RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.35■■■■■ 5.97
ACER3-204ENST00000525861 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.58■■■■■ 4.89
ACER3-204ENST00000525861 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
ACER3-204ENST00000525861 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.3■■■■■ 4.52
ACER3-204ENST00000525861 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.15■■■■■ 4.5
ACER3-204ENST00000525861 ABCC9O60706 1549 aa42.95■■■■■ 4.47
ACER3-204ENST00000525861 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.8■■■■■ 4.44
ACER3-204ENST00000525861 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.73■■■■■ 4.43
ACER3-204ENST00000525861 NACADO15069 1562 aa42.41■■■■■ 4.38
ACER3-204ENST00000525861 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.01■■■■■ 4.32
ACER3-204ENST00000525861 SCRIBQ14160 1630 aa41.93■■■■■ 4.3
ACER3-204ENST00000525861 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
ACER3-204ENST00000525861 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.17■■■■■ 4.18
ACER3-204ENST00000525861 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.75■■■■■ 4.11
ACER3-204ENST00000525861 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
ACER3-204ENST00000525861 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.66■■■■■ 4.1
ACER3-204ENST00000525861 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.52■■■■■ 4.08
ACER3-204ENST00000525861 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.46■■■■■ 4.07
ACER3-204ENST00000525861 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
ACER3-204ENST00000525861 SMARCA4P51532 1647 aa40.21■■■■■ 4.03
ACER3-204ENST00000525861 WIZO95785 1651 aa40.13■■■■■ 4.01
ACER3-204ENST00000525861 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.73■■■■□ 3.95
ACER3-204ENST00000525861 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
ACER3-204ENST00000525861 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.59■■■■□ 3.93
ACER3-204ENST00000525861 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.52■■■■□ 3.92
ACER3-204ENST00000525861 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
ACER3-204ENST00000525861 SMARCA2P51531 1590 aa39.5■■■■□ 3.91
ACER3-204ENST00000525861 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.32■■■■□ 3.88
ACER3-204ENST00000525861 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
ACER3-204ENST00000525861 NCAPD3P42695 1498 aa39.15■■■■□ 3.86
ACER3-204ENST00000525861 HMGXB3Q12766 1538 aa39.12■■■■□ 3.85
ACER3-204ENST00000525861 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.88■■■■□ 3.81
ACER3-204ENST00000525861 TRIM41Q8WV44 630 aa38.78■■■■□ 3.8
ACER3-204ENST00000525861 ABCC8Q09428 1581 aa38.54■■■■□ 3.76
ACER3-204ENST00000525861 CFTRP13569 1480 aa38.33■■■■□ 3.73
ACER3-204ENST00000525861 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.29■■■■□ 3.72
ACER3-204ENST00000525861 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.16■■■■□ 3.7
ACER3-204ENST00000525861 PRDM2Q13029 1718 aa38.14■■■■□ 3.7
ACER3-204ENST00000525861 SYNJ1O43426 1573 aa38.12■■■■□ 3.69
ACER3-204ENST00000525861 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.07■■■■□ 3.68
ACER3-204ENST00000525861 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
ACER3-204ENST00000525861 TOP2BQ02880 1626 aa37.96■■■■□ 3.67
ACER3-204ENST00000525861 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.91■■■■□ 3.66
ACER3-204ENST00000525861 SOGA1O94964 1423 aa37.85■■■■□ 3.65
ACER3-204ENST00000525861 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.84■■■■□ 3.65
ACER3-204ENST00000525861 EEA1Q15075 1411 aa37.82■■■■□ 3.65
ACER3-204ENST00000525861 CUX1P39880 1505 aa37.82■■■■□ 3.64
ACER3-204ENST00000525861 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.79■■■■□ 3.64
ACER3-204ENST00000525861 NESP48681 1621 aa37.76■■■■□ 3.64
ACER3-204ENST00000525861 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.74■■■■□ 3.63
