RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525699.5

FNTA-204, Transcript of farnesyltransferase, CAAX box, alpha, humanhuman

TSL 5

Gene FNTA, Length 516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTA-204ENST00000525699 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.51■■■■■ 7.76
FNTA-204ENST00000525699 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.7■■■■■ 6.67
FNTA-204ENST00000525699 ABCC9O60706 1549 aa55.86■■■■■ 6.53
FNTA-204ENST00000525699 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.54■■■■■ 6.16
FNTA-204ENST00000525699 NACADO15069 1562 aa53.36■■■■■ 6.13
FNTA-204ENST00000525699 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.28■■■■■ 6.12
FNTA-204ENST00000525699 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.84■■■■■ 6.05
FNTA-204ENST00000525699 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.83■■■■■ 6.05
FNTA-204ENST00000525699 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.49■■■■■ 5.99
FNTA-204ENST00000525699 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.41■■■■■ 5.98
FNTA-204ENST00000525699 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.1■■■■■ 5.93
FNTA-204ENST00000525699 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.91■■■■■ 5.9
FNTA-204ENST00000525699 SCRIBQ14160 1630 aa51.75■■■■■ 5.88
FNTA-204ENST00000525699 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.54■■■■■ 5.84
FNTA-204ENST00000525699 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.29■■■■■ 5.8
FNTA-204ENST00000525699 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.6■■■■■ 5.69
FNTA-204ENST00000525699 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.51■■■■■ 5.68
FNTA-204ENST00000525699 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.21■■■■■ 5.63
FNTA-204ENST00000525699 SMARCA4P51532 1647 aa49.42■■■■■ 5.5
FNTA-204ENST00000525699 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.28■■■■■ 5.48
FNTA-204ENST00000525699 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.19■■■■■ 5.47
FNTA-204ENST00000525699 NCAPD3P42695 1498 aa49.18■■■■■ 5.46
FNTA-204ENST00000525699 SMARCA2P51531 1590 aa49.15■■■■■ 5.46
FNTA-204ENST00000525699 HMGXB3Q12766 1538 aa48.97■■■■■ 5.43
FNTA-204ENST00000525699 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.96■■■■■ 5.43
FNTA-204ENST00000525699 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.88■■■■■ 5.42
FNTA-204ENST00000525699 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.81■■■■■ 5.4
FNTA-204ENST00000525699 WIZO95785 1651 aa48.47■■■■■ 5.35
FNTA-204ENST00000525699 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
FNTA-204ENST00000525699 NESP48681 1621 aa48.21■■■■■ 5.31
FNTA-204ENST00000525699 ERCC6Q03468 1493 aa48.2■■■■■ 5.31
FNTA-204ENST00000525699 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.03■■■■■ 5.28
FNTA-204ENST00000525699 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
FNTA-204ENST00000525699 CUX2O14529 1486 aa47.77■■■■■ 5.24
FNTA-204ENST00000525699 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.75■■■■■ 5.23
FNTA-204ENST00000525699 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.7■■■■■ 5.23
FNTA-204ENST00000525699 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.69■■■■■ 5.22
FNTA-204ENST00000525699 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
FNTA-204ENST00000525699 CFTRP13569 1480 aa47.39■■■■■ 5.18
FNTA-204ENST00000525699 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.3■■■■■ 5.16
FNTA-204ENST00000525699 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.26■■■■■ 5.16
FNTA-204ENST00000525699 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.26■■■■■ 5.16
FNTA-204ENST00000525699 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.25■■■■■ 5.15
FNTA-204ENST00000525699 PRDM2Q13029 1718 aa47.14■■■■■ 5.14
FNTA-204ENST00000525699 WDR62O43379 1518 aa47.1■■■■■ 5.13
FNTA-204ENST00000525699 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
FNTA-204ENST00000525699 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
