RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525786.1

CCDC82-204, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC82, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-204ENST00000525786 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.2■■■■■ 4.51
CCDC82-204ENST00000525786 ABCC9O60706 1549 aa40■■■■□ 3.99
CCDC82-204ENST00000525786 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.31■■■■□ 3.88
CCDC82-204ENST00000525786 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.12■■■■□ 3.69
CCDC82-204ENST00000525786 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.79■■■■□ 3.64
CCDC82-204ENST00000525786 NACADO15069 1562 aa37.28■■■■□ 3.56
CCDC82-204ENST00000525786 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37■■■■□ 3.51
CCDC82-204ENST00000525786 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.99■■■■□ 3.51
CCDC82-204ENST00000525786 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.76■■■■□ 3.48
CCDC82-204ENST00000525786 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.64■■■■□ 3.46
CCDC82-204ENST00000525786 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.46■■■■□ 3.43
CCDC82-204ENST00000525786 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.15■■■■□ 3.38
CCDC82-204ENST00000525786 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.15■■■■□ 3.38
CCDC82-204ENST00000525786 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.14■■■■□ 3.38
CCDC82-204ENST00000525786 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.87■■■■□ 3.33
CCDC82-204ENST00000525786 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
CCDC82-204ENST00000525786 SCRIBQ14160 1630 aa35.68■■■■□ 3.3
CCDC82-204ENST00000525786 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.67■■■■□ 3.3
CCDC82-204ENST00000525786 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
CCDC82-204ENST00000525786 CUX2O14529 1486 aa34.9■■■■□ 3.18
CCDC82-204ENST00000525786 ERCC6Q03468 1493 aa34.67■■■■□ 3.14
CCDC82-204ENST00000525786 NCAPD3P42695 1498 aa34.34■■■■□ 3.09
CCDC82-204ENST00000525786 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.12■■■■□ 3.05
CCDC82-204ENST00000525786 HMGXB3Q12766 1538 aa34.11■■■■□ 3.05
CCDC82-204ENST00000525786 NESP48681 1621 aa34.08■■■■□ 3.05
CCDC82-204ENST00000525786 SMARCA2P51531 1590 aa34.07■■■■□ 3.05
CCDC82-204ENST00000525786 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
CCDC82-204ENST00000525786 SMARCA4P51532 1647 aa33.96■■■■□ 3.03
CCDC82-204ENST00000525786 TRIM41Q8WV44 630 aa33.85■■■■□ 3.01
CCDC82-204ENST00000525786 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.83■■■■□ 3.01
CCDC82-204ENST00000525786 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
CCDC82-204ENST00000525786 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.77■■■■□ 3
CCDC82-204ENST00000525786 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
CCDC82-204ENST00000525786 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.62■■■□□ 2.97
CCDC82-204ENST00000525786 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.6■■■□□ 2.97
CCDC82-204ENST00000525786 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.37■■■□□ 2.93
CCDC82-204ENST00000525786 WDR62O43379 1518 aa33.34■■■□□ 2.93
CCDC82-204ENST00000525786 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.26■■■□□ 2.91
CCDC82-204ENST00000525786 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.24■■■□□ 2.91
CCDC82-204ENST00000525786 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.09■■■□□ 2.89
CCDC82-204ENST00000525786 OSCARQ8IYS5 282 aa33.05■■■□□ 2.88
CCDC82-204ENST00000525786 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.93■■■□□ 2.86
CCDC82-204ENST00000525786 WIZO95785 1651 aa32.88■■■□□ 2.85
CCDC82-204ENST00000525786 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.84■■■□□ 2.85
CCDC82-204ENST00000525786 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.84■■■□□ 2.85
CCDC82-204ENST00000525786 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.84■■■□□ 2.85
CCDC82-204ENST00000525786 CFTRP13569 1480 aa32.72■■■□□ 2.83