ACER3-204ENST00000525861 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.7■■■■□ 3.63
ACER3-204ENST00000525861 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.58■■■■□ 3.61
ACER3-204ENST00000525861 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.51■■■■□ 3.6
ACER3-204ENST00000525861 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.49■■■■□ 3.59
ACER3-204ENST00000525861 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.48■■■■□ 3.59
ACER3-204ENST00000525861 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.43■■■■□ 3.58
ACER3-204ENST00000525861 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.38■■■■□ 3.57
ACER3-204ENST00000525861 TOPBP1Q92547 1522 aa37.35■■■■□ 3.57
ACER3-204ENST00000525861 KIF21BO75037 1637 aa37.33■■■■□ 3.57
ACER3-204ENST00000525861 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.31■■■■□ 3.56
ACER3-204ENST00000525861 GOLGA3Q08378 1498 aa37.31■■■■□ 3.56
ACER3-204ENST00000525861 KIF27Q86VH2 1401 aa37.3■■■■□ 3.56
ACER3-204ENST00000525861 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
ACER3-204ENST00000525861 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.22■■■■□ 3.55
ACER3-204ENST00000525861 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
ACER3-204ENST00000525861 CUX2O14529 1486 aa37.16■■■■□ 3.54
ACER3-204ENST00000525861 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
ACER3-204ENST00000525861 PRXQ9BXM0 1461 aa37.1■■■■□ 3.53
ACER3-204ENST00000525861 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.08■■■■□ 3.53
ACER3-204ENST00000525861 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.06■■■■□ 3.52
ACER3-204ENST00000525861 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.06■■■■□ 3.52
ACER3-204ENST00000525861 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.05■■■■□ 3.52
ACER3-204ENST00000525861 CEP162Q5TB80 1403 aa37.04■■■■□ 3.52
ACER3-204ENST00000525861 MRC2Q9UBG0 1479 aa37■■■■□ 3.51
ACER3-204ENST00000525861 IGF1RP08069 1367 aa36.95■■■■□ 3.51
ACER3-204ENST00000525861 WDR97A6NE52 1622 aa36.93■■■■□ 3.5
ACER3-204ENST00000525861 WDR62O43379 1518 aa36.81■■■■□ 3.48
ACER3-204ENST00000525861 ERCC6Q03468 1493 aa36.81■■■■□ 3.48
ACER3-204ENST00000525861 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
ACER3-204ENST00000525861 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.77■■■■□ 3.48
ACER3-204ENST00000525861 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.75■■■■□ 3.47
ACER3-204ENST00000525861 CLIP1P30622 1438 aa36.71■■■■□ 3.47
ACER3-204ENST00000525861 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
ACER3-204ENST00000525861 CUL7Q14999 1698 aa36.66■■■■□ 3.46
ACER3-204ENST00000525861 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
ACER3-204ENST00000525861 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.65■■■■□ 3.46
ACER3-204ENST00000525861 IFT140Q96RY7 1462 aa36.57■■■■□ 3.45
ACER3-204ENST00000525861 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.49■■■■□ 3.43
ACER3-204ENST00000525861 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
ACER3-204ENST00000525861 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
ACER3-204ENST00000525861 PBRM1Q86U86 1689 aa36.44■■■■□ 3.42
ACER3-204ENST00000525861 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.42■■■■□ 3.42
ACER3-204ENST00000525861 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.422e-12■■■■■ 32.2
ACER3-204ENST00000525861 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
ACER3-204ENST00000525861 GRIN2BQ13224 1484 aa36.35■■■■□ 3.41
ACER3-204ENST00000525861 ARAP1Q96P48 1450 aa36.34■■■■□ 3.41
ACER3-204ENST00000525861 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.3■■■■□ 3.4
ACER3-204ENST00000525861 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.27■■■■□ 3.4
ACER3-204ENST00000525861 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.26■■■■□ 3.4
ACER3-204ENST00000525861 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
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