RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527127.5

SLC25A22-208, Transcript of solute carrier family 25 member 22, human

TSL 3

Gene SLC25A22, Length 586 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC25A22-208	ENST00000527127	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.82	■■■■■ 7.17
SLC25A22-208	ENST00000527127	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		53.3	■■■■■ 6.12
SLC25A22-208	ENST00000527127	ABCC9	O60706	1549 aa		52.51	■■■■■ 6
SLC25A22-208	ENST00000527127	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50.28	■■■■■ 5.64
SLC25A22-208	ENST00000527127	NACAD	O15069	1562 aa		50.13	■■■■■ 5.61
SLC25A22-208	ENST00000527127	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		50.11	■■■■■ 5.61
SLC25A22-208	ENST00000527127	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.77	■■■■■ 5.56
SLC25A22-208	ENST00000527127	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.67	■■■■■ 5.54
SLC25A22-208	ENST00000527127	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.39	■■■■■ 5.5
SLC25A22-208	ENST00000527127	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.34	■■■■■ 5.49
SLC25A22-208	ENST00000527127	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.02	■■■■■ 5.44
SLC25A22-208	ENST00000527127	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.9	■■■■■ 5.42
SLC25A22-208	ENST00000527127	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.72	■■■■■ 5.39
SLC25A22-208	ENST00000527127	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.51	■■■■■ 5.36
SLC25A22-208	ENST00000527127	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.11	■■■■■ 5.29
SLC25A22-208	ENST00000527127	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.57	■■■■■ 5.21
SLC25A22-208	ENST00000527127	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		47.48	■■■■■ 5.19
SLC25A22-208	ENST00000527127	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.15	■■■■■ 5.14
SLC25A22-208	ENST00000527127	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.52	■■■■■ 5.04
SLC25A22-208	ENST00000527127	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	46.35	■■■■■ 5.01
SLC25A22-208	ENST00000527127	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		46.3	■■■■■ 5
SLC25A22-208	ENST00000527127	NCAPD3	P42695	1498 aa		46.25	■■■■■ 5
SLC25A22-208	ENST00000527127	SMARCA2	P51531	1590 aa		46.18	■■■■■ 4.98
SLC25A22-208	ENST00000527127	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		46.18	■■■■■ 4.98
SLC25A22-208	ENST00000527127	HMGXB3	Q12766	1538 aa		46.03	■■■■■ 4.96
SLC25A22-208	ENST00000527127	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		46	■■■■■ 4.95
SLC25A22-208	ENST00000527127	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.88	■■■■■ 4.94
SLC25A22-208	ENST00000527127	WIZ	O95785	1651 aa		45.7	■■■■■ 4.91
SLC25A22-208	ENST00000527127	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.48	■■■■■ 4.87
SLC25A22-208	ENST00000527127	NES	P48681	1621 aa		45.41	■■■■■ 4.86
SLC25A22-208	ENST00000527127	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.19	■■■■■ 4.82
SLC25A22-208	ENST00000527127	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.1	■■■■■ 4.81
SLC25A22-208	ENST00000527127	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	45.1	■■■■■ 4.81
SLC25A22-208	ENST00000527127	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.9	■■■■■ 4.78
SLC25A22-208	ENST00000527127	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.87	■■■■■ 4.77
SLC25A22-208	ENST00000527127	CUX2	O14529	1486 aa		44.77	■■■■■ 4.76
SLC25A22-208	ENST00000527127	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.75	■■■■■ 4.76
SLC25A22-208	ENST00000527127	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.74	■■■■■ 4.75
SLC25A22-208	ENST00000527127	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.59	■■■■■ 4.73
SLC25A22-208	ENST00000527127	CFTR	P13569	1480 aa		44.59	■■■■■ 4.73
SLC25A22-208	ENST00000527127	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.43	■■■■■ 4.7
SLC25A22-208	ENST00000527127	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.39	■■■■■ 4.7
SLC25A22-208	ENST00000527127	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.39	■■■■■ 4.7
SLC25A22-208	ENST00000527127	PRDM2	Q13029	1718 aa		44.32	■■■■■ 4.69
SLC25A22-208	ENST00000527127	WDR62	O43379	1518 aa		44.27	■■■■■ 4.68
SLC25A22-208	ENST00000527127	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.15	■■■■■ 4.66
SLC25A22-208	ENST00000527127	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	44.07	■■■■■ 4.65
SLC25A22-208	ENST00000527127	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.76	■■■■■ 4.6
SLC25A22-208	ENST00000527127	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.72	■■■■■ 4.59