FNTA-204ENST00000525699 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.71■■■■■ 5.07
FNTA-204ENST00000525699 TOPBP1Q92547 1522 aa46.45■■■■■ 5.03
FNTA-204ENST00000525699 ABCC8Q09428 1581 aa46.39■■■■■ 5.02
FNTA-204ENST00000525699 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.39■■■■■ 5.02
FNTA-204ENST00000525699 IFT140Q96RY7 1462 aa46.25■■■■■ 4.99
FNTA-204ENST00000525699 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
FNTA-204ENST00000525699 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
FNTA-204ENST00000525699 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
FNTA-204ENST00000525699 CUX1P39880 1505 aa45.97■■■■■ 4.95
FNTA-204ENST00000525699 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
FNTA-204ENST00000525699 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.88■■■■■ 4.94
FNTA-204ENST00000525699 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.85■■■■■ 4.93
FNTA-204ENST00000525699 SOGA1O94964 1423 aa45.82■■■■■ 4.93
FNTA-204ENST00000525699 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.77■■■■■ 4.929e-7■■■□□ 18.2
FNTA-204ENST00000525699 OSCARQ8IYS5 282 aa45.69■■■■■ 4.9
FNTA-204ENST00000525699 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
FNTA-204ENST00000525699 WDR97A6NE52 1622 aa45.59■■■■■ 4.89
FNTA-204ENST00000525699 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.52■■■■■ 4.88
FNTA-204ENST00000525699 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.49■■■■■ 4.87
FNTA-204ENST00000525699 CHD1O14646 1710 aa45.48■■■■■ 4.87
FNTA-204ENST00000525699 TOP2BQ02880 1626 aa45.47■■■■■ 4.87
FNTA-204ENST00000525699 SYNJ1O43426 1573 aa45.46■■■■■ 4.87
FNTA-204ENST00000525699 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.38■■■■■ 4.86
FNTA-204ENST00000525699 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.37■■■■■ 4.85
FNTA-204ENST00000525699 GRIN2BQ13224 1484 aa45.35■■■■■ 4.85
FNTA-204ENST00000525699 FBLN2P98095 1184 aa45.34■■■■■ 4.85
FNTA-204ENST00000525699 PBRM1Q86U86 1689 aa45.32■■■■■ 4.85
FNTA-204ENST00000525699 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.3■■■■■ 4.84
FNTA-204ENST00000525699 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.29■■■■■ 4.84
FNTA-204ENST00000525699 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
FNTA-204ENST00000525699 TRIM41Q8WV44 630 aa45.13■■■■■ 4.82
FNTA-204ENST00000525699 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.12■■■■■ 4.81
FNTA-204ENST00000525699 SYNJ2O15056 1496 aa45.1■■■■■ 4.81
FNTA-204ENST00000525699 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.09■■■■■ 4.81
FNTA-204ENST00000525699 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.09■■■■■ 4.81
FNTA-204ENST00000525699 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.09■■■■■ 4.81
FNTA-204ENST00000525699 ARHGEF11O15085 1522 aa45.01■■■■■ 4.8
FNTA-204ENST00000525699 ADAMTS12P58397 1594 aa44.9■■■■■ 4.78
FNTA-204ENST00000525699 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.89■■■■■ 4.78
FNTA-204ENST00000525699 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.85■■■■■ 4.77
FNTA-204ENST00000525699 GRIN2AQ12879 1464 aa44.77■■■■■ 4.76
FNTA-204ENST00000525699 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.75■■■■■ 4.75
FNTA-204ENST00000525699 ARAP1Q96P48 1450 aa44.62■■■■■ 4.73
FNTA-204ENST00000525699 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.6■■■■■ 4.73
FNTA-204ENST00000525699 KIF27Q86VH2 1401 aa44.59■■■■■ 4.73
FNTA-204ENST00000525699 CEP170Q5SW79 1584 aa44.59■■■■■ 4.73
FNTA-204ENST00000525699 NUP160Q12769 1436 aa44.55■■■■■ 4.72
FNTA-204ENST00000525699 CUL7Q14999 1698 aa44.42■■■■■ 4.7
FNTA-204ENST00000525699 IGF1RP08069 1367 aa44.4■■■■■ 4.7
FNTA-204ENST00000525699 SHROOM2Q13796 1616 aa44.3■■■■■ 4.68
FNTA-204ENST00000525699 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.27■■■■■ 4.68
FNTA-204ENST00000525699 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.25■■■■■ 4.67
FNTA-204ENST00000525699 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.17■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms