RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526946.5

ATRNL1-206, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 3

Gene ATRNL1, Length 932 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-206ENST00000526946 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.36■■■■■ 6.61
ATRNL1-206ENST00000526946 ABCC9O60706 1549 aa51.38■■■■■ 5.82
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ATRNL1-206ENST00000526946 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.67■■■■■ 5.38
ATRNL1-206ENST00000526946 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.58■■■■■ 5.37
ATRNL1-206ENST00000526946 NACADO15069 1562 aa48.11■■■■■ 5.29
ATRNL1-206ENST00000526946 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.05■■■■■ 5.28
ATRNL1-206ENST00000526946 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.84■■■■■ 5.25
ATRNL1-206ENST00000526946 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.36■■■■■ 5.17
ATRNL1-206ENST00000526946 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.23■■■■■ 5.15
ATRNL1-206ENST00000526946 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.16■■■■■ 5.14
ATRNL1-206ENST00000526946 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
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ATRNL1-206ENST00000526946 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.44■■■■■ 5.02
ATRNL1-206ENST00000526946 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.31■■■■■ 5
ATRNL1-206ENST00000526946 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.3■■■■■ 5
ATRNL1-206ENST00000526946 SCRIBQ14160 1630 aa46.28■■■■■ 5
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ATRNL1-206ENST00000526946 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.06■■■■■ 4.8
ATRNL1-206ENST00000526946 NCAPD3P42695 1498 aa44.47■■■■■ 4.71
ATRNL1-206ENST00000526946 ERCC6Q03468 1493 aa44.42■■■■■ 4.7
ATRNL1-206ENST00000526946 CUX2O14529 1486 aa44.41■■■■■ 4.7
ATRNL1-206ENST00000526946 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.27■■■■■ 4.68
ATRNL1-206ENST00000526946 SMARCA2P51531 1590 aa44.09■■■■■ 4.65
ATRNL1-206ENST00000526946 SMARCA4P51532 1647 aa44.04■■■■■ 4.64
ATRNL1-206ENST00000526946 HMGXB3Q12766 1538 aa44.03■■■■■ 4.64
ATRNL1-206ENST00000526946 NESP48681 1621 aa43.98■■■■■ 4.63
ATRNL1-206ENST00000526946 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
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ATRNL1-206ENST00000526946 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
ATRNL1-206ENST00000526946 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.5■■■■■ 4.55
ATRNL1-206ENST00000526946 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.45■■■■■ 4.55
ATRNL1-206ENST00000526946 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.36■■■■■ 4.53
ATRNL1-206ENST00000526946 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.27■■■■■ 4.52
ATRNL1-206ENST00000526946 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.14■■■■■ 4.5
ATRNL1-206ENST00000526946 TRIM41Q8WV44 630 aa42.99■■■■■ 4.47
ATRNL1-206ENST00000526946 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.99■■■■■ 4.47
ATRNL1-206ENST00000526946 WIZO95785 1651 aa42.88■■■■■ 4.45
ATRNL1-206ENST00000526946 WDR62O43379 1518 aa42.84■■■■■ 4.45
ATRNL1-206ENST00000526946 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.73■■■■■ 4.43
ATRNL1-206ENST00000526946 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.64■■■■■ 4.42
ATRNL1-206ENST00000526946 CFTRP13569 1480 aa42.49■■■■■ 4.39
ATRNL1-206ENST00000526946 OSCARQ8IYS5 282 aa42.43■■■■■ 4.38
ATRNL1-206ENST00000526946 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
ATRNL1-206ENST00000526946 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
ATRNL1-206ENST00000526946 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
ATRNL1-206ENST00000526946 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
ATRNL1-206ENST00000526946 IFT140Q96RY7 1462 aa41.88■■■■■ 4.29
ATRNL1-206ENST00000526946 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.87■■■■■ 4.29
ATRNL1-206ENST00000526946 PRDM2Q13029 1718 aa41.85■■■■■ 4.29
ATRNL1-206ENST00000526946 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
ATRNL1-206ENST00000526946 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
ATRNL1-206ENST00000526946 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
ATRNL1-206ENST00000526946 TOPBP1Q92547 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
ATRNL1-206ENST00000526946 ARHGEF11O15085 1522 aa41.65■■■■■ 4.26
ATRNL1-206ENST00000526946 ABCC8Q09428 1581 aa41.61■■■■■ 4.25
ATRNL1-206ENST00000526946 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
ATRNL1-206ENST00000526946 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.52■■■■■ 4.24
ATRNL1-206ENST00000526946 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.51■■■■■ 4.24
ATRNL1-206ENST00000526946 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.23
ATRNL1-206ENST00000526946 FBLN2P98095 1184 aa41.42■■■■■ 4.22
ATRNL1-206ENST00000526946 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
ATRNL1-206ENST00000526946 CHD1O14646 1710 aa41.32■■■■■ 4.2
ATRNL1-206ENST00000526946 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
ATRNL1-206ENST00000526946 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
ATRNL1-206ENST00000526946 ARAP1Q96P48 1450 aa41.21■■■■■ 4.19
ATRNL1-206ENST00000526946 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.2■■■■■ 4.19
ATRNL1-206ENST00000526946 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
ATRNL1-206ENST00000526946 SOGA1O94964 1423 aa41.16■■■■■ 4.18
ATRNL1-206ENST00000526946 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.01■■■■■ 4.16
ATRNL1-206ENST00000526946 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.98■■■■■ 4.15
ATRNL1-206ENST00000526946 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
ATRNL1-206ENST00000526946 CUX1P39880 1505 aa40.85■■■■■ 4.13
ATRNL1-206ENST00000526946 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.85■■■■■ 4.13
ATRNL1-206ENST00000526946 WDR97A6NE52 1622 aa40.85■■■■■ 4.13
ATRNL1-206ENST00000526946 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
ATRNL1-206ENST00000526946 GRIN2BQ13224 1484 aa40.82■■■■■ 4.12
ATRNL1-206ENST00000526946 SYNJ1O43426 1573 aa40.82■■■■■ 4.12
ATRNL1-206ENST00000526946 SYNJ2O15056 1496 aa40.74■■■■■ 4.11
ATRNL1-206ENST00000526946 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.62■■■■■ 4.09
ATRNL1-206ENST00000526946 PBRM1Q86U86 1689 aa40.51■■■■■ 4.08
ATRNL1-206ENST00000526946 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.45■■■■■ 4.07
ATRNL1-206ENST00000526946 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
ATRNL1-206ENST00000526946 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.38■■■■■ 4.06
ATRNL1-206ENST00000526946 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
ATRNL1-206ENST00000526946 GRIN2AQ12879 1464 aa40.28■■■■■ 4.04
ATRNL1-206ENST00000526946 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.04
ATRNL1-206ENST00000526946 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.23■■■■■ 4.03
ATRNL1-206ENST00000526946 NUP160Q12769 1436 aa40.15■■■■■ 4.02
ATRNL1-206ENST00000526946 ADAMTS12P58397 1594 aa40.14■■■■■ 4.02
ATRNL1-206ENST00000526946 CEP170Q5SW79 1584 aa40.13■■■■■ 4.01
ATRNL1-206ENST00000526946 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.08■■■■■ 4.01
ATRNL1-206ENST00000526946 TOP2BQ02880 1626 aa40.01■■■■■ 4
ATRNL1-206ENST00000526946 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.97■■■■□ 3.99
ATRNL1-206ENST00000526946 SHROOM2Q13796 1616 aa39.95■■■■□ 3.99
ATRNL1-206ENST00000526946 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.92■■■■□ 3.98
ATRNL1-206ENST00000526946 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
ATRNL1-206ENST00000526946 JPH4Q96JJ6 628 aa39.84■■■■□ 3.97
ATRNL1-206ENST00000526946 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.67■■■■□ 3.94
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