RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528934.5

TMEM25-218, Transcript of transmembrane protein 25, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM25, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25-218ENST00000528934 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.74■■■□□ 2.83
TMEM25-218ENST00000528934 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM25-218ENST00000528934 ABCC9O60706 1549 aa28.89■■■□□ 2.22
TMEM25-218ENST00000528934 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.75■■■□□ 2.03
TMEM25-218ENST00000528934 NACADO15069 1562 aa27.67■■■□□ 2.02
TMEM25-218ENST00000528934 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.46■■□□□ 1.99
TMEM25-218ENST00000528934 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.37■■□□□ 1.97
TMEM25-218ENST00000528934 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TMEM25-218ENST00000528934 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.17■■□□□ 1.94
TMEM25-218ENST00000528934 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.06■■□□□ 1.92
TMEM25-218ENST00000528934 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
TMEM25-218ENST00000528934 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM25-218ENST00000528934 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM25-218ENST00000528934 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.72■■□□□ 1.87
TMEM25-218ENST00000528934 SCRIBQ14160 1630 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM25-218ENST00000528934 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
TMEM25-218ENST00000528934 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.17■■□□□ 1.78
TMEM25-218ENST00000528934 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.06■■□□□ 1.76
TMEM25-218ENST00000528934 NCAPD3P42695 1498 aa25.53■■□□□ 1.68
TMEM25-218ENST00000528934 SMARCA4P51532 1647 aa25.45■■□□□ 1.67
TMEM25-218ENST00000528934 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.44■■□□□ 1.66
TMEM25-218ENST00000528934 SMARCA2P51531 1590 aa25.43■■□□□ 1.66
TMEM25-218ENST00000528934 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TMEM25-218ENST00000528934 HMGXB3Q12766 1538 aa25.36■■□□□ 1.65
TMEM25-218ENST00000528934 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM25-218ENST00000528934 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TMEM25-218ENST00000528934 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM25-218ENST00000528934 ERCC6Q03468 1493 aa24.97■■□□□ 1.59
TMEM25-218ENST00000528934 CUX2O14529 1486 aa24.95■■□□□ 1.58
TMEM25-218ENST00000528934 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM25-218ENST00000528934 NESP48681 1621 aa24.88■■□□□ 1.57
TMEM25-218ENST00000528934 WIZO95785 1651 aa24.85■■□□□ 1.57
TMEM25-218ENST00000528934 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TMEM25-218ENST00000528934 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.75■■□□□ 1.55
TMEM25-218ENST00000528934 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.74■■□□□ 1.55
TMEM25-218ENST00000528934 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TMEM25-218ENST00000528934 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
TMEM25-218ENST00000528934 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.61■■□□□ 1.53
TMEM25-218ENST00000528934 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM25-218ENST00000528934 CFTRP13569 1480 aa24.51■■□□□ 1.51
TMEM25-218ENST00000528934 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM25-218ENST00000528934 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.42■■□□□ 1.5
TMEM25-218ENST00000528934 WDR62O43379 1518 aa24.41■■□□□ 1.5
TMEM25-218ENST00000528934 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.41■■□□□ 1.5
TMEM25-218ENST00000528934 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.33■■□□□ 1.49
TMEM25-218ENST00000528934 PRDM2Q13029 1718 aa24.3■■□□□ 1.48
TMEM25-218ENST00000528934 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TMEM25-218ENST00000528934 ABCC8Q09428 1581 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM25-218ENST00000528934 TOPBP1Q92547 1522 aa23.99■■□□□ 1.43
TMEM25-218ENST00000528934 IFT140Q96RY7 1462 aa23.96■■□□□ 1.43
TMEM25-218ENST00000528934 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.94■■□□□ 1.42
TMEM25-218ENST00000528934 OSCARQ8IYS5 282 aa23.82■■□□□ 1.4
TMEM25-218ENST00000528934 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TMEM25-218ENST00000528934 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
TMEM25-218ENST00000528934 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
TMEM25-218ENST00000528934 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TMEM25-218ENST00000528934 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM25-218ENST00000528934 SOGA1O94964 1423 aa23.67■■□□□ 1.38
TMEM25-218ENST00000528934 WDR97A6NE52 1622 aa23.66■■□□□ 1.38
TMEM25-218ENST00000528934 CUX1P39880 1505 aa23.64■■□□□ 1.37
TMEM25-218ENST00000528934 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
TMEM25-218ENST00000528934 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.62■■□□□ 1.37
TMEM25-218ENST00000528934 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.6■■□□□ 1.37
TMEM25-218ENST00000528934 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TMEM25-218ENST00000528934 CHD1O14646 1710 aa23.47■■□□□ 1.35
TMEM25-218ENST00000528934 TRIM41Q8WV44 630 aa23.46■■□□□ 1.35
TMEM25-218ENST00000528934 GRIN2BQ13224 1484 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM25-218ENST00000528934 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM25-218ENST00000528934 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TMEM25-218ENST00000528934 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM25-218ENST00000528934 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM25-218ENST00000528934 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.41■■□□□ 1.34
TMEM25-218ENST00000528934 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM25-218ENST00000528934 FBLN2P98095 1184 aa23.39■■□□□ 1.33
TMEM25-218ENST00000528934 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
TMEM25-218ENST00000528934 TOP2BQ02880 1626 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM25-218ENST00000528934 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM25-218ENST00000528934 ARHGEF11O15085 1522 aa23.38■■□□□ 1.33
TMEM25-218ENST00000528934 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.37■■□□□ 1.33
TMEM25-218ENST00000528934 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.34■■□□□ 1.33
TMEM25-218ENST00000528934 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TMEM25-218ENST00000528934 SYNJ2O15056 1496 aa23.33■■□□□ 1.33
TMEM25-218ENST00000528934 PBRM1Q86U86 1689 aa23.32■■□□□ 1.32
TMEM25-218ENST00000528934 SYNJ1O43426 1573 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM25-218ENST00000528934 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM25-218ENST00000528934 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.17■■□□□ 1.3
TMEM25-218ENST00000528934 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.16■■□□□ 1.3
TMEM25-218ENST00000528934 ARAP1Q96P48 1450 aa23.15■■□□□ 1.3
TMEM25-218ENST00000528934 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.13■■□□□ 1.29
TMEM25-218ENST00000528934 ADAMTS12P58397 1594 aa23.12■■□□□ 1.29
TMEM25-218ENST00000528934 GRIN2AQ12879 1464 aa23.11■■□□□ 1.29
TMEM25-218ENST00000528934 NUP160Q12769 1436 aa23.07■■□□□ 1.28
TMEM25-218ENST00000528934 CEP170Q5SW79 1584 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM25-218ENST00000528934 KIF27Q86VH2 1401 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM25-218ENST00000528934 SHROOM2Q13796 1616 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM25-218ENST00000528934 IGF1RP08069 1367 aa22.89■■□□□ 1.26
TMEM25-218ENST00000528934 CUL7Q14999 1698 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM25-218ENST00000528934 JPH4Q96JJ6 628 aa22.82■■□□□ 1.24
TMEM25-218ENST00000528934 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.81■■□□□ 1.24
TMEM25-218ENST00000528934 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms