RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528570.1

TTC36-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 36, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC36, Length 1,009 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC36-202ENST00000528570 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.5■■■■■ 6.96
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TTC36-202ENST00000528570 SMARCA2P51531 1590 aa45.18■■■■■ 4.82
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TTC36-202ENST00000528570 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.07■■■■■ 4.81
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TTC36-202ENST00000528570 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.15■■■■■ 4.66
TTC36-202ENST00000528570 ERCC6Q03468 1493 aa44.14■■■■■ 4.66
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TTC36-202ENST00000528570 CADPSQ9ULU8 1353 aa44■■■■■ 4.63
TTC36-202ENST00000528570 CUX2O14529 1486 aa43.94■■■■■ 4.62
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TTC36-202ENST00000528570 CFTRP13569 1480 aa43.7■■■■■ 4.59
TTC36-202ENST00000528570 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.56■■■■■ 4.56
TTC36-202ENST00000528570 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.44■■■■■ 4.54
TTC36-202ENST00000528570 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.43■■■■■ 4.54
TTC36-202ENST00000528570 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.38■■■■■ 4.54
TTC36-202ENST00000528570 WDR62O43379 1518 aa43.34■■■■■ 4.53
TTC36-202ENST00000528570 PRDM2Q13029 1718 aa43.19■■■■■ 4.5
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TTC36-202ENST00000528570 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
TTC36-202ENST00000528570 TOPBP1Q92547 1522 aa42.73■■■■■ 4.43
TTC36-202ENST00000528570 ABCC8Q09428 1581 aa42.69■■■■■ 4.42
TTC36-202ENST00000528570 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.62■■■■■ 4.41
TTC36-202ENST00000528570 IFT140Q96RY7 1462 aa42.53■■■■■ 4.4
TTC36-202ENST00000528570 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
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TTC36-202ENST00000528570 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.16■■■■■ 4.34
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TTC36-202ENST00000528570 WDR97A6NE52 1622 aa41.94■■■■■ 4.3
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TTC36-202ENST00000528570 GRIN2BQ13224 1484 aa41.69■■■■■ 4.26
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TTC36-202ENST00000528570 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.63■■■■■ 4.26
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TTC36-202ENST00000528570 ARHGEF11O15085 1522 aa41.36■■■■■ 4.21
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TTC36-202ENST00000528570 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.62■■■■■ 4.09
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