CCDC82-204ENST00000525786 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
CCDC82-204ENST00000525786 ARHGEF11O15085 1522 aa32.61■■■□□ 2.81
CCDC82-204ENST00000525786 PRDM2Q13029 1718 aa32.54■■■□□ 2.8
CCDC82-204ENST00000525786 IFT140Q96RY7 1462 aa32.43■■■□□ 2.78
CCDC82-204ENST00000525786 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
CCDC82-204ENST00000525786 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
CCDC82-204ENST00000525786 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.32■■■□□ 2.76
CCDC82-204ENST00000525786 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CCDC82-204ENST00000525786 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
CCDC82-204ENST00000525786 CHD1O14646 1710 aa32.27■■■□□ 2.76
CCDC82-204ENST00000525786 TOPBP1Q92547 1522 aa32.21■■■□□ 2.75
CCDC82-204ENST00000525786 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
CCDC82-204ENST00000525786 ARAP1Q96P48 1450 aa32.2■■■□□ 2.75
CCDC82-204ENST00000525786 ABCC8Q09428 1581 aa32.11■■■□□ 2.73
CCDC82-204ENST00000525786 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CCDC82-204ENST00000525786 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.07■■■□□ 2.72
CCDC82-204ENST00000525786 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
CCDC82-204ENST00000525786 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.99■■■□□ 2.71
CCDC82-204ENST00000525786 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.97■■■□□ 2.71
CCDC82-204ENST00000525786 FBLN2P98095 1184 aa31.96■■■□□ 2.71
CCDC82-204ENST00000525786 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
CCDC82-204ENST00000525786 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.8■■■□□ 2.68
CCDC82-204ENST00000525786 SYNJ1O43426 1573 aa31.76■■■□□ 2.67
CCDC82-204ENST00000525786 WDR97A6NE52 1622 aa31.72■■■□□ 2.67
CCDC82-204ENST00000525786 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.71■■■□□ 2.67
CCDC82-204ENST00000525786 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.66■■■□□ 2.66
CCDC82-204ENST00000525786 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CCDC82-204ENST00000525786 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
CCDC82-204ENST00000525786 SOGA1O94964 1423 aa31.61■■■□□ 2.65
CCDC82-204ENST00000525786 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CCDC82-204ENST00000525786 SYNJ2O15056 1496 aa31.51■■■□□ 2.63
CCDC82-204ENST00000525786 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.5■■■□□ 2.63
CCDC82-204ENST00000525786 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.5■■■□□ 2.63
CCDC82-204ENST00000525786 GRIN2BQ13224 1484 aa31.49■■■□□ 2.63
CCDC82-204ENST00000525786 PBRM1Q86U86 1689 aa31.44■■■□□ 2.62
CCDC82-204ENST00000525786 CUX1P39880 1505 aa31.31■■■□□ 2.6
CCDC82-204ENST00000525786 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.19■■■□□ 2.58
CCDC82-204ENST00000525786 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.19■■■□□ 2.58
CCDC82-204ENST00000525786 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.16■■■□□ 2.58
CCDC82-204ENST00000525786 CEP170Q5SW79 1584 aa31.11■■■□□ 2.57
CCDC82-204ENST00000525786 GRIN2AQ12879 1464 aa31.09■■■□□ 2.57
CCDC82-204ENST00000525786 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.08■■■□□ 2.57
CCDC82-204ENST00000525786 SHROOM2Q13796 1616 aa31.03■■■□□ 2.56
CCDC82-204ENST00000525786 ADAMTS12P58397 1594 aa31.02■■■□□ 2.56
CCDC82-204ENST00000525786 NUP160Q12769 1436 aa30.98■■■□□ 2.55
CCDC82-204ENST00000525786 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.81■■■□□ 2.52
CCDC82-204ENST00000525786 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
CCDC82-204ENST00000525786 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.78■■■□□ 2.52
CCDC82-204ENST00000525786 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.52
CCDC82-204ENST00000525786 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CCDC82-204ENST00000525786 KDM6BO15054 1643 aa30.75■■■□□ 2.51
CCDC82-204ENST00000525786 DIP2BQ9P265 1576 aa30.75■■■□□ 2.51
CCDC82-204ENST00000525786 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms