RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527785.1

TMEM25-216, Transcript of transmembrane protein 25, humanhuman

TSL 3

Gene TMEM25, Length 841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25-216ENST00000527785 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.95■■■■■ 7.67
TMEM25-216ENST00000527785 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.32■■■■■ 6.61
TMEM25-216ENST00000527785 ABCC9O60706 1549 aa55.82■■■■■ 6.53
TMEM25-216ENST00000527785 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.43■■■■■ 6.14
TMEM25-216ENST00000527785 NACADO15069 1562 aa53.19■■■■■ 6.1
TMEM25-216ENST00000527785 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.95■■■■■ 6.07
TMEM25-216ENST00000527785 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.64■■■■■ 6.02
TMEM25-216ENST00000527785 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.32■■■■■ 5.97
TMEM25-216ENST00000527785 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.1■■■■■ 5.93
TMEM25-216ENST00000527785 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.04■■■■■ 5.92
TMEM25-216ENST00000527785 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.03■■■■■ 5.92
TMEM25-216ENST00000527785 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.9■■■■■ 5.9
TMEM25-216ENST00000527785 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.72■■■■■ 5.87
TMEM25-216ENST00000527785 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.29■■■■■ 5.8
TMEM25-216ENST00000527785 SCRIBQ14160 1630 aa51.26■■■■■ 5.8
TMEM25-216ENST00000527785 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.48■■■■■ 5.67
TMEM25-216ENST00000527785 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.46■■■■■ 5.67
TMEM25-216ENST00000527785 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.29■■■■■ 5.64
TMEM25-216ENST00000527785 NCAPD3P42695 1498 aa49.07■■■■■ 5.45
TMEM25-216ENST00000527785 SMARCA4P51532 1647 aa48.98■■■■■ 5.43
TMEM25-216ENST00000527785 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.94■■■■■ 5.43
TMEM25-216ENST00000527785 SMARCA2P51531 1590 aa48.9■■■■■ 5.42
TMEM25-216ENST00000527785 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.88■■■■■ 5.42
TMEM25-216ENST00000527785 HMGXB3Q12766 1538 aa48.75■■■■■ 5.39
TMEM25-216ENST00000527785 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.56■■■■■ 5.36
TMEM25-216ENST00000527785 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
TMEM25-216ENST00000527785 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.44■■■■■ 5.35
TMEM25-216ENST00000527785 ERCC6Q03468 1493 aa48.26■■■■■ 5.32
TMEM25-216ENST00000527785 CUX2O14529 1486 aa48.05■■■■■ 5.28
TMEM25-216ENST00000527785 NESP48681 1621 aa48.03■■■■■ 5.28
TMEM25-216ENST00000527785 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.91■■■■■ 5.26
TMEM25-216ENST00000527785 WIZO95785 1651 aa47.86■■■■■ 5.25
TMEM25-216ENST00000527785 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
TMEM25-216ENST00000527785 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.66■■■■■ 5.22
TMEM25-216ENST00000527785 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.61■■■■■ 5.21
TMEM25-216ENST00000527785 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.49■■■■■ 5.19
TMEM25-216ENST00000527785 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
TMEM25-216ENST00000527785 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.43■■■■■ 5.18
TMEM25-216ENST00000527785 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.18
TMEM25-216ENST00000527785 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.16■■■■■ 5.14
TMEM25-216ENST00000527785 CFTRP13569 1480 aa47.14■■■■■ 5.14
TMEM25-216ENST00000527785 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.08■■■■■ 5.13
TMEM25-216ENST00000527785 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.04■■■■■ 5.12
TMEM25-216ENST00000527785 WDR62O43379 1518 aa47■■■■■ 5.12
TMEM25-216ENST00000527785 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.82■■■■■ 5.09
TMEM25-216ENST00000527785 PRDM2Q13029 1718 aa46.65■■■■■ 5.06
TMEM25-216ENST00000527785 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
