RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528803.1

SLC6A9-210, Transcript of solute carrier family 6 member 9, humanhuman

TSL 4

Gene SLC6A9, Length 524 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9-210ENST00000528803 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.14■■■■■ 6.1
SLC6A9-210ENST00000528803 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.55■■■■■ 5.2
SLC6A9-210ENST00000528803 ABCC9O60706 1549 aa46.96■■■■■ 5.11
SLC6A9-210ENST00000528803 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45■■■■■ 4.79
SLC6A9-210ENST00000528803 NACADO15069 1562 aa44.8■■■■■ 4.76
SLC6A9-210ENST00000528803 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.6■■■■■ 4.73
SLC6A9-210ENST00000528803 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.35■■■■■ 4.69
SLC6A9-210ENST00000528803 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
SLC6A9-210ENST00000528803 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.97■■■■■ 4.63
SLC6A9-210ENST00000528803 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.93■■■■■ 4.62
SLC6A9-210ENST00000528803 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.75■■■■■ 4.59
SLC6A9-210ENST00000528803 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.58■■■■■ 4.57
SLC6A9-210ENST00000528803 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.47■■■■■ 4.55
SLC6A9-210ENST00000528803 SCRIBQ14160 1630 aa43.3■■■■■ 4.52
SLC6A9-210ENST00000528803 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.19■■■■■ 4.5
SLC6A9-210ENST00000528803 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
SLC6A9-210ENST00000528803 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.47■■■■■ 4.39
SLC6A9-210ENST00000528803 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.27■■■■■ 4.36
SLC6A9-210ENST00000528803 SMARCA4P51532 1647 aa41.37■■■■■ 4.21
SLC6A9-210ENST00000528803 NCAPD3P42695 1498 aa41.31■■■■■ 4.2
SLC6A9-210ENST00000528803 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
SLC6A9-210ENST00000528803 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.25■■■■■ 4.19
SLC6A9-210ENST00000528803 SMARCA2P51531 1590 aa41.23■■■■■ 4.19
SLC6A9-210ENST00000528803 HMGXB3Q12766 1538 aa41.1■■■■■ 4.17
SLC6A9-210ENST00000528803 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.97■■■■■ 4.15
SLC6A9-210ENST00000528803 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
SLC6A9-210ENST00000528803 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.92■■■■■ 4.14
SLC6A9-210ENST00000528803 ERCC6Q03468 1493 aa40.58■■■■■ 4.09
SLC6A9-210ENST00000528803 WIZO95785 1651 aa40.47■■■■■ 4.07
SLC6A9-210ENST00000528803 NESP48681 1621 aa40.45■■■■■ 4.07
SLC6A9-210ENST00000528803 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.35■■■■■ 4.05
SLC6A9-210ENST00000528803 CUX2O14529 1486 aa40.33■■■■■ 4.05
SLC6A9-210ENST00000528803 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
SLC6A9-210ENST00000528803 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC6A9-210ENST00000528803 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.08■■■■■ 4.01
SLC6A9-210ENST00000528803 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
SLC6A9-210ENST00000528803 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.01■■■■■ 4
SLC6A9-210ENST00000528803 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
SLC6A9-210ENST00000528803 CFTRP13569 1480 aa39.74■■■■□ 3.95
SLC6A9-210ENST00000528803 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.71■■■■□ 3.95
SLC6A9-210ENST00000528803 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.68■■■■□ 3.94
SLC6A9-210ENST00000528803 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.64■■■■□ 3.94
SLC6A9-210ENST00000528803 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.63■■■■□ 3.93
SLC6A9-210ENST00000528803 WDR62O43379 1518 aa39.6■■■■□ 3.93
SLC6A9-210ENST00000528803 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.53■■■■□ 3.92
SLC6A9-210ENST00000528803 PRDM2Q13029 1718 aa39.45■■■■□ 3.91
SLC6A9-210ENST00000528803 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
SLC6A9-210ENST00000528803 ABCC8Q09428 1581 aa38.95■■■■□ 3.83
