RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528068.5

ROBO3-209, Transcript of roundabout guidance receptor 3, humanhuman

TSL 4

Gene ROBO3, Length 572 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3-209ENST00000528068 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.48■■■■□ 3.75
ROBO3-209ENST00000528068 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.42■■■■□ 3.1
ROBO3-209ENST00000528068 ABCC9O60706 1549 aa34.2■■■■□ 3.06
ROBO3-209ENST00000528068 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.65■■■□□ 2.82
ROBO3-209ENST00000528068 NACADO15069 1562 aa32.48■■■□□ 2.79
ROBO3-209ENST00000528068 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.3■■■□□ 2.76
ROBO3-209ENST00000528068 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.14■■■□□ 2.74
ROBO3-209ENST00000528068 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
ROBO3-209ENST00000528068 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.89■■■□□ 2.7
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ROBO3-209ENST00000528068 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.86■■■□□ 2.69
ROBO3-209ENST00000528068 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.81■■■□□ 2.68
ROBO3-209ENST00000528068 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.71■■■□□ 2.67
ROBO3-209ENST00000528068 SCRIBQ14160 1630 aa31.39■■■□□ 2.62
ROBO3-209ENST00000528068 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.32■■■□□ 2.6
ROBO3-209ENST00000528068 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
ROBO3-209ENST00000528068 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.9■■■□□ 2.54
ROBO3-209ENST00000528068 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.78■■■□□ 2.52
ROBO3-209ENST00000528068 NCAPD3P42695 1498 aa29.99■■■□□ 2.39
ROBO3-209ENST00000528068 SMARCA4P51532 1647 aa29.97■■■□□ 2.39
ROBO3-209ENST00000528068 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.94■■■□□ 2.38
ROBO3-209ENST00000528068 SMARCA2P51531 1590 aa29.86■■■□□ 2.37
ROBO3-209ENST00000528068 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ROBO3-209ENST00000528068 HMGXB3Q12766 1538 aa29.81■■■□□ 2.36
ROBO3-209ENST00000528068 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.69■■■□□ 2.34
ROBO3-209ENST00000528068 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.66■■■□□ 2.34
ROBO3-209ENST00000528068 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
ROBO3-209ENST00000528068 ERCC6Q03468 1493 aa29.5■■■□□ 2.31
ROBO3-209ENST00000528068 NESP48681 1621 aa29.45■■■□□ 2.31
ROBO3-209ENST00000528068 CUX2O14529 1486 aa29.38■■■□□ 2.29
ROBO3-209ENST00000528068 WIZO95785 1651 aa29.3■■■□□ 2.28
ROBO3-209ENST00000528068 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.27■■■□□ 2.28
ROBO3-209ENST00000528068 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ROBO3-209ENST00000528068 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
ROBO3-209ENST00000528068 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.09■■■□□ 2.25
ROBO3-209ENST00000528068 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.08■■■□□ 2.25
ROBO3-209ENST00000528068 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.06■■■□□ 2.24
ROBO3-209ENST00000528068 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.06■■■□□ 2.24
ROBO3-209ENST00000528068 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ROBO3-209ENST00000528068 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.85■■■□□ 2.21
ROBO3-209ENST00000528068 CFTRP13569 1480 aa28.82■■■□□ 2.2
ROBO3-209ENST00000528068 WDR62O43379 1518 aa28.78■■■□□ 2.2
ROBO3-209ENST00000528068 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.78■■■□□ 2.2
ROBO3-209ENST00000528068 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.76■■■□□ 2.19
ROBO3-209ENST00000528068 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.62■■■□□ 2.17
ROBO3-209ENST00000528068 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ROBO3-209ENST00000528068 PRDM2Q13029 1718 aa28.52■■■□□ 2.16
ROBO3-209ENST00000528068 TOPBP1Q92547 1522 aa28.25■■■□□ 2.11
