RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528592.5

PAK1-211, Transcript of p21 (RAC1) activated kinase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PAK1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1-211ENST00000528592 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.76■■■■■ 4.44
PAK1-211ENST00000528592 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.37■■■■□ 3.73
PAK1-211ENST00000528592 ABCC9O60706 1549 aa38.29■■■■□ 3.72
PAK1-211ENST00000528592 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.47■■■■□ 3.43
PAK1-211ENST00000528592 NACADO15069 1562 aa36.21■■■■□ 3.39
PAK1-211ENST00000528592 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.06■■■■□ 3.36
PAK1-211ENST00000528592 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.79■■■■□ 3.32
PAK1-211ENST00000528592 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.73■■■■□ 3.31
PAK1-211ENST00000528592 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.69■■■■□ 3.3
PAK1-211ENST00000528592 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.3
PAK1-211ENST00000528592 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
PAK1-211ENST00000528592 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.42■■■■□ 3.26
PAK1-211ENST00000528592 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.29■■■■□ 3.24
PAK1-211ENST00000528592 SCRIBQ14160 1630 aa35.02■■■■□ 3.2
PAK1-211ENST00000528592 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.88■■■■□ 3.17
PAK1-211ENST00000528592 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.6■■■■□ 3.13
PAK1-211ENST00000528592 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
PAK1-211ENST00000528592 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.46■■■■□ 3.11
PAK1-211ENST00000528592 NCAPD3P42695 1498 aa33.39■■■□□ 2.94
PAK1-211ENST00000528592 SMARCA4P51532 1647 aa33.38■■■□□ 2.93
PAK1-211ENST00000528592 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.34■■■□□ 2.93
PAK1-211ENST00000528592 SMARCA2P51531 1590 aa33.26■■■□□ 2.92
PAK1-211ENST00000528592 HMGXB3Q12766 1538 aa33.2■■■□□ 2.91
PAK1-211ENST00000528592 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
PAK1-211ENST00000528592 ERCC6Q03468 1493 aa33.05■■■□□ 2.88
PAK1-211ENST00000528592 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
PAK1-211ENST00000528592 PEG3Q9GZU2 1588 aa33■■■□□ 2.87
PAK1-211ENST00000528592 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.98■■■□□ 2.87
PAK1-211ENST00000528592 NESP48681 1621 aa32.93■■■□□ 2.86
PAK1-211ENST00000528592 CUX2O14529 1486 aa32.92■■■□□ 2.86
PAK1-211ENST00000528592 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.76■■■□□ 2.83
PAK1-211ENST00000528592 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.68■■■□□ 2.82
PAK1-211ENST00000528592 WIZO95785 1651 aa32.62■■■□□ 2.81
PAK1-211ENST00000528592 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
PAK1-211ENST00000528592 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.56■■■□□ 2.8
PAK1-211ENST00000528592 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.45■■■□□ 2.79
PAK1-211ENST00000528592 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.39■■■□□ 2.78
PAK1-211ENST00000528592 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
PAK1-211ENST00000528592 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.21■■■□□ 2.75
PAK1-211ENST00000528592 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
PAK1-211ENST00000528592 WDR62O43379 1518 aa32.13■■■□□ 2.73
PAK1-211ENST00000528592 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.1■■■□□ 2.73
PAK1-211ENST00000528592 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.07■■■□□ 2.72
PAK1-211ENST00000528592 CFTRP13569 1480 aa32.05■■■□□ 2.72
PAK1-211ENST00000528592 PRDM2Q13029 1718 aa31.85■■■□□ 2.69
PAK1-211ENST00000528592 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
PAK1-211ENST00000528592 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.79■■■□□ 2.68
PAK1-211ENST00000528592 TOPBP1Q92547 1522 aa31.48■■■□□ 2.63