TMEM25-216ENST00000527785 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
TMEM25-216ENST00000527785 ABCC8Q09428 1581 aa46.25■■■■■ 4.99
TMEM25-216ENST00000527785 TOPBP1Q92547 1522 aa46.18■■■■■ 4.98
TMEM25-216ENST00000527785 IFT140Q96RY7 1462 aa46.14■■■■■ 4.98
TMEM25-216ENST00000527785 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.07■■■■■ 4.97
TMEM25-216ENST00000527785 OSCARQ8IYS5 282 aa45.95■■■■■ 4.95
TMEM25-216ENST00000527785 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
TMEM25-216ENST00000527785 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
TMEM25-216ENST00000527785 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
TMEM25-216ENST00000527785 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
TMEM25-216ENST00000527785 SOGA1O94964 1423 aa45.58■■■■■ 4.89
TMEM25-216ENST00000527785 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.57■■■■■ 4.89
TMEM25-216ENST00000527785 TRIM41Q8WV44 630 aa45.55■■■■■ 4.88
TMEM25-216ENST00000527785 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.5■■■■■ 4.87
TMEM25-216ENST00000527785 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.5■■■■■ 4.87
TMEM25-216ENST00000527785 CUX1P39880 1505 aa45.5■■■■■ 4.87
TMEM25-216ENST00000527785 WDR97A6NE52 1622 aa45.41■■■■■ 4.86
TMEM25-216ENST00000527785 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
TMEM25-216ENST00000527785 FBLN2P98095 1184 aa45.26■■■■■ 4.84
TMEM25-216ENST00000527785 CHD1O14646 1710 aa45.23■■■■■ 4.83
TMEM25-216ENST00000527785 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.17■■■■■ 4.82
TMEM25-216ENST00000527785 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.17■■■■■ 4.82
TMEM25-216ENST00000527785 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.17■■■■■ 4.82
TMEM25-216ENST00000527785 GRIN2BQ13224 1484 aa45.15■■■■■ 4.82
TMEM25-216ENST00000527785 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.14■■■■■ 4.82
TMEM25-216ENST00000527785 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.13■■■■■ 4.82
TMEM25-216ENST00000527785 ARHGEF11O15085 1522 aa45.11■■■■■ 4.81
TMEM25-216ENST00000527785 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
TMEM25-216ENST00000527785 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.06■■■■■ 4.8
TMEM25-216ENST00000527785 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
TMEM25-216ENST00000527785 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.03■■■■■ 4.8
TMEM25-216ENST00000527785 TOP2BQ02880 1626 aa45.01■■■■■ 4.8
TMEM25-216ENST00000527785 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.96■■■■■ 4.79
TMEM25-216ENST00000527785 SYNJ2O15056 1496 aa44.94■■■■■ 4.78
TMEM25-216ENST00000527785 SYNJ1O43426 1573 aa44.92■■■■■ 4.78
TMEM25-216ENST00000527785 PBRM1Q86U86 1689 aa44.9■■■■■ 4.78
TMEM25-216ENST00000527785 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.89■■■■■ 4.78
TMEM25-216ENST00000527785 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.78■■■■■ 4.76
TMEM25-216ENST00000527785 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.78■■■■■ 4.76
TMEM25-216ENST00000527785 ARAP1Q96P48 1450 aa44.66■■■■■ 4.74
TMEM25-216ENST00000527785 GRIN2AQ12879 1464 aa44.53■■■■■ 4.72
TMEM25-216ENST00000527785 ADAMTS12P58397 1594 aa44.52■■■■■ 4.72
TMEM25-216ENST00000527785 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.52■■■■■ 4.72
TMEM25-216ENST00000527785 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.5■■■■■ 4.71
TMEM25-216ENST00000527785 NUP160Q12769 1436 aa44.36■■■■■ 4.69
TMEM25-216ENST00000527785 CEP170Q5SW79 1584 aa44.29■■■■■ 4.68
TMEM25-216ENST00000527785 KIF27Q86VH2 1401 aa44.23■■■■■ 4.67
TMEM25-216ENST00000527785 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
TMEM25-216ENST00000527785 SHROOM2Q13796 1616 aa44.09■■■■■ 4.65
TMEM25-216ENST00000527785 IGF1RP08069 1367 aa44.05■■■■■ 4.64
TMEM25-216ENST00000527785 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.01■■■■■ 4.64
TMEM25-216ENST00000527785 CUL7Q14999 1698 aa43.95■■■■■ 4.63
TMEM25-216ENST00000527785 JPH4Q96JJ6 628 aa43.95■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms