RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526281.1

SYT12-204, Transcript of synaptotagmin 12, humanhuman

TSL 4

Gene SYT12, Length 527 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12-204ENST00000526281 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.4■■■■■ 5.66
SYT12-204ENST00000526281 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.09■■■■■ 4.81
SYT12-204ENST00000526281 ABCC9O60706 1549 aa44.67■■■■■ 4.74
SYT12-204ENST00000526281 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.72■■■■■ 4.43
SYT12-204ENST00000526281 NACADO15069 1562 aa42.52■■■■■ 4.4
SYT12-204ENST00000526281 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.37■■■■■ 4.37
SYT12-204ENST00000526281 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.06■■■■■ 4.32
SYT12-204ENST00000526281 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
SYT12-204ENST00000526281 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.78■■■■■ 4.28
SYT12-204ENST00000526281 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.66■■■■■ 4.26
SYT12-204ENST00000526281 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
SYT12-204ENST00000526281 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.53■■■■■ 4.24
SYT12-204ENST00000526281 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.45■■■■■ 4.23
SYT12-204ENST00000526281 SCRIBQ14160 1630 aa41.09■■■■■ 4.17
SYT12-204ENST00000526281 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.94■■■■■ 4.14
SYT12-204ENST00000526281 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
SYT12-204ENST00000526281 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.39■■■■■ 4.06
SYT12-204ENST00000526281 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.2■■■■■ 4.03
SYT12-204ENST00000526281 SMARCA4P51532 1647 aa39.25■■■■□ 3.87
SYT12-204ENST00000526281 NCAPD3P42695 1498 aa39.24■■■■□ 3.87
SYT12-204ENST00000526281 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.17■■■■□ 3.86
SYT12-204ENST00000526281 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
SYT12-204ENST00000526281 SMARCA2P51531 1590 aa39.1■■■■□ 3.85
SYT12-204ENST00000526281 HMGXB3Q12766 1538 aa38.99■■■■□ 3.83
SYT12-204ENST00000526281 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.86■■■■□ 3.81
SYT12-204ENST00000526281 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.83■■■■□ 3.81
SYT12-204ENST00000526281 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.81
SYT12-204ENST00000526281 ERCC6Q03468 1493 aa38.55■■■■□ 3.76
SYT12-204ENST00000526281 NESP48681 1621 aa38.49■■■■□ 3.75
SYT12-204ENST00000526281 WIZO95785 1651 aa38.4■■■■□ 3.74
SYT12-204ENST00000526281 CUX2O14529 1486 aa38.35■■■■□ 3.73
SYT12-204ENST00000526281 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.31■■■■□ 3.72
SYT12-204ENST00000526281 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
SYT12-204ENST00000526281 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.06■■■■□ 3.68
SYT12-204ENST00000526281 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.06■■■■□ 3.68
SYT12-204ENST00000526281 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.04■■■■□ 3.68
SYT12-204ENST00000526281 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
SYT12-204ENST00000526281 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
SYT12-204ENST00000526281 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.87■■■■□ 3.65
SYT12-204ENST00000526281 CFTRP13569 1480 aa37.71■■■■□ 3.63
SYT12-204ENST00000526281 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.71■■■■□ 3.63
SYT12-204ENST00000526281 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.64■■■■□ 3.62
SYT12-204ENST00000526281 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.63■■■■□ 3.61
SYT12-204ENST00000526281 WDR62O43379 1518 aa37.61■■■■□ 3.61
SYT12-204ENST00000526281 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.51■■■■□ 3.59
SYT12-204ENST00000526281 PRDM2Q13029 1718 aa37.42■■■■□ 3.58
SYT12-204ENST00000526281 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
