RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528063.5

CNIH2-202, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CNIH2, Length 1,142 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2-202ENST00000528063 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.88■■■■■ 7.34
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CNIH2-202ENST00000528063 ABCC9O60706 1549 aa53.93■■■■■ 6.22
CNIH2-202ENST00000528063 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.45■■■■■ 5.83
CNIH2-202ENST00000528063 NACADO15069 1562 aa51.23■■■■■ 5.79
CNIH2-202ENST00000528063 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.01■■■■■ 5.76
CNIH2-202ENST00000528063 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.68■■■■■ 5.7
CNIH2-202ENST00000528063 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.6■■■■■ 5.69
CNIH2-202ENST00000528063 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.59■■■■■ 5.69
CNIH2-202ENST00000528063 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.27■■■■■ 5.64
CNIH2-202ENST00000528063 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.26■■■■■ 5.64
CNIH2-202ENST00000528063 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.23■■■■■ 5.63
CNIH2-202ENST00000528063 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.16■■■■■ 5.62
CNIH2-202ENST00000528063 SCRIBQ14160 1630 aa49.68■■■■■ 5.54
CNIH2-202ENST00000528063 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.24■■■■■ 5.47
CNIH2-202ENST00000528063 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.77■■■■■ 5.4
CNIH2-202ENST00000528063 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
CNIH2-202ENST00000528063 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.46■■■■■ 5.35
CNIH2-202ENST00000528063 SMARCA4P51532 1647 aa47.42■■■■■ 5.18
CNIH2-202ENST00000528063 NCAPD3P42695 1498 aa47.31■■■■■ 5.16
CNIH2-202ENST00000528063 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.3■■■■■ 5.16
CNIH2-202ENST00000528063 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.15■■■■■ 5.14
CNIH2-202ENST00000528063 SMARCA2P51531 1590 aa47.1■■■■■ 5.13
CNIH2-202ENST00000528063 HMGXB3Q12766 1538 aa47.03■■■■■ 5.12
CNIH2-202ENST00000528063 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.01■■■■■ 5.12
CNIH2-202ENST00000528063 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.93■■■■■ 5.1
CNIH2-202ENST00000528063 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
CNIH2-202ENST00000528063 NESP48681 1621 aa46.56■■■■■ 5.04
CNIH2-202ENST00000528063 WIZO95785 1651 aa46.5■■■■■ 5.03
CNIH2-202ENST00000528063 ERCC6Q03468 1493 aa46.37■■■■■ 5.01
CNIH2-202ENST00000528063 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.16■■■■■ 4.98
CNIH2-202ENST00000528063 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.15■■■■■ 4.98
CNIH2-202ENST00000528063 CUX2O14529 1486 aa46.13■■■■■ 4.98
CNIH2-202ENST00000528063 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.99■■■■■ 4.95
CNIH2-202ENST00000528063 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
CNIH2-202ENST00000528063 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.87■■■■■ 4.93
CNIH2-202ENST00000528063 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
CNIH2-202ENST00000528063 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.77■■■■■ 4.92
CNIH2-202ENST00000528063 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.53■■■■■ 4.88
CNIH2-202ENST00000528063 CFTRP13569 1480 aa45.51■■■■■ 4.88
CNIH2-202ENST00000528063 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.45■■■■■ 4.87
CNIH2-202ENST00000528063 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.39■■■■■ 4.86
CNIH2-202ENST00000528063 WDR62O43379 1518 aa45.38■■■■■ 4.86
CNIH2-202ENST00000528063 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.36■■■■■ 4.85
CNIH2-202ENST00000528063 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.34■■■■■ 4.85
CNIH2-202ENST00000528063 PRDM2Q13029 1718 aa45.2■■■■■ 4.83
CNIH2-202ENST00000528063 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
