RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525485.5

NCAPD3-202, Transcript of non-SMC condensin II complex subunit D3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene NCAPD3, Length 555 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3-202ENST00000525485 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.29■■■■■ 6.44
NCAPD3-202ENST00000525485 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.48■■■■■ 5.51
NCAPD3-202ENST00000525485 ABCC9O60706 1549 aa48.93■■■■■ 5.42
NCAPD3-202ENST00000525485 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.86■■■■■ 5.09
NCAPD3-202ENST00000525485 NACADO15069 1562 aa46.67■■■■■ 5.06
NCAPD3-202ENST00000525485 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.33■■■■■ 5.01
NCAPD3-202ENST00000525485 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.23■■■■■ 4.99
NCAPD3-202ENST00000525485 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
NCAPD3-202ENST00000525485 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.77■■■■■ 4.92
NCAPD3-202ENST00000525485 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.77■■■■■ 4.92
NCAPD3-202ENST00000525485 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.59■■■■■ 4.89
NCAPD3-202ENST00000525485 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.5■■■■■ 4.87
NCAPD3-202ENST00000525485 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.45■■■■■ 4.87
NCAPD3-202ENST00000525485 SCRIBQ14160 1630 aa45.01■■■■■ 4.8
NCAPD3-202ENST00000525485 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45■■■■■ 4.79
NCAPD3-202ENST00000525485 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
NCAPD3-202ENST00000525485 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.28■■■■■ 4.68
NCAPD3-202ENST00000525485 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.08■■■■■ 4.65
NCAPD3-202ENST00000525485 NCAPD3P42695 1498 aa43.06■■■■■ 4.48
NCAPD3-202ENST00000525485 SMARCA4P51532 1647 aa43.04■■■■■ 4.48
NCAPD3-202ENST00000525485 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.97■■■■■ 4.47
NCAPD3-202ENST00000525485 SMARCA2P51531 1590 aa42.9■■■■■ 4.46
NCAPD3-202ENST00000525485 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
NCAPD3-202ENST00000525485 HMGXB3Q12766 1538 aa42.81■■■■■ 4.44
NCAPD3-202ENST00000525485 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.68■■■■■ 4.42
NCAPD3-202ENST00000525485 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.56■■■■■ 4.4
NCAPD3-202ENST00000525485 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
NCAPD3-202ENST00000525485 ERCC6Q03468 1493 aa42.24■■■■■ 4.35
NCAPD3-202ENST00000525485 NESP48681 1621 aa42.16■■■■■ 4.34
NCAPD3-202ENST00000525485 CUX2O14529 1486 aa42.1■■■■■ 4.33
NCAPD3-202ENST00000525485 WIZO95785 1651 aa42.06■■■■■ 4.32
NCAPD3-202ENST00000525485 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.03■■■■■ 4.32
NCAPD3-202ENST00000525485 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
NCAPD3-202ENST00000525485 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.76■■■■■ 4.28
NCAPD3-202ENST00000525485 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.76■■■■■ 4.27
NCAPD3-202ENST00000525485 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
NCAPD3-202ENST00000525485 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.67■■■■■ 4.26
NCAPD3-202ENST00000525485 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3-202ENST00000525485 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.53■■■■■ 4.24
NCAPD3-202ENST00000525485 CFTRP13569 1480 aa41.39■■■■■ 4.22
NCAPD3-202ENST00000525485 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.36■■■■■ 4.21
NCAPD3-202ENST00000525485 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.28■■■■■ 4.2
NCAPD3-202ENST00000525485 WDR62O43379 1518 aa41.26■■■■■ 4.2
NCAPD3-202ENST00000525485 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.26■■■■■ 4.2
NCAPD3-202ENST00000525485 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.11■■■■■ 4.17
NCAPD3-202ENST00000525485 PRDM2Q13029 1718 aa41.03■■■■■ 4.16
NCAPD3-202ENST00000525485 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
NCAPD3-202ENST00000525485 ABCC8Q09428 1581 aa40.53■■■■■ 4.08
NCAPD3-202ENST00000525485 TOPBP1Q92547 1522 aa40.53■■■■■ 4.08
NCAPD3-202ENST00000525485 IFT140Q96RY7 1462 aa40.45■■■■■ 4.07
NCAPD3-202ENST00000525485 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.44■■■■■ 4.06
NCAPD3-202ENST00000525485 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
NCAPD3-202ENST00000525485 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
NCAPD3-202ENST00000525485 OSCARQ8IYS5 282 aa40.19■■■■■ 4.02
NCAPD3-202ENST00000525485 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
NCAPD3-202ENST00000525485 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
NCAPD3-202ENST00000525485 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
NCAPD3-202ENST00000525485 CUX1P39880 1505 aa39.98■■■■□ 3.99
NCAPD3-202ENST00000525485 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
NCAPD3-202ENST00000525485 SOGA1O94964 1423 aa39.96■■■■□ 3.99
NCAPD3-202ENST00000525485 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.94■■■■□ 3.98
NCAPD3-202ENST00000525485 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.94■■■■□ 3.98
NCAPD3-202ENST00000525485 WDR97A6NE52 1622 aa39.86■■■■□ 3.97
NCAPD3-202ENST00000525485 TRIM41Q8WV44 630 aa39.79■■■■□ 3.96
NCAPD3-202ENST00000525485 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
NCAPD3-202ENST00000525485 CHD1O14646 1710 aa39.73■■■■□ 3.95
NCAPD3-202ENST00000525485 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
NCAPD3-202ENST00000525485 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
NCAPD3-202ENST00000525485 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
NCAPD3-202ENST00000525485 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.6■■■■□ 3.93
NCAPD3-202ENST00000525485 GRIN2BQ13224 1484 aa39.59■■■■□ 3.93
NCAPD3-202ENST00000525485 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
NCAPD3-202ENST00000525485 FBLN2P98095 1184 aa39.57■■■■□ 3.93
NCAPD3-202ENST00000525485 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.56■■■■□ 3.92
NCAPD3-202ENST00000525485 ARHGEF11O15085 1522 aa39.55■■■■□ 3.92
NCAPD3-202ENST00000525485 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.49■■■■□ 3.91
NCAPD3-202ENST00000525485 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.49■■■■□ 3.91
NCAPD3-202ENST00000525485 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.48■■■■□ 3.91
NCAPD3-202ENST00000525485 TOP2BQ02880 1626 aa39.48■■■■□ 3.91
NCAPD3-202ENST00000525485 PBRM1Q86U86 1689 aa39.45■■■■□ 3.91
NCAPD3-202ENST00000525485 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.45■■■■□ 3.91
NCAPD3-202ENST00000525485 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
NCAPD3-202ENST00000525485 SYNJ2O15056 1496 aa39.41■■■■□ 3.9
NCAPD3-202ENST00000525485 SYNJ1O43426 1573 aa39.41■■■■□ 3.9
NCAPD3-202ENST00000525485 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.32■■■■□ 3.89
NCAPD3-202ENST00000525485 ARAP1Q96P48 1450 aa39.19■■■■□ 3.86
NCAPD3-202ENST00000525485 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.17■■■■□ 3.86
NCAPD3-202ENST00000525485 ADAMTS12P58397 1594 aa39.12■■■■□ 3.85
NCAPD3-202ENST00000525485 GRIN2AQ12879 1464 aa39.08■■■■□ 3.85
NCAPD3-202ENST00000525485 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.08■■■■□ 3.85
NCAPD3-202ENST00000525485 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.03■■■■□ 3.84
NCAPD3-202ENST00000525485 NUP160Q12769 1436 aa38.95■■■■□ 3.83
NCAPD3-202ENST00000525485 CEP170Q5SW79 1584 aa38.9■■■■□ 3.82
NCAPD3-202ENST00000525485 SHROOM2Q13796 1616 aa38.74■■■■□ 3.79
NCAPD3-202ENST00000525485 KIF27Q86VH2 1401 aa38.72■■■■□ 3.79
NCAPD3-202ENST00000525485 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.67■■■■□ 3.78
NCAPD3-202ENST00000525485 IGF1RP08069 1367 aa38.64■■■■□ 3.78
NCAPD3-202ENST00000525485 CUL7Q14999 1698 aa38.59■■■■□ 3.77
NCAPD3-202ENST00000525485 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
NCAPD3-202ENST00000525485 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.55■■■■□ 3.76
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