RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528016.1

ACADM-211, Transcript of acyl-CoA dehydrogenase medium chain, humanhuman

TSL 4

Gene ACADM, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADM-211ENST00000528016 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.36■■■■■ 5.01
ACADM-211ENST00000528016 ABCC9O60706 1549 aa42.24■■■■■ 4.35
ACADM-211ENST00000528016 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.76■■■■■ 4.28
ACADM-211ENST00000528016 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40■■■■□ 3.99
ACADM-211ENST00000528016 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.94■■■■□ 3.98
ACADM-211ENST00000528016 NACADO15069 1562 aa39.55■■■■□ 3.92
ACADM-211ENST00000528016 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.35■■■■□ 3.89
ACADM-211ENST00000528016 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.27■■■■□ 3.88
ACADM-211ENST00000528016 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.16■■■■□ 3.86
ACADM-211ENST00000528016 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.87■■■■□ 3.81
ACADM-211ENST00000528016 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.82■■■■□ 3.8
ACADM-211ENST00000528016 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
ACADM-211ENST00000528016 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.19■■■■□ 3.7
ACADM-211ENST00000528016 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.14■■■■□ 3.7
ACADM-211ENST00000528016 SCRIBQ14160 1630 aa38.12■■■■□ 3.69
ACADM-211ENST00000528016 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.12■■■■□ 3.69
ACADM-211ENST00000528016 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.04■■■■□ 3.68
ACADM-211ENST00000528016 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
ACADM-211ENST00000528016 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.93■■■■□ 3.5
ACADM-211ENST00000528016 NCAPD3P42695 1498 aa36.52■■■■□ 3.44
ACADM-211ENST00000528016 CUX2O14529 1486 aa36.47■■■■□ 3.43
ACADM-211ENST00000528016 ERCC6Q03468 1493 aa36.44■■■■□ 3.42
ACADM-211ENST00000528016 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.39■■■■□ 3.42
ACADM-211ENST00000528016 SMARCA4P51532 1647 aa36.28■■■■□ 3.4
ACADM-211ENST00000528016 HMGXB3Q12766 1538 aa36.23■■■■□ 3.39
ACADM-211ENST00000528016 SMARCA2P51531 1590 aa36.23■■■■□ 3.39
ACADM-211ENST00000528016 NESP48681 1621 aa36.19■■■■□ 3.38
ACADM-211ENST00000528016 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
ACADM-211ENST00000528016 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
ACADM-211ENST00000528016 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
ACADM-211ENST00000528016 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.87■■■■□ 3.33
ACADM-211ENST00000528016 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.77■■■■□ 3.32
ACADM-211ENST00000528016 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.77■■■■□ 3.32
ACADM-211ENST00000528016 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.72■■■■□ 3.31
ACADM-211ENST00000528016 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.56■■■■□ 3.28
ACADM-211ENST00000528016 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.39■■■■□ 3.26
ACADM-211ENST00000528016 WIZO95785 1651 aa35.35■■■■□ 3.25
ACADM-211ENST00000528016 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.32■■■■□ 3.24
ACADM-211ENST00000528016 WDR62O43379 1518 aa35.25■■■■□ 3.23
ACADM-211ENST00000528016 TRIM41Q8WV44 630 aa35.23■■■■□ 3.23
ACADM-211ENST00000528016 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.1■■■■□ 3.21
ACADM-211ENST00000528016 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.03■■■■□ 3.2
ACADM-211ENST00000528016 CFTRP13569 1480 aa34.91■■■■□ 3.18
ACADM-211ENST00000528016 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
ACADM-211ENST00000528016 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
ACADM-211ENST00000528016 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
ACADM-211ENST00000528016 OSCARQ8IYS5 282 aa34.73■■■■□ 3.15
ACADM-211ENST00000528016 PRDM2Q13029 1718 aa34.58■■■■□ 3.13
ACADM-211ENST00000528016 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
ACADM-211ENST00000528016 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.43■■■■□ 3.1
ACADM-211ENST00000528016 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.42■■■■□ 3.1
ACADM-211ENST00000528016 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.42■■■■□ 3.1
ACADM-211ENST00000528016 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.42■■■■□ 3.1
ACADM-211ENST00000528016 IFT140Q96RY7 1462 aa34.39■■■■□ 3.1
ACADM-211ENST00000528016 TOPBP1Q92547 1522 aa34.34■■■■□ 3.09
ACADM-211ENST00000528016 ARHGEF11O15085 1522 aa34.25■■■■□ 3.07
ACADM-211ENST00000528016 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
ACADM-211ENST00000528016 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.16■■■■□ 3.06
ACADM-211ENST00000528016 ABCC8Q09428 1581 aa34.13■■■■□ 3.05
ACADM-211ENST00000528016 CHD1O14646 1710 aa34.1■■■■□ 3.05
ACADM-211ENST00000528016 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
ACADM-211ENST00000528016 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.07■■■■□ 3.052e-27■■■■■ 28.2
ACADM-211ENST00000528016 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.01■■■■□ 3.03
ACADM-211ENST00000528016 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
ACADM-211ENST00000528016 FBLN2P98095 1184 aa33.93■■■■□ 3.02
ACADM-211ENST00000528016 ARAP1Q96P48 1450 aa33.9■■■■□ 3.02
ACADM-211ENST00000528016 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.88■■■■□ 3.01
ACADM-211ENST00000528016 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
ACADM-211ENST00000528016 SOGA1O94964 1423 aa33.78■■■■□ 3
ACADM-211ENST00000528016 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
ACADM-211ENST00000528016 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.72■■■□□ 2.99
ACADM-211ENST00000528016 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.7■■■□□ 2.99
ACADM-211ENST00000528016 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.63■■■□□ 2.97
ACADM-211ENST00000528016 CUX1P39880 1505 aa33.63■■■□□ 2.97
ACADM-211ENST00000528016 WDR97A6NE52 1622 aa33.6■■■□□ 2.97
ACADM-211ENST00000528016 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
ACADM-211ENST00000528016 SYNJ1O43426 1573 aa33.55■■■□□ 2.96
ACADM-211ENST00000528016 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
ACADM-211ENST00000528016 GRIN2BQ13224 1484 aa33.51■■■□□ 2.96
ACADM-211ENST00000528016 SYNJ2O15056 1496 aa33.46■■■□□ 2.95
ACADM-211ENST00000528016 PBRM1Q86U86 1689 aa33.43■■■□□ 2.94
ACADM-211ENST00000528016 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.37■■■□□ 2.93
ACADM-211ENST00000528016 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.28■■■□□ 2.92
ACADM-211ENST00000528016 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.25■■■□□ 2.91
ACADM-211ENST00000528016 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.17■■■□□ 2.9
ACADM-211ENST00000528016 GRIN2AQ12879 1464 aa33.11■■■□□ 2.89
ACADM-211ENST00000528016 ADAMTS12P58397 1594 aa33.07■■■□□ 2.88
ACADM-211ENST00000528016 CEP170Q5SW79 1584 aa33.05■■■□□ 2.88
ACADM-211ENST00000528016 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
ACADM-211ENST00000528016 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
ACADM-211ENST00000528016 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.02■■■□□ 2.88
ACADM-211ENST00000528016 NUP160Q12769 1436 aa33■■■□□ 2.87
ACADM-211ENST00000528016 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.96■■■□□ 2.87
ACADM-211ENST00000528016 TOP2BQ02880 1626 aa32.94■■■□□ 2.86
ACADM-211ENST00000528016 SHROOM2Q13796 1616 aa32.92■■■□□ 2.86
ACADM-211ENST00000528016 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.9■■■□□ 2.86
ACADM-211ENST00000528016 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.82■■■□□ 2.84
ACADM-211ENST00000528016 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.76■■■□□ 2.83
ACADM-211ENST00000528016 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
ACADM-211ENST00000528016 JPH4Q96JJ6 628 aa32.65■■■□□ 2.82
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