RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528150.1

USP33-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 33, humanhuman

TSL 3

Gene USP33, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33-215ENST00000528150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.12■■■■■ 4.01
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USP33-215ENST00000528150 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.94■■■■□ 3.02
USP33-215ENST00000528150 NACADO15069 1562 aa33.81■■■■□ 3
USP33-215ENST00000528150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.73■■■□□ 2.99
USP33-215ENST00000528150 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.48■■■□□ 2.95
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USP33-215ENST00000528150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.23■■■□□ 2.91
USP33-215ENST00000528150 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.08■■■□□ 2.89
USP33-215ENST00000528150 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.87■■■□□ 2.85
USP33-215ENST00000528150 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.72■■■□□ 2.83
USP33-215ENST00000528150 SCRIBQ14160 1630 aa32.66■■■□□ 2.82
USP33-215ENST00000528150 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.57■■■□□ 2.8
USP33-215ENST00000528150 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.42■■■□□ 2.78
USP33-215ENST00000528150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
USP33-215ENST00000528150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.92■■■□□ 2.7
USP33-215ENST00000528150 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.77■■■□□ 2.68
USP33-215ENST00000528150 SMARCA4P51532 1647 aa31.22■■■□□ 2.59
USP33-215ENST00000528150 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
USP33-215ENST00000528150 SMARCA2P51531 1590 aa31.15■■■□□ 2.58
USP33-215ENST00000528150 NCAPD3P42695 1498 aa31.11■■■□□ 2.57
USP33-215ENST00000528150 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.08■■■□□ 2.57
USP33-215ENST00000528150 HMGXB3Q12766 1538 aa31■■■□□ 2.55
USP33-215ENST00000528150 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
USP33-215ENST00000528150 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.9■■■□□ 2.54
USP33-215ENST00000528150 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.86■■■□□ 2.53
USP33-215ENST00000528150 ERCC6Q03468 1493 aa30.57■■■□□ 2.48
USP33-215ENST00000528150 WIZO95785 1651 aa30.56■■■□□ 2.48
USP33-215ENST00000528150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.43■■■□□ 2.46
USP33-215ENST00000528150 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
USP33-215ENST00000528150 NESP48681 1621 aa30.38■■■□□ 2.45
USP33-215ENST00000528150 CUX2O14529 1486 aa30.3■■■□□ 2.44
USP33-215ENST00000528150 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
USP33-215ENST00000528150 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.26■■■□□ 2.43
USP33-215ENST00000528150 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.22■■■□□ 2.43
USP33-215ENST00000528150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.12■■■□□ 2.41
USP33-215ENST00000528150 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
USP33-215ENST00000528150 CFTRP13569 1480 aa29.95■■■□□ 2.39
USP33-215ENST00000528150 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.93■■■□□ 2.38
USP33-215ENST00000528150 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.91■■■□□ 2.38
USP33-215ENST00000528150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.89■■■□□ 2.38
USP33-215ENST00000528150 PRDM2Q13029 1718 aa29.87■■■□□ 2.37
USP33-215ENST00000528150 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.85■■■□□ 2.37
USP33-215ENST00000528150 WDR62O43379 1518 aa29.78■■■□□ 2.36
USP33-215ENST00000528150 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.58■■■□□ 2.33
USP33-215ENST00000528150 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
USP33-215ENST00000528150 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
USP33-215ENST00000528150 ABCC8Q09428 1581 aa29.48■■■□□ 2.31
USP33-215ENST00000528150 TOPBP1Q92547 1522 aa29.36■■■□□ 2.29
USP33-215ENST00000528150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.35■■■□□ 2.29
USP33-215ENST00000528150 IFT140Q96RY7 1462 aa29.29■■■□□ 2.28
USP33-215ENST00000528150 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
USP33-215ENST00000528150 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
USP33-215ENST00000528150 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
USP33-215ENST00000528150 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
USP33-215ENST00000528150 OSCARQ8IYS5 282 aa28.99■■■□□ 2.23
USP33-215ENST00000528150 SOGA1O94964 1423 aa28.99■■■□□ 2.23
USP33-215ENST00000528150 CUX1P39880 1505 aa28.99■■■□□ 2.23
USP33-215ENST00000528150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.98■■■□□ 2.23
USP33-215ENST00000528150 WDR97A6NE52 1622 aa28.94■■■□□ 2.22
USP33-215ENST00000528150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.91■■■□□ 2.22
USP33-215ENST00000528150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.226e-7■■□□□ 11.9
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USP33-215ENST00000528150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
USP33-215ENST00000528150 TOP2BQ02880 1626 aa28.75■■■□□ 2.19
USP33-215ENST00000528150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.75■■■□□ 2.19
USP33-215ENST00000528150 CHD1O14646 1710 aa28.74■■■□□ 2.19
USP33-215ENST00000528150 FBLN2P98095 1184 aa28.73■■■□□ 2.19
USP33-215ENST00000528150 GRIN2BQ13224 1484 aa28.72■■■□□ 2.19
USP33-215ENST00000528150 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.7■■■□□ 2.19
USP33-215ENST00000528150 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
USP33-215ENST00000528150 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.67■■■□□ 2.18
USP33-215ENST00000528150 PBRM1Q86U86 1689 aa28.67■■■□□ 2.18
USP33-215ENST00000528150 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.66■■■□□ 2.18
USP33-215ENST00000528150 SYNJ1O43426 1573 aa28.65■■■□□ 2.18
USP33-215ENST00000528150 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
USP33-215ENST00000528150 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.6■■■□□ 2.17
USP33-215ENST00000528150 TRIM41Q8WV44 630 aa28.57■■■□□ 2.16
USP33-215ENST00000528150 SYNJ2O15056 1496 aa28.55■■■□□ 2.16
USP33-215ENST00000528150 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.51■■■□□ 2.15
USP33-215ENST00000528150 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.51■■■□□ 2.15
USP33-215ENST00000528150 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.51■■■□□ 2.15
USP33-215ENST00000528150 ARHGEF11O15085 1522 aa28.46■■■□□ 2.15
USP33-215ENST00000528150 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.4■■■□□ 2.14
USP33-215ENST00000528150 ADAMTS12P58397 1594 aa28.37■■■□□ 2.13
USP33-215ENST00000528150 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.35■■■□□ 2.13
USP33-215ENST00000528150 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.34■■■□□ 2.13
USP33-215ENST00000528150 GRIN2AQ12879 1464 aa28.32■■■□□ 2.12
USP33-215ENST00000528150 KIF27Q86VH2 1401 aa28.26■■■□□ 2.11
USP33-215ENST00000528150 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.23■■■□□ 2.11
USP33-215ENST00000528150 ARAP1Q96P48 1450 aa28.17■■■□□ 2.1
USP33-215ENST00000528150 NUP160Q12769 1436 aa28.16■■■□□ 2.1
USP33-215ENST00000528150 CUL7Q14999 1698 aa28.15■■■□□ 2.1
USP33-215ENST00000528150 CEP170Q5SW79 1584 aa28.13■■■□□ 2.09
USP33-215ENST00000528150 IGF1RP08069 1367 aa28.04■■■□□ 2.08
USP33-215ENST00000528150 SHROOM2Q13796 1616 aa28■■■□□ 2.07
USP33-215ENST00000528150 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.95■■■□□ 2.06
USP33-215ENST00000528150 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.95■■■□□ 2.06
USP33-215ENST00000528150 JPH4Q96JJ6 628 aa27.91■■■□□ 2.06
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