RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527193.1

PPP5C-212, Transcript of protein phosphatase 5 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP5C, Length 548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5C-212ENST00000527193 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.82■■■■■ 7.01
PPP5C-212ENST00000527193 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.73■■■■■ 6.03
PPP5C-212ENST00000527193 ABCC9O60706 1549 aa52.57■■■■■ 6.01
PPP5C-212ENST00000527193 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.11■■■■■ 5.61
PPP5C-212ENST00000527193 NACADO15069 1562 aa49.79■■■■■ 5.56
PPP5C-212ENST00000527193 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.64■■■■■ 5.54
PPP5C-212ENST00000527193 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.15■■■■■ 5.46
PPP5C-212ENST00000527193 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.14■■■■■ 5.46
PPP5C-212ENST00000527193 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.03■■■■■ 5.44
PPP5C-212ENST00000527193 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.98■■■■■ 5.43
PPP5C-212ENST00000527193 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
PPP5C-212ENST00000527193 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.63■■■■■ 5.38
PPP5C-212ENST00000527193 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.58■■■■■ 5.37
PPP5C-212ENST00000527193 SCRIBQ14160 1630 aa48.08■■■■■ 5.29
PPP5C-212ENST00000527193 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.97■■■■■ 5.27
PPP5C-212ENST00000527193 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.5■■■■■ 5.19
PPP5C-212ENST00000527193 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
PPP5C-212ENST00000527193 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.33■■■■■ 5.17
PPP5C-212ENST00000527193 NCAPD3P42695 1498 aa45.95■■■■■ 4.95
PPP5C-212ENST00000527193 SMARCA4P51532 1647 aa45.87■■■■■ 4.93
PPP5C-212ENST00000527193 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.85■■■■■ 4.93
PPP5C-212ENST00000527193 SMARCA2P51531 1590 aa45.75■■■■■ 4.91
PPP5C-212ENST00000527193 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
PPP5C-212ENST00000527193 HMGXB3Q12766 1538 aa45.64■■■■■ 4.9
PPP5C-212ENST00000527193 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
PPP5C-212ENST00000527193 ERCC6Q03468 1493 aa45.4■■■■■ 4.86
PPP5C-212ENST00000527193 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.39■■■■■ 4.86
PPP5C-212ENST00000527193 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.33■■■■■ 4.85
PPP5C-212ENST00000527193 CUX2O14529 1486 aa45.22■■■■■ 4.83
PPP5C-212ENST00000527193 NESP48681 1621 aa45.21■■■■■ 4.83
PPP5C-212ENST00000527193 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.01■■■■■ 4.8
PPP5C-212ENST00000527193 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.91■■■■■ 4.78
PPP5C-212ENST00000527193 WIZO95785 1651 aa44.83■■■■■ 4.77
PPP5C-212ENST00000527193 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
PPP5C-212ENST00000527193 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.67■■■■■ 4.74
PPP5C-212ENST00000527193 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.65■■■■■ 4.74
PPP5C-212ENST00000527193 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.57■■■■■ 4.73
PPP5C-212ENST00000527193 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
PPP5C-212ENST00000527193 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.26■■■■■ 4.68
PPP5C-212ENST00000527193 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
PPP5C-212ENST00000527193 WDR62O43379 1518 aa44.13■■■■■ 4.65
PPP5C-212ENST00000527193 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.12■■■■■ 4.65
PPP5C-212ENST00000527193 CFTRP13569 1480 aa44.09■■■■■ 4.65
PPP5C-212ENST00000527193 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.08■■■■■ 4.65
PPP5C-212ENST00000527193 PRDM2Q13029 1718 aa43.75■■■■■ 4.59
PPP5C-212ENST00000527193 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.75■■■■■ 4.59
PPP5C-212ENST00000527193 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
PPP5C-212ENST00000527193 TOPBP1Q92547 1522 aa43.27■■■■■ 4.52
PPP5C-212ENST00000527193 IFT140Q96RY7 1462 aa43.22■■■■■ 4.51
PPP5C-212ENST00000527193 OSCARQ8IYS5 282 aa43.21■■■■■ 4.51
PPP5C-212ENST00000527193 ABCC8Q09428 1581 aa43.18■■■■■ 4.5
PPP5C-212ENST00000527193 TRIM41Q8WV44 630 aa43.16■■■■■ 4.5
PPP5C-212ENST00000527193 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
PPP5C-212ENST00000527193 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.13■■■■■ 4.5
PPP5C-212ENST00000527193 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
PPP5C-212ENST00000527193 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
PPP5C-212ENST00000527193 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
PPP5C-212ENST00000527193 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.78■■■■■ 4.443e-7■■■■■ 27.8
PPP5C-212ENST00000527193 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.68■■■■■ 4.42
PPP5C-212ENST00000527193 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
PPP5C-212ENST00000527193 SOGA1O94964 1423 aa42.65■■■■■ 4.42
PPP5C-212ENST00000527193 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.64■■■■■ 4.42
PPP5C-212ENST00000527193 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.64■■■■■ 4.42
PPP5C-212ENST00000527193 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.64■■■■■ 4.42
PPP5C-212ENST00000527193 CHD1O14646 1710 aa42.61■■■■■ 4.41
PPP5C-212ENST00000527193 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.6■■■■■ 4.41
PPP5C-212ENST00000527193 CUX1P39880 1505 aa42.59■■■■■ 4.41
PPP5C-212ENST00000527193 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
PPP5C-212ENST00000527193 FBLN2P98095 1184 aa42.51■■■■■ 4.4
PPP5C-212ENST00000527193 ARHGEF11O15085 1522 aa42.5■■■■■ 4.39
PPP5C-212ENST00000527193 WDR97A6NE52 1622 aa42.44■■■■■ 4.38
PPP5C-212ENST00000527193 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.35■■■■■ 4.37
PPP5C-212ENST00000527193 GRIN2BQ13224 1484 aa42.25■■■■■ 4.35
PPP5C-212ENST00000527193 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
PPP5C-212ENST00000527193 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
PPP5C-212ENST00000527193 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.2■■■■■ 4.35
PPP5C-212ENST00000527193 PBRM1Q86U86 1689 aa42.15■■■■■ 4.34
PPP5C-212ENST00000527193 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.14■■■■■ 4.34
PPP5C-212ENST00000527193 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.11■■■■■ 4.33
PPP5C-212ENST00000527193 SYNJ2O15056 1496 aa42.11■■■■■ 4.33
PPP5C-212ENST00000527193 ARAP1Q96P48 1450 aa42.09■■■■■ 4.33
PPP5C-212ENST00000527193 SYNJ1O43426 1573 aa42.09■■■■■ 4.33
PPP5C-212ENST00000527193 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.07■■■■■ 4.33
PPP5C-212ENST00000527193 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.05■■■■■ 4.32
PPP5C-212ENST00000527193 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.99■■■■■ 4.31
PPP5C-212ENST00000527193 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.96■■■■■ 4.31
PPP5C-212ENST00000527193 TOP2BQ02880 1626 aa41.95■■■■■ 4.31
PPP5C-212ENST00000527193 ADAMTS12P58397 1594 aa41.71■■■■■ 4.27
PPP5C-212ENST00000527193 GRIN2AQ12879 1464 aa41.71■■■■■ 4.27
PPP5C-212ENST00000527193 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
PPP5C-212ENST00000527193 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.61■■■■■ 4.25
PPP5C-212ENST00000527193 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.59■■■■■ 4.25
PPP5C-212ENST00000527193 CEP170Q5SW79 1584 aa41.56■■■■■ 4.24
PPP5C-212ENST00000527193 NUP160Q12769 1436 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP5C-212ENST00000527193 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.45■■■■■ 4.23
PPP5C-212ENST00000527193 SHROOM2Q13796 1616 aa41.36■■■■■ 4.21
PPP5C-212ENST00000527193 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
PPP5C-212ENST00000527193 JPH4Q96JJ6 628 aa41.15■■■■■ 4.18
PPP5C-212ENST00000527193 KIF27Q86VH2 1401 aa41.14■■■■■ 4.18
PPP5C-212ENST00000527193 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.13■■■■■ 4.17
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