RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527196.5

ROBO3-207, Transcript of roundabout guidance receptor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ROBO3, Length 1,942 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3-207ENST00000527196 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.8■■■■■ 6.52
ROBO3-207ENST00000527196 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.48■■■■■ 5.35
ROBO3-207ENST00000527196 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
ROBO3-207ENST00000527196 ABCC9O60706 1549 aa46.39■■■■■ 5.02
ROBO3-207ENST00000527196 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.21■■■■■ 4.99
ROBO3-207ENST00000527196 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.01■■■■■ 4.96
ROBO3-207ENST00000527196 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.69■■■■■ 4.9
ROBO3-207ENST00000527196 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.47■■■■■ 4.87
ROBO3-207ENST00000527196 NACADO15069 1562 aa45.19■■■■■ 4.82
ROBO3-207ENST00000527196 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.94■■■■■ 4.79
ROBO3-207ENST00000527196 SCRIBQ14160 1630 aa44.55■■■■■ 4.72
ROBO3-207ENST00000527196 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
ROBO3-207ENST00000527196 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.05■■■■■ 4.64
ROBO3-207ENST00000527196 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.72■■■■■ 4.59
ROBO3-207ENST00000527196 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.69■■■■■ 4.58
ROBO3-207ENST00000527196 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
ROBO3-207ENST00000527196 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.29■■■■■ 4.52
ROBO3-207ENST00000527196 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.12■■■■■ 4.49
ROBO3-207ENST00000527196 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
ROBO3-207ENST00000527196 WIZO95785 1651 aa42.82■■■■■ 4.45
ROBO3-207ENST00000527196 SMARCA4P51532 1647 aa42.8■■■■■ 4.44
ROBO3-207ENST00000527196 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.71■■■■■ 4.43
ROBO3-207ENST00000527196 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
ROBO3-207ENST00000527196 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
ROBO3-207ENST00000527196 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.32■■■■■ 4.37
ROBO3-207ENST00000527196 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.08■■■■■ 4.33
ROBO3-207ENST00000527196 SMARCA2P51531 1590 aa42.01■■■■■ 4.32
ROBO3-207ENST00000527196 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.93■■■■■ 4.3
ROBO3-207ENST00000527196 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.9■■■■■ 4.3
ROBO3-207ENST00000527196 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
ROBO3-207ENST00000527196 NCAPD3P42695 1498 aa41.77■■■■■ 4.28
ROBO3-207ENST00000527196 HMGXB3Q12766 1538 aa41.62■■■■■ 4.25
ROBO3-207ENST00000527196 TRIM41Q8WV44 630 aa41.55■■■■■ 4.24
ROBO3-207ENST00000527196 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.5■■■■■ 4.23
ROBO3-207ENST00000527196 ABCC8Q09428 1581 aa41.2■■■■■ 4.19
ROBO3-207ENST00000527196 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.05■■■■■ 4.16
ROBO3-207ENST00000527196 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
ROBO3-207ENST00000527196 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
ROBO3-207ENST00000527196 SYNJ1O43426 1573 aa40.73■■■■■ 4.11
ROBO3-207ENST00000527196 CFTRP13569 1480 aa40.72■■■■■ 4.11
ROBO3-207ENST00000527196 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.69■■■■■ 4.11
ROBO3-207ENST00000527196 PRDM2Q13029 1718 aa40.68■■■■■ 4.1
ROBO3-207ENST00000527196 NESP48681 1621 aa40.6■■■■■ 4.09
ROBO3-207ENST00000527196 EEA1Q15075 1411 aa40.56■■■■■ 4.08
ROBO3-207ENST00000527196 TOP2BQ02880 1626 aa40.55■■■■■ 4.08
ROBO3-207ENST00000527196 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.53■■■■■ 4.08
ROBO3-207ENST00000527196 SOGA1O94964 1423 aa40.51■■■■■ 4.08
ROBO3-207ENST00000527196 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.39■■■■■ 4.06