SLC6A9-210ENST00000528803 TOPBP1Q92547 1522 aa38.94■■■■□ 3.82
SLC6A9-210ENST00000528803 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.88■■■■□ 3.81
SLC6A9-210ENST00000528803 IFT140Q96RY7 1462 aa38.86■■■■□ 3.81
SLC6A9-210ENST00000528803 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
SLC6A9-210ENST00000528803 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
SLC6A9-210ENST00000528803 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
SLC6A9-210ENST00000528803 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
SLC6A9-210ENST00000528803 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
SLC6A9-210ENST00000528803 OSCARQ8IYS5 282 aa38.52■■■■□ 3.76
SLC6A9-210ENST00000528803 CUX1P39880 1505 aa38.43■■■■□ 3.74
SLC6A9-210ENST00000528803 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.41■■■■□ 3.74
SLC6A9-210ENST00000528803 SOGA1O94964 1423 aa38.4■■■■□ 3.74
SLC6A9-210ENST00000528803 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.73
SLC6A9-210ENST00000528803 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.38■■■■□ 3.73
SLC6A9-210ENST00000528803 WDR97A6NE52 1622 aa38.29■■■■□ 3.72
SLC6A9-210ENST00000528803 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
SLC6A9-210ENST00000528803 CHD1O14646 1710 aa38.16■■■■□ 3.7
SLC6A9-210ENST00000528803 TRIM41Q8WV44 630 aa38.13■■■■□ 3.69
SLC6A9-210ENST00000528803 FBLN2P98095 1184 aa38.06■■■■□ 3.68
SLC6A9-210ENST00000528803 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.06■■■■□ 3.68
SLC6A9-210ENST00000528803 GRIN2BQ13224 1484 aa38.04■■■■□ 3.68
SLC6A9-210ENST00000528803 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.03■■■■□ 3.68
SLC6A9-210ENST00000528803 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.02■■■■□ 3.68
SLC6A9-210ENST00000528803 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.67
SLC6A9-210ENST00000528803 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.01■■■■□ 3.67
SLC6A9-210ENST00000528803 TOP2BQ02880 1626 aa38■■■■□ 3.67
SLC6A9-210ENST00000528803 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.98■■■■□ 3.67
SLC6A9-210ENST00000528803 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.98■■■■□ 3.67
SLC6A9-210ENST00000528803 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.98■■■■□ 3.67
SLC6A9-210ENST00000528803 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.96■■■■□ 3.67
SLC6A9-210ENST00000528803 PBRM1Q86U86 1689 aa37.95■■■■□ 3.67
SLC6A9-210ENST00000528803 SYNJ1O43426 1573 aa37.94■■■■□ 3.66
SLC6A9-210ENST00000528803 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.92■■■■□ 3.66
SLC6A9-210ENST00000528803 ARHGEF11O15085 1522 aa37.92■■■■□ 3.66
SLC6A9-210ENST00000528803 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.88■■■■□ 3.65
SLC6A9-210ENST00000528803 SYNJ2O15056 1496 aa37.86■■■■□ 3.65
SLC6A9-210ENST00000528803 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.72■■■■□ 3.63
SLC6A9-210ENST00000528803 ADAMTS12P58397 1594 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC6A9-210ENST00000528803 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.57■■■■□ 3.61
SLC6A9-210ENST00000528803 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.56■■■■□ 3.6
SLC6A9-210ENST00000528803 ARAP1Q96P48 1450 aa37.56■■■■□ 3.6
SLC6A9-210ENST00000528803 GRIN2AQ12879 1464 aa37.55■■■■□ 3.6
SLC6A9-210ENST00000528803 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.52■■■■□ 3.6
SLC6A9-210ENST00000528803 NUP160Q12769 1436 aa37.38■■■■□ 3.57
SLC6A9-210ENST00000528803 CEP170Q5SW79 1584 aa37.37■■■■□ 3.57
SLC6A9-210ENST00000528803 KIF27Q86VH2 1401 aa37.28■■■■□ 3.56
SLC6A9-210ENST00000528803 SHROOM2Q13796 1616 aa37.18■■■■□ 3.54
SLC6A9-210ENST00000528803 CUL7Q14999 1698 aa37.16■■■■□ 3.54
SLC6A9-210ENST00000528803 IGF1RP08069 1367 aa37.13■■■■□ 3.53
SLC6A9-210ENST00000528803 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.12■■■■□ 3.53
SLC6A9-210ENST00000528803 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.07■■■■□ 3.53
SLC6A9-210ENST00000528803 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
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