SLC25A22-208	ENST00000527127	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.63	■■■■■ 4.57
SLC25A22-208	ENST00000527127	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.54	■■■■■ 4.56
SLC25A22-208	ENST00000527127	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.45	■■■■■ 4.55
SLC25A22-208	ENST00000527127	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.4	■■■■■ 4.54
SLC25A22-208	ENST00000527127	CUX1	P39880	1505 aa		43.32	■■■■■ 4.53
SLC25A22-208	ENST00000527127	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.32	■■■■■ 4.53
SLC25A22-208	ENST00000527127	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.3	■■■■■ 4.52
SLC25A22-208	ENST00000527127	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.2	■■■■■ 4.51
SLC25A22-208	ENST00000527127	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		43.19	■■■■■ 4.51
SLC25A22-208	ENST00000527127	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		43.19	■■■■■ 4.51
SLC25A22-208	ENST00000527127	SOGA1	O94964	1423 aa		43.1	■■■■■ 4.49
SLC25A22-208	ENST00000527127	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43.08	■■■■■ 4.49	1e-7	■■■■□ 21.1
SLC25A22-208	ENST00000527127	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
SLC25A22-208	ENST00000527127	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SLC25A22-208	ENST00000527127	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.89	■■■■■ 4.46
SLC25A22-208	ENST00000527127	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.86	■■■■■ 4.45
SLC25A22-208	ENST00000527127	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SLC25A22-208	ENST00000527127	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SLC25A22-208	ENST00000527127	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.82	■■■■■ 4.45
SLC25A22-208	ENST00000527127	CHD1	O14646	1710 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SLC25A22-208	ENST00000527127	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.71	■■■■■ 4.43
SLC25A22-208	ENST00000527127	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.67	■■■■■ 4.42
SLC25A22-208	ENST00000527127	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.63	■■■■■ 4.42
SLC25A22-208	ENST00000527127	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.63	■■■■■ 4.41
SLC25A22-208	ENST00000527127	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.62	■■■■■ 4.41
SLC25A22-208	ENST00000527127	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SLC25A22-208	ENST00000527127	FBLN2	P98095	1184 aa		42.58	■■■■■ 4.41
SLC25A22-208	ENST00000527127	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
SLC25A22-208	ENST00000527127	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.37	■■■■■ 4.37
SLC25A22-208	ENST00000527127	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.35	■■■■■ 4.37
SLC25A22-208	ENST00000527127	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.35	■■■■■ 4.37
SLC25A22-208	ENST00000527127	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.35	■■■■■ 4.37
SLC25A22-208	ENST00000527127	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
SLC25A22-208	ENST00000527127	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.29	■■■■■ 4.36
SLC25A22-208	ENST00000527127	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SLC25A22-208	ENST00000527127	ADAMTS12	P58397	1594 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SLC25A22-208	ENST00000527127	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.22	■■■■■ 4.35
SLC25A22-208	ENST00000527127	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		42.16	■■■■■ 4.34
SLC25A22-208	ENST00000527127	GRIN2A	Q12879	1464 aa		42.11	■■■■■ 4.33
SLC25A22-208	ENST00000527127	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		42.07	■■■■■ 4.33
SLC25A22-208	ENST00000527127	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.98	■■■■■ 4.31
SLC25A22-208	ENST00000527127	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.94	■■■■■ 4.3
SLC25A22-208	ENST00000527127	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.94	■■■■■ 4.3
SLC25A22-208	ENST00000527127	NUP160	Q12769	1436 aa		41.91	■■■■■ 4.3
SLC25A22-208	ENST00000527127	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SLC25A22-208	ENST00000527127	IGF1R	P08069	1367 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SLC25A22-208	ENST00000527127	CUL7	Q14999	1698 aa		41.76	■■■■■ 4.28
SLC25A22-208	ENST00000527127	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.72	■■■■■ 4.27
SLC25A22-208	ENST00000527127	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.68	■■■■■ 4.26
SLC25A22-208	ENST00000527127	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.67	■■■■■ 4.26
SLC25A22-208	ENST00000527127	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.58	■■■■■ 4.25

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