CNIH2-202ENST00000528063 TOPBP1Q92547 1522 aa44.64■■■■■ 4.74
CNIH2-202ENST00000528063 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.5■■■■■ 4.71
CNIH2-202ENST00000528063 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
CNIH2-202ENST00000528063 IFT140Q96RY7 1462 aa44.41■■■■■ 4.7
CNIH2-202ENST00000528063 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
CNIH2-202ENST00000528063 ABCC8Q09428 1581 aa44.38■■■■■ 4.69
CNIH2-202ENST00000528063 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
CNIH2-202ENST00000528063 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
CNIH2-202ENST00000528063 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
CNIH2-202ENST00000528063 CUX1P39880 1505 aa44.13■■■■■ 4.65
CNIH2-202ENST00000528063 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.09■■■■■ 4.65
CNIH2-202ENST00000528063 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.07■■■■■ 4.65
CNIH2-202ENST00000528063 OSCARQ8IYS5 282 aa44.03■■■■■ 4.64
CNIH2-202ENST00000528063 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.02■■■■■ 4.64
CNIH2-202ENST00000528063 SOGA1O94964 1423 aa43.93■■■■■ 4.62
CNIH2-202ENST00000528063 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
CNIH2-202ENST00000528063 CHD1O14646 1710 aa43.84■■■■■ 4.61
CNIH2-202ENST00000528063 WDR97A6NE52 1622 aa43.79■■■■■ 4.6
CNIH2-202ENST00000528063 TRIM41Q8WV44 630 aa43.75■■■■■ 4.59
CNIH2-202ENST00000528063 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.64■■■■■ 4.58
CNIH2-202ENST00000528063 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.64■■■■■ 4.58
CNIH2-202ENST00000528063 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.64■■■■■ 4.58
CNIH2-202ENST00000528063 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.62■■■■■ 4.57
CNIH2-202ENST00000528063 SYNJ1O43426 1573 aa43.55■■■■■ 4.56
CNIH2-202ENST00000528063 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.54■■■■■ 4.56
CNIH2-202ENST00000528063 PBRM1Q86U86 1689 aa43.52■■■■■ 4.56
CNIH2-202ENST00000528063 ARHGEF11O15085 1522 aa43.51■■■■■ 4.56
CNIH2-202ENST00000528063 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.51■■■■■ 4.56
CNIH2-202ENST00000528063 FBLN2P98095 1184 aa43.5■■■■■ 4.55
CNIH2-202ENST00000528063 TOP2BQ02880 1626 aa43.5■■■■■ 4.55
CNIH2-202ENST00000528063 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.49■■■■■ 4.55
CNIH2-202ENST00000528063 GRIN2BQ13224 1484 aa43.49■■■■■ 4.55
CNIH2-202ENST00000528063 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.45■■■■■ 4.55
CNIH2-202ENST00000528063 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.44■■■■■ 4.54
CNIH2-202ENST00000528063 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
CNIH2-202ENST00000528063 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.3■■■■■ 4.52
CNIH2-202ENST00000528063 SYNJ2O15056 1496 aa43.3■■■■■ 4.52
CNIH2-202ENST00000528063 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
CNIH2-202ENST00000528063 ARAP1Q96P48 1450 aa43.16■■■■■ 4.5
CNIH2-202ENST00000528063 ADAMTS12P58397 1594 aa43.11■■■■■ 4.49
CNIH2-202ENST00000528063 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.05■■■■■ 4.48
CNIH2-202ENST00000528063 GRIN2AQ12879 1464 aa42.99■■■■■ 4.47
CNIH2-202ENST00000528063 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.94■■■■■ 4.46
CNIH2-202ENST00000528063 CEP170Q5SW79 1584 aa42.91■■■■■ 4.46
CNIH2-202ENST00000528063 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.87■■■■■ 4.45
CNIH2-202ENST00000528063 NUP160Q12769 1436 aa42.84■■■■■ 4.45
CNIH2-202ENST00000528063 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.78■■■■■ 4.44
CNIH2-202ENST00000528063 SHROOM2Q13796 1616 aa42.66■■■■■ 4.42
CNIH2-202ENST00000528063 IGF1RP08069 1367 aa42.55■■■■■ 4.4
CNIH2-202ENST00000528063 KIF27Q86VH2 1401 aa42.52■■■■■ 4.4
CNIH2-202ENST00000528063 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.5■■■■■ 4.39
CNIH2-202ENST00000528063 CUL7Q14999 1698 aa42.43■■■■■ 4.38
CNIH2-202ENST00000528063 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
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