RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.43■■■■□ 3.26
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.49■■■□□ 2.63
TSTA3-208ENST00000528920 ABCC9O60706 1549 aa31.07■■■□□ 2.56
TSTA3-208ENST00000528920 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.57■■■□□ 2.32
TSTA3-208ENST00000528920 NACADO15069 1562 aa29.56■■■□□ 2.32
TSTA3-208ENST00000528920 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
TSTA3-208ENST00000528920 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.5■■■□□ 2.31
TSTA3-208ENST00000528920 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.42■■■□□ 2.3
TSTA3-208ENST00000528920 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.34■■■□□ 2.29
TSTA3-208ENST00000528920 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.29■■■□□ 2.28
TSTA3-208ENST00000528920 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.95■■■□□ 2.23
TSTA3-208ENST00000528920 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.222e-7■■■■□ 25
TSTA3-208ENST00000528920 SCRIBQ14160 1630 aa28.7■■■□□ 2.19
TSTA3-208ENST00000528920 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.68■■■□□ 2.18
TSTA3-208ENST00000528920 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.39■■■□□ 2.13
TSTA3-208ENST00000528920 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.02■■■□□ 2.08
TSTA3-208ENST00000528920 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.99■■■□□ 2.07
TSTA3-208ENST00000528920 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
TSTA3-208ENST00000528920 SMARCA4P51532 1647 aa27.49■■□□□ 1.99
TSTA3-208ENST00000528920 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TSTA3-208ENST00000528920 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.31■■□□□ 1.96
TSTA3-208ENST00000528920 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.29■■□□□ 1.96
TSTA3-208ENST00000528920 SMARCA2P51531 1590 aa27.27■■□□□ 1.96
TSTA3-208ENST00000528920 NCAPD3P42695 1498 aa27.26■■□□□ 1.95
TSTA3-208ENST00000528920 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-208ENST00000528920 HMGXB3Q12766 1538 aa27.15■■□□□ 1.94
TSTA3-208ENST00000528920 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-208ENST00000528920 WIZO95785 1651 aa27.03■■□□□ 1.92
TSTA3-208ENST00000528920 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TSTA3-208ENST00000528920 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27■■□□□ 1.91
TSTA3-208ENST00000528920 ERCC6Q03468 1493 aa26.84■■□□□ 1.89
TSTA3-208ENST00000528920 CUX2O14529 1486 aa26.79■■□□□ 1.88
TSTA3-208ENST00000528920 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TSTA3-208ENST00000528920 NESP48681 1621 aa26.63■■□□□ 1.85
TSTA3-208ENST00000528920 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.54■■□□□ 1.84
TSTA3-208ENST00000528920 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.46■■□□□ 1.83
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.41■■□□□ 1.82
TSTA3-208ENST00000528920 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TSTA3-208ENST00000528920 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TSTA3-208ENST00000528920 CFTRP13569 1480 aa26.34■■□□□ 1.81
TSTA3-208ENST00000528920 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.33■■□□□ 1.81
TSTA3-208ENST00000528920 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.3■■□□□ 1.8
TSTA3-208ENST00000528920 PRDM2Q13029 1718 aa26.21■■□□□ 1.79
TSTA3-208ENST00000528920 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.17■■□□□ 1.78
TSTA3-208ENST00000528920 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.12■■□□□ 1.77
TSTA3-208ENST00000528920 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.07■■□□□ 1.76
TSTA3-208ENST00000528920 WDR62O43379 1518 aa25.98■■□□□ 1.75
TSTA3-208ENST00000528920 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TSTA3-208ENST00000528920 TRIM41Q8WV44 630 aa25.82■■□□□ 1.72
TSTA3-208ENST00000528920 ABCC8Q09428 1581 aa25.78■■□□□ 1.72
TSTA3-208ENST00000528920 TOPBP1Q92547 1522 aa25.77■■□□□ 1.72
TSTA3-208ENST00000528920 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.75■■□□□ 1.71
TSTA3-208ENST00000528920 CUX1P39880 1505 aa25.61■■□□□ 1.69
TSTA3-208ENST00000528920 OSCARQ8IYS5 282 aa25.59■■□□□ 1.69
TSTA3-208ENST00000528920 IFT140Q96RY7 1462 aa25.57■■□□□ 1.68
TSTA3-208ENST00000528920 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-208ENST00000528920 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TSTA3-208ENST00000528920 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.5■■□□□ 1.67
TSTA3-208ENST00000528920 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-208ENST00000528920 SOGA1O94964 1423 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-208ENST00000528920 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-208ENST00000528920 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-208ENST00000528920 TOP2BQ02880 1626 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-208ENST00000528920 SYNJ1O43426 1573 aa25.42■■□□□ 1.66
TSTA3-208ENST00000528920 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-208ENST00000528920 WDR97A6NE52 1622 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-208ENST00000528920 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.641e-6■■■■■ 34.6
TSTA3-208ENST00000528920 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-208ENST00000528920 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-208ENST00000528920 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-208ENST00000528920 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-208ENST00000528920 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-208ENST00000528920 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGEF11O15085 1522 aa25.15■■□□□ 1.62
TSTA3-208ENST00000528920 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.15■■□□□ 1.62
TSTA3-208ENST00000528920 GRIN2BQ13224 1484 aa25.14■■□□□ 1.61
TSTA3-208ENST00000528920 PBRM1Q86U86 1689 aa25.13■■□□□ 1.61
TSTA3-208ENST00000528920 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.08■■□□□ 1.6
TSTA3-208ENST00000528920 FBLN2P98095 1184 aa25.07■■□□□ 1.6
TSTA3-208ENST00000528920 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TSTA3-208ENST00000528920 CHD1O14646 1710 aa25.06■■□□□ 1.6
TSTA3-208ENST00000528920 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-208ENST00000528920 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.96■■□□□ 1.59
TSTA3-208ENST00000528920 SYNJ2O15056 1496 aa24.96■■□□□ 1.59
TSTA3-208ENST00000528920 KIF27Q86VH2 1401 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-208ENST00000528920 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TSTA3-208ENST00000528920 ADAMTS12P58397 1594 aa24.92■■□□□ 1.58
TSTA3-208ENST00000528920 ARAP1Q96P48 1450 aa24.9■■□□□ 1.58
TSTA3-208ENST00000528920 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.86■■□□□ 1.57
TSTA3-208ENST00000528920 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TSTA3-208ENST00000528920 GRIN2AQ12879 1464 aa24.82■■□□□ 1.56
TSTA3-208ENST00000528920 IGF1RP08069 1367 aa24.81■■□□□ 1.56
TSTA3-208ENST00000528920 CUL7Q14999 1698 aa24.78■■□□□ 1.56
TSTA3-208ENST00000528920 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.76■■□□□ 1.55
TSTA3-208ENST00000528920 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.74■■□□□ 1.55
TSTA3-208ENST00000528920 NUP160Q12769 1436 aa24.7■■□□□ 1.55
TSTA3-208ENST00000528920 CEP170Q5SW79 1584 aa24.7■■□□□ 1.54
TSTA3-208ENST00000528920 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.69■■□□□ 1.54
TSTA3-208ENST00000528920 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.66■■□□□ 1.54
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