PAK1-211ENST00000528592 TRIM41Q8WV44 630 aa31.44■■■□□ 2.62
PAK1-211ENST00000528592 IFT140Q96RY7 1462 aa31.43■■■□□ 2.62
PAK1-211ENST00000528592 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
PAK1-211ENST00000528592 OSCARQ8IYS5 282 aa31.39■■■□□ 2.62
PAK1-211ENST00000528592 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.38■■■□□ 2.61
PAK1-211ENST00000528592 ABCC8Q09428 1581 aa31.36■■■□□ 2.61
PAK1-211ENST00000528592 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
PAK1-211ENST00000528592 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
PAK1-211ENST00000528592 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PAK1-211ENST00000528592 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.12■■■□□ 2.57
PAK1-211ENST00000528592 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.08■■■□□ 2.57
PAK1-211ENST00000528592 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.08■■■□□ 2.57
PAK1-211ENST00000528592 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.08■■■□□ 2.57
PAK1-211ENST00000528592 CHD1O14646 1710 aa31.06■■■□□ 2.56
PAK1-211ENST00000528592 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.06■■■□□ 2.56
PAK1-211ENST00000528592 SOGA1O94964 1423 aa30.99■■■□□ 2.55
PAK1-211ENST00000528592 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.99■■■□□ 2.55
PAK1-211ENST00000528592 CUX1P39880 1505 aa30.98■■■□□ 2.55
PAK1-211ENST00000528592 ARHGEF11O15085 1522 aa30.97■■■□□ 2.55
PAK1-211ENST00000528592 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
PAK1-211ENST00000528592 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
PAK1-211ENST00000528592 FBLN2P98095 1184 aa30.9■■■□□ 2.54
PAK1-211ENST00000528592 WDR97A6NE52 1622 aa30.86■■■□□ 2.53
PAK1-211ENST00000528592 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.83■■■□□ 2.53
PAK1-211ENST00000528592 GRIN2BQ13224 1484 aa30.72■■■□□ 2.51
PAK1-211ENST00000528592 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
PAK1-211ENST00000528592 PBRM1Q86U86 1689 aa30.7■■■□□ 2.5
PAK1-211ENST00000528592 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.69■■■□□ 2.5
PAK1-211ENST00000528592 ARAP1Q96P48 1450 aa30.67■■■□□ 2.5
PAK1-211ENST00000528592 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PAK1-211ENST00000528592 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.64■■■□□ 2.5
PAK1-211ENST00000528592 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.63■■■□□ 2.49
PAK1-211ENST00000528592 SYNJ1O43426 1573 aa30.63■■■□□ 2.49
PAK1-211ENST00000528592 SYNJ2O15056 1496 aa30.62■■■□□ 2.49
PAK1-211ENST00000528592 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.61■■■□□ 2.49
PAK1-211ENST00000528592 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.61■■■□□ 2.49
PAK1-211ENST00000528592 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.53■■■□□ 2.48
PAK1-211ENST00000528592 TOP2BQ02880 1626 aa30.5■■■□□ 2.47
PAK1-211ENST00000528592 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
PAK1-211ENST00000528592 ADAMTS12P58397 1594 aa30.37■■■□□ 2.45
PAK1-211ENST00000528592 GRIN2AQ12879 1464 aa30.35■■■□□ 2.45
PAK1-211ENST00000528592 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
PAK1-211ENST00000528592 CEP170Q5SW79 1584 aa30.27■■■□□ 2.44
PAK1-211ENST00000528592 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.23■■■□□ 2.43
PAK1-211ENST00000528592 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.23■■■□□ 2.43
PAK1-211ENST00000528592 NUP160Q12769 1436 aa30.22■■■□□ 2.43
PAK1-211ENST00000528592 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.2■■■□□ 2.43
PAK1-211ENST00000528592 SHROOM2Q13796 1616 aa30.11■■■□□ 2.41
PAK1-211ENST00000528592 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.96■■■□□ 2.39
PAK1-211ENST00000528592 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PAK1-211ENST00000528592 JPH4Q96JJ6 628 aa29.87■■■□□ 2.37
PAK1-211ENST00000528592 KIF27Q86VH2 1401 aa29.87■■■□□ 2.37
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