ROBO3-209ENST00000528068 IFT140Q96RY7 1462 aa28.19■■■□□ 2.1
ROBO3-209ENST00000528068 ABCC8Q09428 1581 aa28.18■■■□□ 2.1
ROBO3-209ENST00000528068 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.17■■■□□ 2.1
ROBO3-209ENST00000528068 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
ROBO3-209ENST00000528068 OSCARQ8IYS5 282 aa28.03■■■□□ 2.08
ROBO3-209ENST00000528068 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
ROBO3-209ENST00000528068 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
ROBO3-209ENST00000528068 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
ROBO3-209ENST00000528068 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
ROBO3-209ENST00000528068 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.06
ROBO3-209ENST00000528068 TRIM41Q8WV44 630 aa27.88■■■□□ 2.05
ROBO3-209ENST00000528068 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.87■■■□□ 2.05
ROBO3-209ENST00000528068 CUX1P39880 1505 aa27.86■■■□□ 2.05
ROBO3-209ENST00000528068 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.83■■■□□ 2.05
ROBO3-209ENST00000528068 SOGA1O94964 1423 aa27.83■■■□□ 2.05
ROBO3-209ENST00000528068 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
ROBO3-209ENST00000528068 WDR97A6NE52 1622 aa27.71■■■□□ 2.03
ROBO3-209ENST00000528068 CHD1O14646 1710 aa27.71■■■□□ 2.03
ROBO3-209ENST00000528068 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.68■■■□□ 2.02
ROBO3-209ENST00000528068 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.68■■■□□ 2.02
ROBO3-209ENST00000528068 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.68■■■□□ 2.02
ROBO3-209ENST00000528068 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.64■■■□□ 2.01
ROBO3-209ENST00000528068 ARHGEF11O15085 1522 aa27.63■■■□□ 2.01
ROBO3-209ENST00000528068 FBLN2P98095 1184 aa27.62■■■□□ 2.01
ROBO3-209ENST00000528068 GRIN2BQ13224 1484 aa27.57■■■□□ 2
ROBO3-209ENST00000528068 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
ROBO3-209ENST00000528068 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.54■■■□□ 2
ROBO3-209ENST00000528068 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.51■■□□□ 1.99
ROBO3-209ENST00000528068 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.49■■□□□ 1.99
ROBO3-209ENST00000528068 PBRM1Q86U86 1689 aa27.48■■□□□ 1.99
ROBO3-209ENST00000528068 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.47■■□□□ 1.99
ROBO3-209ENST00000528068 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
ROBO3-209ENST00000528068 SYNJ2O15056 1496 aa27.46■■□□□ 1.99
ROBO3-209ENST00000528068 TOP2BQ02880 1626 aa27.46■■□□□ 1.99
ROBO3-209ENST00000528068 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
ROBO3-209ENST00000528068 SYNJ1O43426 1573 aa27.45■■□□□ 1.99
ROBO3-209ENST00000528068 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.43■■□□□ 1.98
ROBO3-209ENST00000528068 ARAP1Q96P48 1450 aa27.38■■□□□ 1.97
ROBO3-209ENST00000528068 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.36■■□□□ 1.97
ROBO3-209ENST00000528068 ADAMTS12P58397 1594 aa27.26■■□□□ 1.96
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ROBO3-209ENST00000528068 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.19■■□□□ 1.94
ROBO3-209ENST00000528068 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.17■■□□□ 1.94
ROBO3-209ENST00000528068 NUP160Q12769 1436 aa27.14■■□□□ 1.93
ROBO3-209ENST00000528068 CEP170Q5SW79 1584 aa27.13■■□□□ 1.93
ROBO3-209ENST00000528068 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.02■■□□□ 1.92
ROBO3-209ENST00000528068 SHROOM2Q13796 1616 aa26.99■■□□□ 1.91
ROBO3-209ENST00000528068 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
ROBO3-209ENST00000528068 KIF27Q86VH2 1401 aa26.92■■□□□ 1.9
ROBO3-209ENST00000528068 IGF1RP08069 1367 aa26.88■■□□□ 1.89
ROBO3-209ENST00000528068 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.88■■□□□ 1.89
ROBO3-209ENST00000528068 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
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