ROBO3-207ENST00000527196 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.36■■■■■ 4.05
ROBO3-207ENST00000527196 CUX1P39880 1505 aa40.29■■■■■ 4.04
ROBO3-207ENST00000527196 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.25■■■■■ 4.03
ROBO3-207ENST00000527196 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.24■■■■■ 4.03
ROBO3-207ENST00000527196 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.13■■■■■ 4.01
ROBO3-207ENST00000527196 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.08■■■■■ 4.01
ROBO3-207ENST00000527196 KIF21BO75037 1637 aa40.08■■■■■ 4.01
ROBO3-207ENST00000527196 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.02■■■■■ 4
ROBO3-207ENST00000527196 GOLGA3Q08378 1498 aa40■■■■□ 3.99
ROBO3-207ENST00000527196 TNIKQ9UKE5 1360 aa40■■■■□ 3.99
ROBO3-207ENST00000527196 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40■■■■□ 3.99
ROBO3-207ENST00000527196 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
ROBO3-207ENST00000527196 CEP162Q5TB80 1403 aa39.79■■■■□ 3.96
ROBO3-207ENST00000527196 ERCC6Q03468 1493 aa39.77■■■■□ 3.96
ROBO3-207ENST00000527196 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.76■■■■□ 3.96
ROBO3-207ENST00000527196 KIF27Q86VH2 1401 aa39.75■■■■□ 3.95
ROBO3-207ENST00000527196 TOPBP1Q92547 1522 aa39.75■■■■□ 3.95
ROBO3-207ENST00000527196 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.72■■■■□ 3.95
ROBO3-207ENST00000527196 PRXQ9BXM0 1461 aa39.7■■■■□ 3.95
ROBO3-207ENST00000527196 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.7■■■■□ 3.95
ROBO3-207ENST00000527196 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.68■■■■□ 3.94
ROBO3-207ENST00000527196 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
ROBO3-207ENST00000527196 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.66■■■■□ 3.94
ROBO3-207ENST00000527196 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.65■■■■□ 3.94
ROBO3-207ENST00000527196 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
ROBO3-207ENST00000527196 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
ROBO3-207ENST00000527196 CUX2O14529 1486 aa39.52■■■■□ 3.92
ROBO3-207ENST00000527196 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
ROBO3-207ENST00000527196 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.46■■■■□ 3.91
ROBO3-207ENST00000527196 WDR62O43379 1518 aa39.45■■■■□ 3.91
ROBO3-207ENST00000527196 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.43■■■■□ 3.9
ROBO3-207ENST00000527196 IGF1RP08069 1367 aa39.39■■■■□ 3.9
ROBO3-207ENST00000527196 CLIP1P30622 1438 aa39.36■■■■□ 3.89
ROBO3-207ENST00000527196 WDR97A6NE52 1622 aa39.35■■■■□ 3.89
ROBO3-207ENST00000527196 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
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ROBO3-207ENST00000527196 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.86
ROBO3-207ENST00000527196 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.12■■■■□ 3.85
ROBO3-207ENST00000527196 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.11■■■■□ 3.85
ROBO3-207ENST00000527196 CUL7Q14999 1698 aa39.09■■■■□ 3.85
ROBO3-207ENST00000527196 IFT140Q96RY7 1462 aa39.07■■■■□ 3.84
ROBO3-207ENST00000527196 HRCP23327 699 aa39.02■■■■□ 3.84
ROBO3-207ENST00000527196 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
ROBO3-207ENST00000527196 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
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ROBO3-207ENST00000527196 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.97■■■■□ 3.83
ROBO3-207ENST00000527196 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.94■■■■□ 3.82
ROBO3-207ENST00000527196 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.87■■■■□ 3.81
ROBO3-207ENST00000527196 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
ROBO3-207ENST00000527196 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.77■■■■□ 3.8
ROBO3-207ENST00000527196 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
ROBO3-207ENST00000527196 PBRM1Q86U86 1689 aa38.75■■■■□ 3.79
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