484 aa33.23■■■□□ 2.91
LTBP3-211ENST00000528966 SYNJ2O15056 1496 aa33.21■■■□□ 2.91
LTBP3-211ENST00000528966 CUX1P39880 1505 aa33.19■■■□□ 2.9
LTBP3-211ENST00000528966 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.15■■■□□ 2.9
LTBP3-211ENST00000528966 PBRM1Q86U86 1689 aa33.1■■■□□ 2.89
LTBP3-211ENST00000528966 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.95■■■□□ 2.86
LTBP3-211ENST00000528966 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.94■■■□□ 2.86
LTBP3-211ENST00000528966 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.89■■■□□ 2.86
LTBP3-211ENST00000528966 GRIN2AQ12879 1464 aa32.83■■■□□ 2.85
LTBP3-211ENST00000528966 CEP170Q5SW79 1584 aa32.79■■■□□ 2.84
LTBP3-211ENST00000528966 NUP160Q12769 1436 aa32.75■■■□□ 2.83
LTBP3-211ENST00000528966 ADAMTS12P58397 1594 aa32.73■■■□□ 2.83
LTBP3-211ENST00000528966 SHROOM2Q13796 1616 aa32.71■■■□□ 2.83
LTBP3-211ENST00000528966 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.7■■■□□ 2.83
LTBP3-211ENST00000528966 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.59■■■□□ 2.81
LTBP3-211ENST00000528966 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.57■■■□□ 2.8
LTBP3-211ENST00000528966 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
LTBP3-211ENST00000528966 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.47■■■□□ 2.79
LTBP3-211ENST00000528966 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.46■■■□□ 2.79
LTBP3-211ENST00000528966 TOP2BQ02880 1626 aa32.45■■■□□ 2.79
LTBP3-211ENST00000528966 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.39■■■□□ 2.78
LTBP3-211ENST00000528966 JPH4Q96JJ6 628 aa32.37■■■□□ 2.77
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