RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527267.1

TMEM25-215, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 3

Gene TMEM25, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-215	ENST00000527267	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.84	■■■■□ 3.97
TMEM25-215	ENST00000527267	ABCC9	O60706	1549 aa		36	■■■■□ 3.35
TMEM25-215	ENST00000527267	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.73	■■■■□ 3.31
TMEM25-215	ENST00000527267	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.09	■■■■□ 3.05
TMEM25-215	ENST00000527267	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.02	■■■■□ 3.04
TMEM25-215	ENST00000527267	NACAD	O15069	1562 aa		33.82	■■■■□ 3
TMEM25-215	ENST00000527267	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.76	■■■□□ 2.99
TMEM25-215	ENST00000527267	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.55	■■■□□ 2.96
TMEM25-215	ENST00000527267	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TMEM25-215	ENST00000527267	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TMEM25-215	ENST00000527267	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TMEM25-215	ENST00000527267	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
TMEM25-215	ENST00000527267	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.82	■■■□□ 2.85
TMEM25-215	ENST00000527267	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TMEM25-215	ENST00000527267	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TMEM25-215	ENST00000527267	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TMEM25-215	ENST00000527267	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TMEM25-215	ENST00000527267	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TMEM25-215	ENST00000527267	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TMEM25-215	ENST00000527267	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.23	■■■□□ 2.59
TMEM25-215	ENST00000527267	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TMEM25-215	ENST00000527267	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.1	■■■□□ 2.57
TMEM25-215	ENST00000527267	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.02	■■■□□ 2.56
TMEM25-215	ENST00000527267	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.01	■■■□□ 2.56
TMEM25-215	ENST00000527267	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.98	■■■□□ 2.55
TMEM25-215	ENST00000527267	CUX2	O14529	1486 aa		30.98	■■■□□ 2.55
TMEM25-215	ENST00000527267	NES	P48681	1621 aa		30.93	■■■□□ 2.54
TMEM25-215	ENST00000527267	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.88	■■■□□ 2.53
TMEM25-215	ENST00000527267	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.83	■■■□□ 2.53
TMEM25-215	ENST00000527267	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.76	■■■□□ 2.52
TMEM25-215	ENST00000527267	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.75	■■■□□ 2.51
TMEM25-215	ENST00000527267	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.56	■■■□□ 2.48
TMEM25-215	ENST00000527267	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.54	■■■□□ 2.48
TMEM25-215	ENST00000527267	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.46	■■■□□ 2.47
TMEM25-215	ENST00000527267	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.38	■■■□□ 2.45
TMEM25-215	ENST00000527267	WIZ	O95785	1651 aa		30.37	■■■□□ 2.45
TMEM25-215	ENST00000527267	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.32	■■■□□ 2.44
TMEM25-215	ENST00000527267	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.16	■■■□□ 2.42
TMEM25-215	ENST00000527267	WDR62	O43379	1518 aa		30.08	■■■□□ 2.41
TMEM25-215	ENST00000527267	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.05	■■■□□ 2.4
TMEM25-215	ENST00000527267	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TMEM25-215	ENST00000527267	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TMEM25-215	ENST00000527267	CFTR	P13569	1480 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TMEM25-215	ENST00000527267	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
TMEM25-215	ENST00000527267	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.82	■■■□□ 2.36
TMEM25-215	ENST00000527267	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
TMEM25-215	ENST00000527267	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.63	■■■□□ 2.33
TMEM25-215	ENST00000527267	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.6	■■■□□ 2.33
TMEM25-215	ENST00000527267	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.59	■■■□□ 2.33
TMEM25-215	ENST00000527267	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.47	■■■□□ 2.31
TMEM25-215	ENST00000527267	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.42	■■■□□ 2.3
TMEM25-215	ENST00000527267	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TMEM25-215	ENST00000527267	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TMEM25-215	ENST00000527267	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.25	■■■□□ 2.27
TMEM25-215	ENST00000527267	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.25	■■■□□ 2.27
TMEM25-215	ENST00000527267	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.25	■■■□□ 2.27
TMEM25-215	ENST00000527267	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TMEM25-215	ENST00000527267	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
TMEM25-215	ENST00000527267	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.18	■■■□□ 2.26
TMEM25-215	ENST00000527267	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
TMEM25-215	ENST00000527267	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TMEM25-215	ENST00000527267	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TMEM25-215	ENST00000527267	CHD1	O14646	1710 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TMEM25-215	ENST00000527267	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TMEM25-215	ENST00000527267	FBLN2	P98095	1184 aa		29	■■■□□ 2.23
TMEM25-215	ENST00000527267	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
TMEM25-215	ENST00000527267	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TMEM25-215	ENST00000527267	SOGA1	O94964	1423 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TMEM25-215	ENST00000527267	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TMEM25-215	ENST00000527267	CUX1	P39880	1505 aa		28.89	■■■□□ 2.21
TMEM25-215	ENST00000527267	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TMEM25-215	ENST00000527267	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TMEM25-215	ENST00000527267	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TMEM25-215	ENST00000527267	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
TMEM25-215	ENST00000527267	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TMEM25-215	ENST00000527267	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TMEM25-215	ENST00000527267	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
TMEM25-215	ENST00000527267	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TMEM25-215	ENST00000527267	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
TMEM25-215	ENST00000527267	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TMEM25-215	ENST00000527267	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TMEM25-215	ENST00000527267	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TMEM25-215	ENST00000527267	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TMEM25-215	ENST00000527267	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TMEM25-215	ENST00000527267	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TMEM25-215	ENST00000527267	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.38	■■■□□ 2.13
TMEM25-215	ENST00000527267	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.34	■■■□□ 2.13
TMEM25-215	ENST00000527267	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.34	■■■□□ 2.13
TMEM25-215	ENST00000527267	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TMEM25-215	ENST00000527267	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TMEM25-215	ENST00000527267	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.31	■■■□□ 2.12
TMEM25-215	ENST00000527267	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TMEM25-215	ENST00000527267	NUP160	Q12769	1436 aa		28.26	■■■□□ 2.12
TMEM25-215	ENST00000527267	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TMEM25-215	ENST00000527267	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TMEM25-215	ENST00000527267	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TMEM25-215	ENST00000527267	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
TMEM25-215	ENST00000527267	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TMEM25-215	ENST00000527267	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TMEM25-215	ENST00000527267	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05

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