SYT12-204ENST00000526281 TOPBP1Q92547 1522 aa36.96■■■■□ 3.51
SYT12-204ENST00000526281 ABCC8Q09428 1581 aa36.93■■■■□ 3.5
SYT12-204ENST00000526281 IFT140Q96RY7 1462 aa36.88■■■■□ 3.49
SYT12-204ENST00000526281 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.87■■■■□ 3.49
SYT12-204ENST00000526281 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
SYT12-204ENST00000526281 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
SYT12-204ENST00000526281 OSCARQ8IYS5 282 aa36.66■■■■□ 3.46
SYT12-204ENST00000526281 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
SYT12-204ENST00000526281 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
SYT12-204ENST00000526281 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
SYT12-204ENST00000526281 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.48■■■■□ 3.43
SYT12-204ENST00000526281 CUX1P39880 1505 aa36.47■■■■□ 3.43
SYT12-204ENST00000526281 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.46■■■■□ 3.43
SYT12-204ENST00000526281 SOGA1O94964 1423 aa36.45■■■■□ 3.43
SYT12-204ENST00000526281 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.43■■■■□ 3.42
SYT12-204ENST00000526281 TRIM41Q8WV44 630 aa36.38■■■■□ 3.41
SYT12-204ENST00000526281 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
SYT12-204ENST00000526281 WDR97A6NE52 1622 aa36.28■■■■□ 3.4
SYT12-204ENST00000526281 CHD1O14646 1710 aa36.27■■■■□ 3.4
SYT12-204ENST00000526281 FBLN2P98095 1184 aa36.17■■■■□ 3.38
SYT12-204ENST00000526281 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.16■■■■□ 3.38
SYT12-204ENST00000526281 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.16■■■■□ 3.38
SYT12-204ENST00000526281 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.16■■■■□ 3.38
SYT12-204ENST00000526281 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.13■■■■□ 3.37
SYT12-204ENST00000526281 GRIN2BQ13224 1484 aa36.1■■■■□ 3.37
SYT12-204ENST00000526281 ARHGEF11O15085 1522 aa36.07■■■■□ 3.36
SYT12-204ENST00000526281 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
SYT12-204ENST00000526281 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.05■■■■□ 3.36
SYT12-204ENST00000526281 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.02■■■■□ 3.36
SYT12-204ENST00000526281 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.01■■■■□ 3.36
SYT12-204ENST00000526281 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.01■■■■□ 3.36
SYT12-204ENST00000526281 TOP2BQ02880 1626 aa36.01■■■■□ 3.35
SYT12-204ENST00000526281 PBRM1Q86U86 1689 aa36■■■■□ 3.35
SYT12-204ENST00000526281 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
SYT12-204ENST00000526281 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.97■■■■□ 3.35
SYT12-204ENST00000526281 SYNJ1O43426 1573 aa35.97■■■■□ 3.35
SYT12-204ENST00000526281 SYNJ2O15056 1496 aa35.93■■■■□ 3.34
SYT12-204ENST00000526281 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.84■■■■□ 3.33
SYT12-204ENST00000526281 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.78■■■■□ 3.32
SYT12-204ENST00000526281 ARAP1Q96P48 1450 aa35.73■■■■□ 3.31
SYT12-204ENST00000526281 ADAMTS12P58397 1594 aa35.67■■■■□ 3.3
SYT12-204ENST00000526281 GRIN2AQ12879 1464 aa35.63■■■■□ 3.29
SYT12-204ENST00000526281 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.61■■■■□ 3.29
SYT12-204ENST00000526281 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.57■■■■□ 3.29
SYT12-204ENST00000526281 NUP160Q12769 1436 aa35.49■■■■□ 3.27
SYT12-204ENST00000526281 CEP170Q5SW79 1584 aa35.48■■■■□ 3.27
SYT12-204ENST00000526281 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.31■■■■□ 3.24
SYT12-204ENST00000526281 KIF27Q86VH2 1401 aa35.31■■■■□ 3.24
SYT12-204ENST00000526281 SHROOM2Q13796 1616 aa35.3■■■■□ 3.24
SYT12-204ENST00000526281 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
SYT12-204ENST00000526281 IGF1RP08069 1367 aa35.23■■■■□ 3.23
SYT12-204ENST00000526281 CUL7Q14999 1698 aa35.19■■■■□ 3.22
SYT12-204ENST00000526281 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms